Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_00765
- Subject:
- XR_245923.2
- Aligned Length:
- 1401
- Identities:
- 960
- Gaps:
- 441
Alignment
Query 1 ------------------------------------------------------------------------AT 2
||
Sbjct 1 GTCAGCTTGCTCCTTTCTGCCCGTGGACGCCGCCGAAGAAGCATCGTTAAAGTCTCTCTTCACCCTGCCGTCAT 74
Query 3 GTCTAAGTCAGAGTCTCCTAAAGAGCCCGAACAGCTGAGGAAGCTCTTCATTGGAGGGTTGAGCTTTGAAACAA 76
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GTCTAAGTCAGAGTCTCCTAAAGAGCCCGAACAGCTGAGGAAGCTCTTCATTGGAGGGTTGAGCTTTGAAACAA 148
Query 77 CTGATGAGAGCCTGAGGAGCCATTTTGAGCAATGGGGAACGCTCACGGACTGTGTGGTAATGAGAGATCCAAAC 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CTGATGAGAGCCTGAGGAGCCATTTTGAGCAATGGGGAACGCTCACGGACTGTGTGGTAATGAGAGATCCAAAC 222
Query 151 ACCAAGCGCTCCAGGGGCTTTGGGTTTGTCACATATGCCACTGTGGAGGAGGTGGATGCAGCTATGAATGCAAG 224
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ACCAAGCGCTCCAGGGGCTTTGGGTTTGTCACATATGCCACTGTGGAGGAGGTGGATGCAGCTATGAATGCAAG 296
Query 225 GCCACACAAGGTGGATGGAAGAGTTGTGGAACCAAAGAGAGCTGTCTCCAGAGAAGATTCTCAAAGACCAGGTG 298
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GCCACACAAGGTGGATGGAAGAGTTGTGGAACCAAAGAGAGCTGTCTCCAGAGAAGATTCTCAAAGACCAGGTG 370
Query 299 CCCACTTAACTGTGAAAAAGATATTTGTTGGTGGCATTAAAGAAGACACTGAAGAACATCACCTAAGAGATTAT 372
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CCCACTTAACTGTGAAAAAGATATTTGTTGGTGGCATTAAAGAAGACACTGAAGAACATCACCTAAGAGATTAT 444
Query 373 TTTGAACAGTATGGAAAAATTGAAGTGATTGAAATCATGACTGACCGAGGCAGTGGCAAGAAAAGGGGCTTTGC 446
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTTGAACAGTATGGAAAAATTGAAGTGATTGAAATCATGACTGACCGAGGCAGTGGCAAGAAAAGGGGCTTTGC 518
Query 447 CTTTGTAACCTTTGACGACCATGACTCCGTGGATAAGATTGTCATTCAGAAATACCATACTGTGAATGGCCACA 520
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CTTTGTAACCTTTGACGACCATGACTCCGTGGATAAGATTGTCATTCAGAAATACCATACTGTGAATGGCCACA 592
Query 521 ACTGTGAAGTTAGAAAAGCCCTGTCAAAGCAAGAGATGGCTAGTGCTTCATCCAGCCAAAGAGGTCGAAGTGGT 594
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACTGTGAAGTTAGAAAAGCCCTGTCAAAGCAAGAGATGGCTAGTGCTTCATCCAGCCAAAGAGGTCGAAGTGGT 666
Query 595 TCTGGAAACTTTGGTGGTGGTCGTGGAGGTGGTTTCGGTGGGAATGACAACTTCGGTCGTGGAGGAAACTTCAG 668
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TCTGGAAACTTTGGTGGTGGTCGTGGAGGTGGTTTCGGTGGGAATGACAACTTCGGTCGTGGAGGAAACTTCAG 740
Query 669 TGGTCGTGGTGGCTTTGGTGGCAGCCGTGGTGGTGGTGGATATGGTGGCAGTGGGGATGGCTATAATGGATTTG 742
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGGTCGTGGTGGCTTTGGTGGCAGCCGTGGTGGTGGTGGATATGGTGGCAGTGGGGATGGCTATAATGGATTTG 814
Query 743 GTAATGA------------------------------------------------------------------- 749
|||||||
Sbjct 815 GTAATGATGGTGGTTATGGAGGAGGCGGCCCTGGTTACTCTGGAGGAAGCAGAGGCTATGGAAGTGGTGGACAG 888
Query 750 -------------------------------------------------------------------------- 749
Sbjct 889 GGTTATGGAAACCAGGGCAGTGGCTATGGCGGGAGTGGCAGCTATGACAGCTATAACAACGGAGGCGGAGGCGG 962
Query 750 ---------------TGGAAGCAATTTTGGAGGTGGTGGAAGCTACAATGATTTTGGGAATTACAACAATCAGT 808
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CTTTGGCGGTGGTAGTGGAAGCAATTTTGGAGGTGGTGGAAGCTACAATGATTTTGGGAATTACAACAATCAGT 1036
Query 809 CTTCAAATTTTGGACCCATGAAGGGAGGAAATTTTGGAGGCAGAAGCTCTGGCCCCTATGGCGGTGGAGGCCAA 882
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTTCAAATTTTGGACCCATGAAGGGAGGAAATTTTGGAGGCAGAAGCTCTGGCCCCTATGGCGGTGGAGGCCAA 1110
Query 883 TACTTTGCAAAACCACGAAACCAAGGTGGCTATGGCGGTTCCAGCAGCAGCAGTAGCTATGGCAGTGGCAGAAG 956
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TACTTTGCAAAACCACGAAACCAAGGTGGCTATGGCGGTTCCAGCAGCAGCAGTAGCTATGGCAGTGGCAGAAG 1184
Query 957 ATTT---------------------------------------------------------------------- 960
||||
Sbjct 1185 ATTTTAATTAGGGAGGAGTCTGCTACTAGTCTTATCAGCTCTTAAAAACAGAAACTCATCTGTCCAAGTTCGTG 1258
Query 961 -------------------------------------------------------------------------- 960
Sbjct 1259 GCAGAAAGGAACGTCCTTGTGAAGACCTTTATCTGAGCCACTGTACTTCGTTATCACTGCCATGCAGTTTACAT 1332
Query 961 --------------------------------------------------------------------- 960
Sbjct 1333 GAGCTGTTCTGCAGCTCAAATTCCATTTTGTGAATGGGTTTTTTTTTTTAATAAACTGTATTTAACTTA 1401