Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_00765
Subject:
NR_135167.2
Aligned Length:
1255
Identities:
960
Gaps:
295

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  AGATACGTTCGTCAGCTTGCTCCTTTCTGCCCGTGGACGCCGCCGAAGAAGCATCGTTAAAGTCTCTCTTCACC  74

Query    1  --------ATGTCTAAGTCAGAGTCTCCTAAAGAGCCCGAACAGCTGAGGAAGCTCTTCATTGGAGGGTTGAGC  66
                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTGCCGTCATGTCTAAGTCAGAGTCTCCTAAAGAGCCCGAACAGCTGAGGAAGCTCTTCATTGGAGGGTTGAGC  148

Query   67  TTTGAAACAACTGATGAGAGCCTGAGGAGCCATTTTGAGCAATGGGGAACGCTCACGGACTGTGTGGTAATGAG  140
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTTGAAACAACTGATGAGAGCCTGAGGAGCCATTTTGAGCAATGGGGAACGCTCACGGACTGTGTGGTAATGAG  222

Query  141  AGATCCAAACACCAAGCGCTCCAGGGGCTTTGGGTTTGTCACATATGCCACTGTGGAGGAGGTGGATGCAGCTA  214
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGATCCAAACACCAAGCGCTCCAGGGGCTTTGGGTTTGTCACATATGCCACTGTGGAGGAGGTGGATGCAGCTA  296

Query  215  TGAATGCAAGGCCACACAAGGTGGATGGAAGAGTTGTGGAACCAAAGAGAGCTGTCTCCAGAGAAGATTCTCAA  288
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGAATGCAAGGCCACACAAGGTGGATGGAAGAGTTGTGGAACCAAAGAGAGCTGTCTCCAGAGAAGATTCTCAA  370

Query  289  AGACCAGGTGCCCACTTAACTGTGAAAAAGATATTTGTTGGTGGCATTAAAGAAGACACTGAAGAACATCACCT  362
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGACCAGGTGCCCACTTAACTGTGAAAAAGATATTTGTTGGTGGCATTAAAGAAGACACTGAAGAACATCACCT  444

Query  363  AAGAGATTATTTTGAACAGTATGGAAAAATTGAAGTGATTGAAATCATGACTGACCGAGGCAGTGGCAAGAAAA  436
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGAGATTATTTTGAACAGTATGGAAAAATTGAAGTGATTGAAATCATGACTGACCGAGGCAGTGGCAAGAAAA  518

Query  437  GGGGCTTTGCCTTTGTAACCTTTGACGACCATGACTCCGTGGATAAGATTGTCATTCAGAAATACCATACTGTG  510
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGGGCTTTGCCTTTGTAACCTTTGACGACCATGACTCCGTGGATAAGATTGTCATTCAGAAATACCATACTGTG  592

Query  511  AATGGCCACAACTGTGAAGTTAGAAAAGCCCTGTCAAAGCAAGAGATGGCTAGTGCTTCATCCAGCCAAAGAGG  584
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AATGGCCACAACTGTGAAGTTAGAAAAGCCCTGTCAAAGCAAGAGATGGCTAGTGCTTCATCCAGCCAAAGAGG  666

Query  585  TCGAAGTGGTTCTGGAAACTTTGGTGGTGGTCGTGGAGGTGGTTTCGGTGGGAATGACAACTTCGGTCGTGGAG  658
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCGAAGTGGTTCTGGAAACTTTGGTGGTGGTCGTGGAGGTGGTTTCGGTGGGAATGACAACTTCGGTCGTGGAG  740

Query  659  GAAACTTCAGTGGTCGTGGTGGCTTTGGTGGCAGCCGTGGTGGTGGTGGATATGGTGGCAGTGGGGATGGCTAT  732
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAAACTTCAGTGGTCGTGGTGGCTTTGGTGGCAGCCGTGGTGGTGGTGGATATGGTGGCAGTGGGGATGGCTAT  814

Query  733  AATGGATTTGGTAATGATGGAAGCAATTTTGGAGGTGGTGGAAGCTACAATGATTTTGGGAATTACAACAATCA  806
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AATGGATTTGGTAATGATGGAAGCAATTTTGGAGGTGGTGGAAGCTACAATGATTTTGGGAATTACAACAATCA  888

Query  807  GTCTTCAAATTTTGGACCCATGAAGGGAGGAAATTTTGGAGGCAGAAGCTCTGGCCCCTATGGCGGTGGAGGCC  880
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTCTTCAAATTTTGGACCCATGAAGGGAGGAAATTTTGGAGGCAGAAGCTCTGGCCCCTATGGCGGTGGAGGCC  962

Query  881  AATACTTTGCAAAACCACGAAACCAAGGTGGCTATGGCGGTTCCAGCAGCAGCAGTAGCTATGGCAGTGGCAGA  954
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AATACTTTGCAAAACCACGAAACCAAGGTGGCTATGGCGGTTCCAGCAGCAGCAGTAGCTATGGCAGTGGCAGA  1036

Query  955  AGATTT--------------------------------------------------------------------  960
            ||||||                                                                    
Sbjct 1037  AGATTTTAATTAGGGAGGAGTCTGCTACTAGTCTTATCAGCTCTTAAAAACAGAAACTCATCTGTCCAAGTTCG  1110

Query  961  --------------------------------------------------------------------------  960
                                                                                      
Sbjct 1111  TGGCAGAAAGGAACGTCCTTGTGAAGACCTTTATCTGAGCCACTGTACTTCGTTATCACTGCCATGCAGTTTAC  1184

Query  961  -----------------------------------------------------------------------  960
                                                                                   
Sbjct 1185  ATGAGCTGTTCTGCAGCTCAAATTCCATTTTGTGAATGGGTTTTTTTTTTTAATAAACTGTATTTAACTTA  1255