Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_00760
- Subject:
- NM_001202233.1
- Aligned Length:
- 1833
- Identities:
- 1794
- Gaps:
- 39
Alignment
Query 1 ---------------------------------------ATGCCCTGTATCCAAGCCCAATATGGGACACCAGC 35
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTGGTTGGCCAAGGCCTGTTGGTCCATCCAGAGTGAGATGCCCTGTATCCAAGCCCAATATGGGACACCAGC 74
Query 36 ACCGAGTCCGGGACCCCGTGACCACCTGGCAAGCGACCCCCTGACCCCTGAGTTCATCAAGCCCACCATGGACC 109
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 ACCGAGTCCGGGACCCCGTGACCACCTGGCAAGCGACCCCCTGACCCCTGAGTTCATCAAGCCCACCATGGACC 148
Query 110 TGGCCAGCCCCGAGGCAGCCCCCGCTGCCCCCACTGCCCTGCCCAGCTTCAGCACCTTCATGGACGGCTACACA 183
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGGCCAGCCCCGAGGCAGCCCCCGCTGCCCCCACTGCCCTGCCCAGCTTCAGCACCTTCATGGACGGCTACACA 222
Query 184 GGAGAGTTTGACACCTTCCTCTACCAGCTGCCAGGAACAGTCCAGCCATGCTCCTCAGCCTCCTCCTCGGCCTC 257
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GGAGAGTTTGACACCTTCCTCTACCAGCTGCCAGGAACAGTCCAGCCATGCTCCTCAGCCTCCTCCTCGGCCTC 296
Query 258 CTCCACATCCTCGTCCTCAGCCACCTCCCCTGCCTCTGCCTCCTTCAAGTTCGAGGACTTCCAGGTGTACGGCT 331
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CTCCACATCCTCGTCCTCAGCCACCTCCCCTGCCTCTGCCTCCTTCAAGTTCGAGGACTTCCAGGTGTACGGCT 370
Query 332 GCTACCCCGGCCCCCTGAGCGGCCCAGTGGATGAGGCCCTGTCCTCCAGTGGCTCTGACTACTATGGCAGCCCC 405
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GCTACCCCGGCCCCCTGAGCGGCCCAGTGGATGAGGCCCTGTCCTCCAGTGGCTCTGACTACTATGGCAGCCCC 444
Query 406 TGCTCGGCCCCGTCGCCCTCCACGCCCAGCTTCCAGCCGCCCCAGCTCTCTCCCTGGGATGGCTCCTTCGGCCA 479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TGCTCGGCCCCGTCGCCCTCCACGCCCAGCTTCCAGCCGCCCCAGCTCTCTCCCTGGGATGGCTCCTTCGGCCA 518
Query 480 CTTCTCGCCCAGCCAGACTTACGAAGGCCTGCGGGCATGGACAGAGCAGCTGCCCAAAGCCTCTGGGCCCCCAC 553
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CTTCTCGCCCAGCCAGACTTACGAAGGCCTGCGGGCATGGACAGAGCAGCTGCCCAAAGCCTCTGGGCCCCCAC 592
Query 554 AGCCTCCAGCCTTCTTTTCCTTCAGTCCTCCCACCGGCCCCAGCCCCAGCCTGGCCCAGAGCCCCCTGAAGTTG 627
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGCCTCCAGCCTTCTTTTCCTTCAGTCCTCCCACCGGCCCCAGCCCCAGCCTGGCCCAGAGCCCCCTGAAGTTG 666
Query 628 TTCCCCTCACAGGCCACCCACCAGCTGGGGGAGGGAGAGAGCTATTCCATGCCTACGGCCTTCCCAGGTTTGGC 701
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TTCCCCTCACAGGCCACCCACCAGCTGGGGGAGGGAGAGAGCTATTCCATGCCTACGGCCTTCCCAGGTTTGGC 740
Query 702 ACCCACTTCTCCACACCTTGAGGGCTCGGGGATACTGGATACACCCGTGACCTCAACCAAGGCCCGGAGCGGGG 775
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ACCCACTTCTCCACACCTTGAGGGCTCGGGGATACTGGATACACCCGTGACCTCAACCAAGGCCCGGAGCGGGG 814
Query 776 CCCCAGGTGGAAGTGAAGGCCGCTGTGCTGTGTGTGGGGACAACGCTTCATGCCAGCATTATGGTGTCCGCACA 849
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CCCCAGGTGGAAGTGAAGGCCGCTGTGCTGTGTGTGGGGACAACGCTTCATGCCAGCATTATGGTGTCCGCACA 888
Query 850 TGTGAGGGCTGCAAGGGCTTCTTCAAGCGCACAGTGCAGAAAAACGCCAAGTACATCTGCCTGGCTAACAAGGA 923
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TGTGAGGGCTGCAAGGGCTTCTTCAAGCGCACAGTGCAGAAAAACGCCAAGTACATCTGCCTGGCTAACAAGGA 962
Query 924 CTGCCCTGTGGACAAGAGGCGGCGAAACCGCTGCCAGTTCTGCCGCTTCCAGAAGTGCCTGGCGGTGGGCATGG 997
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CTGCCCTGTGGACAAGAGGCGGCGAAACCGCTGCCAGTTCTGCCGCTTCCAGAAGTGCCTGGCGGTGGGCATGG 1036
Query 998 TGAAGGAAGTTGTCCGAACAGACAGCCTGAAGGGGCGGCGGGGCCGGCTACCTTCAAAACCCAAGCAGCCCCCA 1071
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGAAGGAAGTTGTCCGAACAGACAGCCTGAAGGGGCGGCGGGGCCGGCTACCTTCAAAACCCAAGCAGCCCCCA 1110
Query 1072 GATGCCTCCCCTGCCAATCTCCTCACTTCCCTGGTCCGTGCACACCTGGACTCAGGGCCCAGCACTGCCAAACT 1145
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GATGCCTCCCCTGCCAATCTCCTCACTTCCCTGGTCCGTGCACACCTGGACTCAGGGCCCAGCACTGCCAAACT 1184
Query 1146 GGACTACTCCAAGTTCCAGGAGCTGGTGCTGCCCCACTTTGGGAAGGAAGATGCTGGGGATGTACAGCAGTTCT 1219
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GGACTACTCCAAGTTCCAGGAGCTGGTGCTGCCCCACTTTGGGAAGGAAGATGCTGGGGATGTACAGCAGTTCT 1258
Query 1220 ACGACCTGCTCTCCGGTTCTCTGGAGGTCATCCGCAAGTGGGCGGAGAAGATCCCTGGCTTTGCTGAGCTGTCA 1293
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 ACGACCTGCTCTCCGGTTCTCTGGAGGTCATCCGCAAGTGGGCGGAGAAGATCCCTGGCTTTGCTGAGCTGTCA 1332
Query 1294 CCGGCTGACCAGGACCTGTTGCTGGAGTCGGCCTTCCTGGAGCTCTTCATCCTCCGCCTGGCGTACAGGTCTAA 1367
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CCGGCTGACCAGGACCTGTTGCTGGAGTCGGCCTTCCTGGAGCTCTTCATCCTCCGCCTGGCGTACAGGTCTAA 1406
Query 1368 GCCAGGCGAGGGCAAGCTCATCTTCTGCTCAGGCCTGGTGCTACACCGGCTGCAGTGTGCCCGTGGCTTCGGGG 1441
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GCCAGGCGAGGGCAAGCTCATCTTCTGCTCAGGCCTGGTGCTACACCGGCTGCAGTGTGCCCGTGGCTTCGGGG 1480
Query 1442 ACTGGATTGACAGTATCCTGGCCTTCTCAAGGTCCCTGCACAGCTTGCTTGTCGATGTCCCTGCCTTCGCCTGC 1515
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 ACTGGATTGACAGTATCCTGGCCTTCTCAAGGTCCCTGCACAGCTTGCTTGTCGATGTCCCTGCCTTCGCCTGC 1554
Query 1516 CTCTCTGCCCTTGTCCTCATCACCGACCGGCATGGGCTGCAGGAGCCGCGGCGGGTGGAGGAGCTGCAGAACCG 1589
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CTCTCTGCCCTTGTCCTCATCACCGACCGGCATGGGCTGCAGGAGCCGCGGCGGGTGGAGGAGCTGCAGAACCG 1628
Query 1590 CATCGCCAGCTGCCTGAAGGAGCACGTGGCAGCTGTGGCGGGCGAGCCCCAGCCAGCCAGCTGCCTGTCACGTC 1663
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CATCGCCAGCTGCCTGAAGGAGCACGTGGCAGCTGTGGCGGGCGAGCCCCAGCCAGCCAGCTGCCTGTCACGTC 1702
Query 1664 TGTTGGGCAAACTGCCCGAGCTGCGGACCCTGTGCACCCAGGGCCTGCAGCGCATCTTCTACCTCAAGCTGGAG 1737
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TGTTGGGCAAACTGCCCGAGCTGCGGACCCTGTGCACCCAGGGCCTGCAGCGCATCTTCTACCTCAAGCTGGAG 1776
Query 1738 GACTTGGTGCCCCCTCCACCCATCATTGACAAGATCTTCATGGACACGCTGCCCTTC 1794
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GACTTGGTGCCCCCTCCACCCATCATTGACAAGATCTTCATGGACACGCTGCCCTTC 1833