Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_00735
- Subject:
- NM_002113.2
- Aligned Length:
- 991
- Identities:
- 750
- Gaps:
- 182
Alignment
Query 1 ATGTGGCTCCTGGTCAGTGTAATTCTAATCTCACGGATATCCTCTGTTGGGGGAGAAGCAATGTTCTGTGATTT 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||.||||||||
Sbjct 1 ATGTGGCTCCTGGTCAGTGTAATTCTAATCTCACGGATATCCTCTGTTGGGGGAGAAGCAACATTTTGTGATTT 74
Query 75 TCCAAAAATAAACCATGGAATTCTATATGATGAAGAAAAATATAAGCCATTTTCCCAAGTTCCTACAGGGGAAG 148
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 75 TCCAAAAATAAACCATGGAATTCTATATGATGAAGAAAAATATAAGCCATTTTCCCAGGTTCCTACAGGGGAAG 148
Query 149 TTTTCTATTACTCCTGTGAATATAATTTTGTGTCTCCTTCAAAATCCTTTTGGACTCGCATAACGTGCGCAGAA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||.|||||
Sbjct 149 TTTTCTATTACTCCTGTGAATATAATTTTGTGTCTCCTTCAAAATCATTTTGGACTCGCATAACATGCACAGAA 222
Query 223 GAAGGATGGTCACCAACACCAAAGTGTCTCAGACTGTGTTTCTTTCCTTTTGTGGAAAATGGTCATTCTGAATC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAAGGATGGTCACCAACACCAAAGTGTCTCAGACTGTGTTTCTTTCCTTTTGTGGAAAATGGTCATTCTGAATC 296
Query 297 TTCAGGACAAACACATCTGGAAGGTGATACTGTACAAATTATTTGCAACACAGGATACAGACTTCAAAACAATG 370
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TTCAGGACAAACACATCTGGAAGGTGATACTGTGCAAATTATTTGCAACACAGGATACAGACTTCAAAACAATG 370
Query 371 AGAACAACATTTCATGTGTAGAACGGGGCTGGTCCACTCCTCCCAAATGCAGGTCCACT--------------- 429
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGAACAACATTTCATGTGTAGAACGGGGCTGGTCCACCCCTCCCAAATGCAGGTCCACTGACACTTCCTGTGTG 444
Query 430 -AT----------------------------------------------------------------------- 431
||
Sbjct 445 AATCCGCCCACAGTACAAAATGCTCATATACTGTCGAGACAGATGAGTAAATATCCATCTGGTGAGAGAGTACG 518
Query 432 -------------------------------------------------------------------------- 431
Sbjct 519 TTATGAATGTAGGAGCCCTTATGAAATGTTTGGGGATGAAGAAGTGATGTGTTTAAATGGAAACTGGACAGAAC 592
Query 432 ----------------TTCTGCAGAAAAATGTGGGCCCCCTCCACCTATTGACAATGGAGACATTACTTCATTC 489
||||.|.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 593 CACCTCAATGCAAAGATTCTACGGGAAAATGTGGGCCCCCTCCACCTATTGACAATGGGGACATTACTTCATTC 666
Query 490 CTGTTGTCAGTATATGCTCCAGGTTCATCAGTTGAGTACCAGTGCCAGAACTTGTATCAACTTGAGGGTAACAA 563
|.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CCGTTGTCAGTATATGCTCCAGCTTCATCAGTTGAGTACCAATGCCAGAACTTGTATCAACTTGAGGGTAACAA 740
Query 564 TCAAATAACATGTAGAAACGGACAATGGTCAGAACCACCAAAATGCTTAGATCCATGTGTAATATCACAAGAAA 637
.|.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||.|.|||||
Sbjct 741 GCGAATAACATGTAGAAATGGACAATGGTCAGAACCACCAAAATGCTTACATCCGTGTGTAATATCCCGAGAAA 814
Query 638 TTATGGAAAAATATAACATAAAATTAAAGTGGACAAACCAACAAAAGCTTTATTCAAGAACAGGTGACAT-AGT 710
||||||||||.|||||||||..|||||.|||||||..|.||||.||||||||||..||||||||||| || ||.
Sbjct 815 TTATGGAAAATTATAACATAGCATTAAGGTGGACAGCCAAACAGAAGCTTTATTTGAGAACAGGTGA-ATCAGC 887
Query 711 TGAATTTGTTTGTAAATCTGGATATCATC---CAACAAAATCTCATTCATTTCGAGCAATGTGTCAGAATGGGA 781
|||||||||.||||||...|||||||.|| ||.||...|||||..||||.|||.|||..|||..|.||||||
Sbjct 888 TGAATTTGTGTGTAAACGGGGATATCGTCTTTCATCACGTTCTCACACATTGCGAACAACATGTTGGGATGGGA 961
Query 782 AACTGGTATATCCCAGTTGTGAAGAAAAA 810
||||||..|||||.|.|||||.|.|||.|
Sbjct 962 AACTGGAGTATCCAACTTGTGCAAAAAGA 990