Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_00739
- Subject:
- XM_006538448.1
- Aligned Length:
- 2235
- Identities:
- 1791
- Gaps:
- 195
Alignment
Query 1 ATGGACGGCTCCTTCGTCCAGCACAGTGTGAGGGTTCTGCAGGAGCTCAACAAGCAGCGGGAGAAGGGCCAGTA 74
||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGACGGTTCCTTCGTGCAGCACAGCGTGAGGGTTCTGCAGGAACTCAACAAGCAGCGCGAGAAGGGCCAGTA 74
Query 75 CTGCGACGCCACTCTGGACGTGGGGGGCCTGGTGTTTAAGGCACACTGGAGTGTCCTTGCCTGCTGCAGTCACT 148
.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||.|||||.||.|
Sbjct 75 TTGCGACGCCACACTGGACGTGGGGGGCCTGGTGTTCAAGGCGCACTGGAGTGTCCTGGCGTGTTGCAGCCATT 148
Query 149 TTTTCCAGAGCCTCTACGGGGATGGCTCAGGGGGCAGTGTCGTCCTCCCTGCTGGCTTCGCTGAGATCTTTGGC 222
|.||||||||..||||||||||||||.||||||||||.||.||||||||.||.|||||.||||||||.||||||
Sbjct 149 TCTTCCAGAGAATCTACGGGGATGGCACAGGGGGCAGCGTTGTCCTCCCAGCGGGCTTTGCTGAGATTTTTGGC 222
Query 223 CTCTTGTTGGACTTTTTCTACACTGGTCACCTCGCTCTCACCTCAGGGAACCGGGATCAGGTGCTCCTGGCAGC 296
|||.||.|||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||.||||||||||.|||.|||||||
Sbjct 223 CTCCTGCTGGACTTTTTCTACACTGGCCACCTCGCCCTCACCTCAGGGAACAGGGATCAGGTACTCTTGGCAGC 296
Query 297 CAGGGAGTTGCGAGTGCCAGAGGCCGTAGAGCTGTGCCAGAGCTTCAAGCCCAAAACTTCAGTGGGACAGGCAG 370
||..||||||.|.|||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||.|||||.||||.|||||||||||||||
Sbjct 297 CAAAGAGTTGAGGGTGCCTGAGGCTGTGGAGCTATGTCAGAGCTTCCAGCCCCAAACCTCAGTGGGACAGGCA- 369
Query 371 CAGGTGGCCAGAGTGGGCTGGGGCCCCCTGCCTCCCAGAATGTGAACAGCCACGTCAAGGAGCCGGCAGGCTTG 444
||||||||.|||||.|..||||||||||||.|.|||||.||||||.|.|||||||||.|||.||||
Sbjct 370 --------CAGAGTGGACTGGGTCAACCTGCCTCCCAGGACGTGAAAAGCCACCTGAAGGAGCCGACAGACTTG 435
Query 445 GAAGAAGAGGAAGTTTCGAGGACTCTGGGTCTAGTCCCCAGGGATCAGGAGCCCAGAGGCAGTCATAGTCCTCA 518
||.||.||||||||||..|||||||||.|.||.|.|.||..|||||||||||||||||.|| ||.|
Sbjct 436 GATGAGGAGGAAGTTTTCAGGACTCTGAGCCTGGCCTCCGTGGATCAGGAGCCCAGAGACA---------CTGA 500
Query 519 GAGGCCCCAGCTCCATTCCCCAGCTCAGAGTGAGGGCCCC---TCCTCCCTCTGTGGGAAACTGAAGCAGGCCT 589
|..|||||||||...|.|.||.||||||| ||.|| .|||.|||||||||||||||.|.||||||.|
Sbjct 501 GCAGCCCCAGCTGGGTACACCTGCTCAGA------GCACCACGGCCTTCCTCTGTGGGAAACTCACGCAGGCTT 568
Query 590 TGAAGCCTTGTCCCCTTGAGGACAAGAAACCCGAGGACTGCAAAGTGCCCCCAAGGCCCTTAGAGGCTGAAGGT 663
|||||||||.||||...||||||||..|..|.|||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||.||||
Sbjct 569 TGAAGCCTTCTCCCTCAGAGGACAAAGAGTCTGAGGACTGCAAAGAGCCCCCAAGGCCCTTCGAGGCTGGAGGT 642
Query 664 GCCCAGCTGCAGGGCGGCAGTAATGAGTGGGAAGTGGTGGTTCAAGTGGAGGATGATGGGGATGGCGATTACAT 737
||||.|||||||||||..||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||..||||.||.||||||.|
Sbjct 643 GCCCCGCTGCAGGGCGAGAGCAATGAGTGGGAAGTGGTGGTCCAAGTGGAGGACGACAGGGACGGTGATTACGT 716
Query 738 GTCTGAGCCTGAGGCTGTGCTGACCAGGAGGAAGTCAAATGTAATCCGAAAGCCCTGTGCAGCTGAGCCAGCCC 811
.||||||||||||.|||||||.|||||.|||||||||||.||.||..||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 717 ATCTGAGCCTGAGACTGTGCTAACCAGAAGGAAGTCAAAAGTGATTAGAAAACCCTGTGCAGCCGAGCCAGCCC 790
Query 812 TGAGCGCGGGCTCCCTAGCAGCTGAGCCTGCTGAGAACAGAAAAGGTACAGCGGTGCCGGTCGAATGCCCCACA 885
||.|.|||||.||.||..||||.|||||..||||.|.||||||||||.||||.||.|||||||||||.||||||
Sbjct 791 TGGGTGCGGGTTCTCTCACAGCCGAGCCCACTGACAGCAGAAAAGGTGCAGCCGTTCCGGTCGAATGTCCCACA 864
Query 886 TGTCATAAAAAGTTCCTCAGCAAATATTATCTAAAAGTCCACAACAGGAAACATACTGGGGAGAAACCCTTTGA 959
|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 865 TGTCACAAAAAGTTCCTCAGCAAATATTACCTGAAAGTCCACAACAGGAAACACACTGGGGAGAAACCCTTCGA 938
Query 960 GTGTCCCAAATGTGGGAAGTGTTACTTTCGGAAGGAGAACCTCCTGGAGCATGAAGCCCGGAATTGCATGAACC 1033
|||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||.||||.|||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 939 GTGTCCCAAATGTGGGAAGTGTTACTTCCGCAAGGAGAATCTCTTGGAACATGAAGCCAGGAATTGCATGAACC 1012
Query 1034 GCTCGGAACAGGTCTTCACGTGCTCTGTGTGCCAGGAGACATTCCGCCGAAGGATGGAGCTGCGGGTGCACATG 1107
||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||||||||..||||||||
Sbjct 1013 GCTCAGAACAGGTCTTCACATGCTCCGTATGCCAGGAGACCTTCCGACGGAGGATGGAGCTGCGCTTGCACATG 1086
Query 1108 GTGTCTCACACAGGGGAGATGCCCTACAAGTGTTCCTCCTGCTCCCAGCAGTTCATGCAGAAGAAGGACTTGCA 1181
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1087 GTGTCTCACACAGGGGAGATGCCCTACAAGTGTTCCTCCTGCTCCCAGCAGTTCATGCAGAAGAAAGACTTGCA 1160
Query 1182 GAGCCACATGATCAAACTTCATGGAGCCCCCAAGCCCCATGCA------------------------------- 1224
|||||||||||||||.||.||.||||||||.||.|||||.|||
Sbjct 1161 GAGCCACATGATCAAGCTGCACGGAGCCCCTAAACCCCACGCAGTAAGTGCCAGTCAGGGCTGGGGTTCCGGTG 1234
Query 1225 -------------------------------------------------------------------TGCCCCA 1231
|||||||
Sbjct 1235 GCTCTGGGACAGCTCAATCCTGTCCTCACCTGGATGTGCTCCCTCTGCCTGTCTCACCCACCTGCAGTGCCCCA 1308
Query 1232 CCTGTGCCAAGTGCTTCCTGTCTCGGACAGAGCTGCAGCTGCATGAAGCTTTCAAGCACCGTGGTGAGAAGCTG 1305
|.|||||||||||||||||||||.||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.|||||.
Sbjct 1309 CTTGTGCCAAGTGCTTCCTGTCTAGGACGGAGCTACAGCTGCACGAGGCTTTTAAGCATCGTGGAGAAAAGCTC 1382
Query 1306 TTTGTGTGTGAGGAGTGTGGGCACCGGGCCTCGAGCCGGAATGGCCTGCAGATGCACATCAAGGCCAAGCACAG 1379
||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1383 TTTGTGTGTGAGGAATGCGGGCACCGGGCCTCGAGCCGCAACGGACTGCAGATGCACATCAAGGCCAAGCACAG 1456
Query 1380 GAATGAGAGGCCACACGTATGTGAGTTCTGCAGCCACGCCTTCACCCAAAAGGCCAATCTCAACATGCACCTGC 1453
||||||.|||||..|.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1457 GAATGAAAGGCCTTATGTCTGTGAGTTCTGCAGCCATGCCTTCACCCAGAAGGCCAACCTCAACATGCACCTGC 1530
Query 1454 GCACACACACGGGTGAGAAGCCCTTCCAGTGCCACCTCTGTGGCAAGACCTTCCGAACCCAAG----------- 1516
||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 1531 GCACACACACCGGCGAGAAGCCTTTCCAGTGCCACCTCTGTGGGAAGACCTTCCGCACCCAAGGTGAGGCAGGC 1604
Query 1517 CCAGCC-----------------------------------------------------------TGGACAAGC 1531
|||||| |||||||||
Sbjct 1605 CCAGCCCCTCCTTGCCCCAGGGCTGAGACAGCCACTGAGTTCCACCTTGTCCCCCATAGCCAGTTTGGACAAGC 1678
Query 1532 ACAACCGCACCCACACCGGGGAAAGGCCCTTCAGTTGCGAGTTCTGTGAACAGCGCTTCACTGAGAAGGGGCCC 1605
||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1679 ACAACCGCACCCACACGGGCGAGAGGCCTTTCAGCTGTGAATTCTGTGAGCAGCGCTTCACTGAGAAGGGCCCC 1752
Query 1606 CTCCTGAGGCACGTGGCCAGCCGCCATCAGGAGGGCCGGCCCCACTTCTGCCAGATATGCGGCAAGACCTTCAA 1679
||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1753 CTTCTGAGGCATGTGGCCAGCCGCCATCAAGAGGGCAGGCCCCACTTCTGCCAGATCTGTGGCAAGACCTTCAA 1826
Query 1680 AGCCGTGGAGCAACTGCGTGTGCACGTCAGACGGCACAAGGGGGTGAGGAAGTTTGAGTGCACCGAGTGTGGCT 1753
|||.|||||.||..|.||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1827 AGCTGTGGAACAGTTACGAGTGCACGTCAGGCGACACAAAGGTGTGAGAAAGTTCGAGTGCACCGAGTGTGGCT 1900
Query 1754 ACAAGTTTACCCGACAGGCCCACCTGCGGAGGCACATGGAGATCCACGACCGGGTAGAGAACTACAACCCGCGG 1827
|||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.|||||||||||.||.|||
Sbjct 1901 ACAAGTTCACGCGGCAGGCTCACCTGCGGAGGCACATGGAGATCCACGACAGAGTGGAGAACTACAATCCCCGG 1974
Query 1828 CAGCGCAAGCTCCGCAACCTGATCATCGAGGACGAGAAGATGGTGGTGGTGGCGCTGCAGCCGCCTGCAGAGCT 1901
||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.||
Sbjct 1975 CAGCGCAAGCTCCGGAACCTCATCATTGAGGATGAGAAGATGGTGGTCGTGGCTCTCCAGCCCCCTGCAGACCT 2048
Query 1902 GGAGGTGGGCTCGGCGGAGGTCATTGTGGAGTCCCTGGCCCAGGGCGGCCTGGCCTCCCAGCTCCCCGGCCAGA 1975
||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||.|||||||.|||||.||||||||.|||||..||||||
Sbjct 2049 GGAGGTGGGCTCTGCTGAGGTCATTGTGGAGTCCCTGACCCAGGGTGGCCTTGCCTCCCAACTCCCTAGCCAGA 2122
Query 1976 GACTGTGTGCAGAGGAGAGCTTCACCGGCCCAGGTGTCCTGGAGCCCTCCCTCATCATCACAGCTGCTGTCCCC 2049
||||||||.|||||||||||||..|..||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 2123 GACTGTGTTCAGAGGAGAGCTTTGCTAGCCCTGGCGTCCTGGAGCCCTCTCTCATCATCACCGCTGCTGTTCCC 2196
Query 2050 GAGGACTGTGACACA 2064
||||||||||||||.
Sbjct 2197 GAGGACTGTGACACG 2211