Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00765
• Subject: NR_104427.1
• Aligned Length: 1324
• Identities: 889
• Gaps: 364

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  GGCGGGATAAAAGGGCGAGCAGAAGGTAGGCTGGCGGGCACGTTCGTTATCGTATTCCTTTCTGCTCTTTGACG  74

Query    1  -------------------------------------------ATGTCTAAGTCAGAGTCTCCTAAAGAGCCCG  31
                                                       |||||||||||.||||||||.||.|||||.|
Sbjct   75  CTGCCGAGGAAGCATCGCTGAAGGCTCTCGTAACTCTACCGTCATGTCTAAGTCCGAGTCTCCCAAGGAGCCAG  148

Query   32  AACAGCTGAGGAAGCTCTTCATTGGAGGGTTGAGCTTTGAAACAACTGATGAGAGCCTGAGGAGCCATTTTGAG  105
            ||||||||.|||||||||||||.||||||.|||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct  149  AACAGCTGCGGAAGCTCTTCATCGGAGGGCTGAGCTTCGAAACAACCGACGAGAGTCTGAGGAGCCATTTTGAG  222

Query  106  CAATGGGGAACGCTCACGGACTGTGTGGTAATGAGAGATCCAAACACCAAGCGCTCCAGGGGCTTTGGGTTTGT  179
            |||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAATGGGGAACACTAACAGACTGTGTGGTAATGAGAGATCCAAACACCAAGAGATCCAGGGGCTTTGGGTTTGT  296

Query  180  CACATATGCCACTGTGGAGGAGGTGGATGCAGCTATGAATGCAAGGCCACACAAGGTGGATGGAAGAGTTGTGG  253
            ||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CACATATGCCACTGTGGAAGAAGTGGATGCTGCCATGAATGCAAGACCACACAAGGTGGATGGAAGAGTTGTGG  370

Query  254  AACCAAAGAGAGCTGTCTCCAGAGAAGATTCTCAAAGACCAGGTGCCCACTTAACTGTGAAAAAGATATTTGTT  327
            ||||.||||||||||||||.||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  371  AACCTAAGAGAGCTGTCTCAAGAGAAGATTCTCAGCGACCAGGTGCCCACTTAACTGTGAAAAAGATCTTTGTT  444

Query  328  GGTGGCATTAAAGAAGACACTGAAGAACATCACCTAAGAGATTATTTTGAACAGTATGGAAAAATTGAAGTGAT  401
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||
Sbjct  445  GGTGGTATTAAAGAAGACACTGAAGAACATCACCTACGAGATTATTTTGAGCAGTATGGGAAGATTGAAGTGAT  518

Query  402  TGAAATCATGACTGACCGAGGCAGTGGCAAGAAAAGGGGCTTTGCCTTTGTAACCTTTGACGACCATGACTCCG  475
            .|||||.|||||||||.||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  519  AGAAATTATGACTGACAGAGGCAGTGGGAAAAAGAGGGGCTTTGCTTTTGTTACCTTTGATGACCATGACTCTG  592

Query  476  TGGATAAGATTGTCATTCAGAAATACCATACTGTGAATGGCCACAACTGTGAAGTTAGAAAAGCCCTGTCAAAG  549
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||
Sbjct  593  TGGATAAGATTGTTATTCAGAAATACCATACTGTGAATGGCCACAACTGTGAAGTAAGAAAGGCTCTGTCGAAG  666

Query  550  CAAGAGATGGCTAGTGCTTCATCCAGCCAAAGAGGTCGAAGTGGTTCTGGAAACTTTGGTGGTGGTCGTGGAGG  623
            ||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAAGAGATGGCTAGTGCTTCATCCAGTCAGAGAGGTCGCAGTGGTTCTGGAAACTTTGGTGGTGGTCGTGGAGG  740

Query  624  TGGTTTCGGTGGGAATGACAACTTCGGTCGTGGAGGAAACTTCAGTGGTCGTGGTGGCTTTGGTGGCAGCCGTG  697
            .|||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CGGTTTTGGTGGCAATGACAATTTTGGTCGAGGAGGGAACTTCAGTGGTCGTGGTGGCTTTGGTGGCAGCCGTG  814

Query  698  GTGGTGGTGGATATGGTGGCAGTGGGGATGGCTATAATGGATTTGGTAATGATGGAAGCAATTTTGGAGGTGGT  771
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTGGTGGTGGATATGGTGGCAGTGGGGATGGCTATAATGGATTTGGCAATGATGGAAGCAATTTTGGAGGTGGT  888

Query  772  GGAAGCTACAATGATTTTGGGAATTACAACAATCAGTCTTCAAATTTTGGACCCATGAAGGGAGGAAATTTTGG  845
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||
Sbjct  889  GGAAGCTACAATGATTTTGGCAATTACAACAATCAGTCTTCCAATTTTGGGCCGATGAAGGGAGGAAACTTTGG  962

Query  846  AGGCAGAAGCTCTGGCCCCTATGGCGGTGGAGGCCAATACTTTGCAAAACCACGAAACCAAGGTGGCTATGGCG  919
            ||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGGCAGGAGCTCTGGCCCTTATGGTGGTGGAGGCCAGTACTTTGCTAAACCACGGAACCAAGGTGGCTATGGCG  1036

Query  920  GTTCCAGCAGCAGCAGTAGCTATGGCAGTGGCAGAAGATTT---------------------------------  960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.                                 
Sbjct 1037  GTTCCAGCAGCAGCAGTAGCTATGGCAGTGGCAGGAGGTTCTAATTACATACAGCCAGGAAGGAATCTGCTATG  1110

Query  961  --------------------------------------------------------------------------  960
                                                                                      
Sbjct 1111  AGGCTTAACTGCTGTCATAAAATTTGTTTAAAAAATTCTGCAGAAGTTGCTGGCCAAAAGGAACATCCTTAAGA  1184

Query  961  --------------------------------------------------------------------------  960
                                                                                      
Sbjct 1185  CAGCAGCCTTTATTCTGGGCCACTGTACTCCACTCACTGCCATGCAGTTGGGTTTTAGCTGTACTGCTAAAAAA  1258

Query  961  ------------------------------------------------------------------  960
                                                                              
Sbjct 1259  TCATTCAATTTTGTGAATGGCTTACTTTGGTTTTTTTTTTTAAATAAACTTTTTAATTAACTCCTG  1324