Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_00683
Subject:
NM_001330541.2
Aligned Length:
531
Identities:
478
Gaps:
45

Alignment

Query   1  MRDSSAPSSASSSVTDLYCTPHSSRSDLVLPGTAGDFSLSASLSACTLLYEGAVEPMQIDVDPQEDPQNAPDVN  74
                                        .|.....|.|           .|||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  -----------------------------MPLPVQVFNL-----------QGAVEPMQIDVDPQEDPQNAPDVN  34

Query  75  YVVENPSLDLEQYAASYSGLMRIERLQFIADHCPTLRVEALKMALSFVQRTFNVDMYEEIHRKLSEAT----RE  144
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||
Sbjct  35  YVVENPSLDLEQYAASYSGLMRIERLQFIADHCPTLRVEALKMALSFVQRTFNVDMYEEIHRKLSEATRSSLRE  108

Query 145  LQNAPDAIPESGVEPPALDTAWVEATRKKALLKLEKLDTDLKNYKGNSIKESIRRGHDDLGDHYLDCGDLSNAL  218
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 109  LQNAPDAIPESGVEPPALDTAWVEATRKKALLKLEKLDTDLKNYKGNSIKESIRRGHDDLGDHYLDCGDLSNAL  182

Query 219  KCYSRARDYCTSAKHVINMCLNVIKVSVYLQNWSHVLSYVSKAESTPEIAEQRGERDSQTQAILTKLKCAAGLA  292
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 183  KCYSRARDYCTSAKHVINMCLNVIKVSVYLQNWSHVLSYVSKAESTPEIAE-RGERDSQTQAILTKLKCAAGLA  255

Query 293  ELAARKYKQAAKCLLLASFDHCDFPELLSPSNVAIYGGLCALATFDRQELQRNVISSSSFKLFLELEPQVRDII  366
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 256  ELAARKYKQAAKCLLLASFDHCDFPELLSPSNVAIYGGLCALATFDRQELQRNVISSSSFKLFLELEPQVRDII  329

Query 367  FKFYESKYASCLKMLDEMKDNLLLDMYLAPHVRTLYTQIRNRALIQYFSPYVSADMHRMAAAFNTTVAALEDEL  440
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 330  FKFYESKYASCLKMLDEMKDNLLLDMYLAPHVRTLYTQIRNRALIQYFSPYVSADMHRMAAAFNTTVAALEDEL  403

Query 441  TQLILEGLISARVDSHSKILYARDVDQRSTTFEKSLLMGKEFQRRAKAMMLRAAVLRNQIHVKSPPREGSQGEL  514
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 404  TQLILEGLISARVDSHSKILYARDVDQRSTTFEKSLLMGKEFQRRAKAMMLRAAVLRNQIHVKSPPREGSQGEL  477

Query 515  TPANSQSRMSTNM  527
           |||||||||||||
Sbjct 478  TPANSQSRMSTNM  490