Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00684
• Subject: XM_006533785.2
• Aligned Length: 1132
• Identities: 891
• Gaps: 155

Alignment

Query    1  ATGCCCGCACTCCTGGAGCGCCCCAAGCTTTCCAACGCCATGGCCAGGGCGCTGCACCGGCACATTATGATGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGCCCGCACTCCTGGAGCGCCCCAAGCTTTCCAACGCTATGGCCAGGGCTCTGCACCGGCACATCATGATGGA  74

Query   75  GCGGGAGCGCAAGCGGCAGGAGGAAGAAGAGGTGGATAAGATGATGGAACAGAAGATGAAGGAAGAACAGGAGA  148
            ||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct   75  GCGGGAGCGCAAACGGCAGGAGGAGGAAGAGGTGGACAAGATGATGGAACAGAAGATGAAAGAAGAGCAGGAGA  148

Query  149  GAAGGAAGAAAAAGGAGATGGAAGAGAGAATGTCATTAGAGGAGACCAAGGAACAAATTCTGAAGTTGGAGGAG  222
            ||||.|||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||.||||||.||.|||||
Sbjct  149  GAAGAAAGAAAAAGGAAATGGAAGAGAGAATGTCACTAGAGGAGACCAAGGAACAGATCCTGAAGCTGCAGGAG  222

Query  223  AAGCTTTTGGCTCTACAGGAAGAGAAGCACCAGCTTTTCCTGCAGCTCAAGAAAGTTTTACATGAGGAAGAAAA  296
            |||||||..|||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  223  AAGCTTTCTGCTCTACAGGAGGAGAAGCACCAGCTTTTCTTGCAGCTCAAGAAAGTTTTGCATGAGGAAGAAAA  296

Query  297  ACGGAGGCGAAAGGAACAGAGTGACCTGACCACCCTAACATCAGCTGCATACCAGCAGAGCCTGACTGTTCACA  370
            |||||||||||||||||||||||||.|.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct  297  ACGGAGGCGAAAGGAACAGAGTGACTTAACCACTCTGACATCAGCTGCATACCAGCAGAGCCTGACGGTTCATA  370

Query  371  CAGGAACTCATCTCCTCAGCATGCAGGGGAGCCCTGGAGGACACAATCGCCCAGGCACCCTCATGGCAGCTGAC  444
            |||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||
Sbjct  371  CAGGAACCCACCTCCTCAGCATGCAGGGGAGCCCTGGAGGACACAATCGCCCAGGTACTCTGATGGCAGCTGAC  444

Query  445  AGAGCCAAACAAATGTTTGGACCCCAAGTGCTTACGACCCGGCACTACGTGGGCTCAGCAGCTGCTTTTGCAGG  518
            ||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGAGCCAAGCAGATGTTTGGACCACAAGTGCTTACGACCCGGCACTACGTGGGATCAGCAGCTGCTTTTGCAGG  518

Query  519  GACACCAGAGCATGGACAATTCCAAGGCAGTCCTGGTGGTGCCTATGGGACTGCTCAGCCCCCACCTCACTATG  592
            .||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  519  AACCCCAGAACATGGACAATTCCAAGGCAGTCCAGGGGGTGCTTATGGGACTGCTCAGCCCCCACCTCATTATG  592

Query  593  GGCCCACACAGCCAGCTTATAGTCCTAGTCAGCAGCTCAGAGCTCCTTCGGCATTCCCTGCAGTGCAGTACCTA  666
            ||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGCCAACACAACCAGCCTATAGTCCTAGCCAGCAGCTCAGAGCCCCATCAGCATTTCCTGCAGTGCAGTACCTA  666

Query  667  TCTCAGCCACAGCCACAGCCCTATGCTGTGCATGGCCACTTTCAGCCCACTCAGACAGGTTTCCTCCAGCCTGG  740
            |||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct  667  TCTCAGCCACAGCCACAACCCTATGCAGTGCATGGCCACTTTCAGCCCACTCAGACAGGGTTCCTCCAGCCCGG  740

Query  741  TGGTGCCCTGTCCTTGCAAAAGCAGATGGAACATGCTAACCAGCAGACTGGCTTCTCCGACTCATCCTCTCTGC  814
            ..||.||||.||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||..|||||||.||||||||.|||||||
Sbjct  741  CAGTACCCTCTCTTTGCAGAAACAGATGGAGCATGCCAACCAGCAGACCAGCTTCTCGGACTCATCTTCTCTGC  814

Query  815  GCCCCATGCACCCCCAGGCTCTGCATCCAGCCCCTGGACTCCTTGCTTCCCCCCAGCTCCCTGTGCAGATGCAG  888
            |.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.||.
Sbjct  815  GGCCCATGCACCCCCAAGCTCTGCATCCAGCCCCTGGACTCCTGGCTTCCCCCCAGCTTCCCGTACAGATACAA  888

Query  889  CCAGCAGGAAAGTCGGGCTTTGCAGCTACCAGCCAACCTGGCCCTCGGCTCCCCTTCATCCAACACAGCCAGAA  962
            .|||||||.||    ||||||||..|.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCAGCAGGGAA----GGCTTTGCCACCACCAGCCAACCTGGCCCCCGACTCCCTTTCATCCAACACAGCCAGAA  958

Query  963  CCCGCGATTCTACCACAAG-------------------------------------------------------  981
            |||..|||||||.||||||                                                       
Sbjct  959  CCCAAGATTCTATCACAAGTAACCACCAGAGAGCTCCAGCCCACCCTCCATCCCTCAGGCTGGGGTCTTATGTG  1032

Query  982  --------------------------------------------------------------------------  981
                                                                                      
Sbjct 1033  CCCCAAACCAATAAAATGTACAAAATGTACCCACCATCATGCCTGAGTGCTGTTTATTTGCTTCCTATCCAACT  1106

Query  982  ----------------------  981
                                  
Sbjct 1107  GCCTAAACCACAAAGGCTACTA  1128