Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00765
• Subject: NR_002885.3
• Aligned Length: 1428
• Identities: 889
• Gaps: 468

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  GGGGCACGTTCGTTATCGTATTCCTTTCTGCTCTTTGACGCTGCCGAGGAAGCATCGCTGAAGGCTCTCGTAAC  74

Query    1  ---------ATGTCTAAGTCAGAGTCTCCTAAAGAGCCCGAACAGCTGAGGAAGCTCTTCATTGGAGGGTTGAG  65
                     |||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||.|||||||||||||.||||||.||||
Sbjct   75  TCTACCGTCATGTCTAAGTCCGAGTCTCCCAAGGAGCCAGAACAGCTGCGGAAGCTCTTCATCGGAGGGCTGAG  148

Query   66  CTTTGAAACAACTGATGAGAGCCTGAGGAGCCATTTTGAGCAATGGGGAACGCTCACGGACTGTGTGGTAATGA  139
            |||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct  149  CTTCGAAACAACCGACGAGAGTCTGAGGAGCCATTTTGAGCAATGGGGAACACTAACAGACTGTGTGGTAATGA  222

Query  140  GAGATCCAAACACCAAGCGCTCCAGGGGCTTTGGGTTTGTCACATATGCCACTGTGGAGGAGGTGGATGCAGCT  213
            |||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.
Sbjct  223  GAGATCCAAACACCAAGAGATCCAGGGGCTTTGGGTTTGTCACATATGCCACTGTGGAAGAAGTGGATGCTGCC  296

Query  214  ATGAATGCAAGGCCACACAAGGTGGATGGAAGAGTTGTGGAACCAAAGAGAGCTGTCTCCAGAGAAGATTCTCA  287
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  297  ATGAATGCAAGACCACACAAGGTGGATGGAAGAGTTGTGGAACCTAAGAGAGCTGTCTCAAGAGAAGATTCTCA  370

Query  288  AAGACCAGGTGCCCACTTAACTGTGAAAAAGATATTTGTTGGTGGCATTAAAGAAGACACTGAAGAACATCACC  361
            ..|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCGACCAGGTGCCCACTTAACTGTGAAAAAGATCTTTGTTGGTGGTATTAAAGAAGACACTGAAGAACATCACC  444

Query  362  TAAGAGATTATTTTGAACAGTATGGAAAAATTGAAGTGATTGAAATCATGACTGACCGAGGCAGTGGCAAGAAA  435
            ||.|||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||.||||||||||.||.||.
Sbjct  445  TACGAGATTATTTTGAGCAGTATGGGAAGATTGAAGTGATAGAAATTATGACTGACAGAGGCAGTGGGAAAAAG  518

Query  436  AGGGGCTTTGCCTTTGTAACCTTTGACGACCATGACTCCGTGGATAAGATTGTCATTCAGAAATACCATACTGT  509
            |||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGGGGCTTTGCTTTTGTTACCTTTGATGACCATGACTCTGTGGATAAGATTGTTATTCAGAAATACCATACTGT  592

Query  510  GAATGGCCACAACTGTGAAGTTAGAAAAGCCCTGTCAAAGCAAGAGATGGCTAGTGCTTCATCCAGCCAAAGAG  583
            |||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct  593  GAATGGCCACAACTGTGAAGTAAGAAAGGCTCTGTCGAAGCAAGAGATGGCTAGTGCTTCATCCAGTCAGAGAG  666

Query  584  GTCGAAGTGGTTCTGGAAACTTTGGTGGTGGTCGTGGAGGTGGTTTCGGTGGGAATGACAACTTCGGTCGTGGA  657
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||
Sbjct  667  GTCGCAGTGGTTCTGGAAACTTTGGTGGTGGTCGTGGAGGCGGTTTTGGTGGCAATGACAATTTTGGTCGAGGA  740

Query  658  GGAAACTTCAGTGGTCGTGGTGGCTTTGGTGGCAGCCGTGGTGGTGGTGGATATGGTGGCAGTGGGGATGGCTA  731
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGGAACTTCAGTGGTCGTGGTGGCTTTGGTGGCAGCCGTGGTGGTGGTGGATATGGTGGCAGTGGGGATGGCTA  814

Query  732  TAATGGATTTGGTAATGATGGAAGCAATTTTGGAGGTGGTGGAAGCTACAATGATTTTGGGAATTACAACAATC  805
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  815  TAATGGATTTGGCAATGATGGAAGCAATTTTGGAGGTGGTGGAAGCTACAATGATTTTGGCAATTACAACAATC  888

Query  806  AGTCTTCAAATTTTGGACCCATGAAGGGAGGAAATTTTGGAGGCAGAAGCTCTGGCCCCTATGGCGGTGGAGGC  879
            |||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct  889  AGTCTTCCAATTTTGGGCCGATGAAGGGAGGAAACTTTGGAGGCAGGAGCTCTGGCCCTTATGGTGGTGGAGGC  962

Query  880  CAATACTTTGCAAAACCACGAAACCAAGGTGGCTATGGCGGTTCCAGCAGCAGCAGTAGCTATGGCAGTGGCAG  953
            ||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAGTACTTTGCTAAACCACGGAACCAAGGTGGCTATGGCGGTTCCAGCAGCAGCAGTAGCTATGGCAGTGGCAG  1036

Query  954  AAGATTT-------------------------------------------------------------------  960
            .||.||.                                                                   
Sbjct 1037  GAGGTTCTAATTACATACAGCCAGGAAACAAAGCTTAGCAGGAGAGGAGAGCCAGAGAAGTGACAGGGAAGCTA  1110

Query  961  --------------------------------------------------------------------------  960
                                                                                      
Sbjct 1111  CAGGTTACAACAGATTTGTGAACTCAGCCAAGCACAGTGGTGGCAGGGCCTAGCTGCTACAAAGAAGACATGTT  1184

Query  961  --------------------------------------------------------------------------  960
                                                                                      
Sbjct 1185  TTAGACAATACTCATGTGTGTGGGCAAAAACTCCAGGACTGTATTTGTGACTGACTAATTGTATAACAGGTTAT  1258

Query  961  --------------------------------------------------------------------------  960
                                                                                      
Sbjct 1259  TTTAGTTTCTGTTCTGTGGAAAGTGTAAAGCATTCCAACAAAAGGTTTTACTGTAGACCTTTTTCACCCATGCT  1332

Query  961  --------------------------------------------------------------------------  960
                                                                                      
Sbjct 1333  GTTGATTGCTAAATGTAATAGTCTGATCATGACGCTGAATAAATGTGTCTTTTTTTTTTTTAAAAAAAAAAAAA  1406

Query  961  ----------------------  960
                                  
Sbjct 1407  AAAAAAGAAGTGGAAACAAAAA  1428