Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00800
• Subject: NM_010477.4
• Aligned Length: 1719
• Identities: 1561
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGCTTCGGTTACCCACAGTCTTTCGCCAGATGAGACCGGTGTCCAGGGTACTGGCTCCTCATCTCACTCGGGC  74
            ||||||||..|||||||||||.||||||||||||||||.||||||.|||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTTCGACTACCCACAGTCCTTCGCCAGATGAGACCAGTGTCCCGGGCACTGGCTCCTCATCTCACTCGGGC  74

Query   75  TTATGCCAAAGATGTAAAATTTGGTGCAGATGCCCGAGCCTTAATGCTTCAAGGTGTAGACCTTTTAGCCGATG  148
            .||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct   75  CTATGCCAAAGATGTAAAATTTGGTGCGGACGCTCGAGCCTTAATGCTTCAAGGTGTAGACCTTTTAGCAGATG  148

Query  149  CTGTGGCCGTTACAATGGGGCCAAAGGGAAGAACAGTGATTATTGAGCAGAGTTGGGGAAGTCCCAAAGTAACA  222
            ||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTGTAGCTGTTACAATGGGGCCAAAGGGAAGAACTGTGATTATTGAACAGAGTTGGGGAAGTCCCAAAGTAACA  222

Query  223  AAAGATGGTGTGACTGTTGCAAAGTCAATTGACTTAAAAGATAAATACAAAAACATTGGAGCTAAACTTGTTCA  296
            ||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAAGATGGGGTCACTGTTGCAAAGTCAATTGATTTAAAGGATAAATACAAAAATATTGGAGCTAAACTTGTTCA  296

Query  297  AGATGTTGCCAATAACACAAATGAAGAAGCTGGGGATGGCACTACCACTGCTACTGTACTGGCACGCTCTATAG  370
            .||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.|
Sbjct  297  GGACGTTGCCAATAACACAAACGAAGAGGCTGGGGATGGCACCACCACTGCCACTGTTCTGGCACGATCTATTG  370

Query  371  CCAAGGAAGGCTTCGAGAAGATTAGCAAAGGTGCTAATCCAGTGGAAATCAGGAGAGGTGTGATGTTAGCTGTT  444
            |||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||.
Sbjct  371  CCAAGGAGGGCTTTGAGAAGATCAGCAAAGGGGCTAATCCAGTGGAAATCCGGAGAGGTGTGATGTTGGCTGTG  444

Query  445  GATGCTGTAATTGCTGAACTTAAAAAGCAGTCTAAACCTGTGACCACCCCTGAAGAAATTGCACAGGTTGCTAC  518
            |||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  445  GATGCTGTAATTGCTGAACTTAAGAAACAGTCTAAACCTGTGACAACCCCTGAAGAAATTGCTCAGGTTGCTAC  518

Query  519  GATTTCTGCAAACGGAGACAAAGAAATTGGCAATATCATCTCTGATGCAATGAAAAAAGTTGGAAGAAAGGGTG  592
            .|||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  519  AATTTCTGCAAATGGAGACAAAGACATTGGGAACATCATTTCTGATGCAATGAAAAAGGTTGGAAGAAAGGGTG  592

Query  593  TCATCACAGTAAAGGATGGAAAAACACTGAATGATGAATTAGAAATTATTGAAGGCATGAAGTTTGATCGAGGC  666
            ||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||.||||.
Sbjct  593  TCATCACAGTGAAGGATGGAAAAACCCTGAATGATGAGCTAGAAATTATTGAAGGCATGAAGTTTGATAGAGGA  666

Query  667  TATATTTCTCCATACTTTATTAATACATCAAAAGGTCAGAAATGTGAATTCCAGGATGCCTATGTTCTGTTGAG  740
            ||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||..|||||||
Sbjct  667  TATATTTCCCCGTATTTTATTAACACATCAAAAGGTCAAAAGTGTGAATTCCAAGATGCCTATGTCTTGTTGAG  740

Query  741  TGAAAAGAAAATTTCTAGTATCCAGTCCATTGTACCTGCTCTTGAAATTGCCAATGCTCACCGTAAGCCTTTGG  814
            |||||||||||||||.|||.|.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||
Sbjct  741  TGAAAAGAAAATTTCCAGTGTTCAGTCCATTGTCCCTGCTCTTGAAATTGCTAATGCTCATCGGAAGCCATTGG  814

Query  815  TCATAATCGCTGAAGATGTTGATGGAGAAGCTCTAAGTACACTCGTCTTGAATAGGCTAAAGGTTGGTCTTCAG  888
            ||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.||.||.|||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  815  TCATAATCGCCGAAGACGTTGACGGAGAAGCTCTAAGCACGCTGGTTTTGAACAGGCTAAAAGTTGGTCTTCAG  888

Query  889  GTTGTGGCAGTCAAGGCTCCAGGGTTTGGTGACAATAGAAAGAACCAGCTTAAAGATATGGCTATTGCTACTGG  962
            ||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTTGTGGCAGTCAAAGCTCCAGGATTTGGGGACAATAGGAAGAACCAGCTTAAAGATATGGCTATTGCTACTGG  962

Query  963  TGGTGCAGTGTTTGGAGAAGAGGGATTGACCCTGAATCTTGAAGACGTTCAGCCTCATGACTTAGGAAAAGTTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||.||||..||.|||||||||||.|||||..|||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGGTGCAGTGTTTGGAGAAGAGGGGTTGAATCTAAATCTTGAAGATGTTCAAGCTCATGACTTAGGAAAAGTTG  1036

Query 1037  GAGAGGTCATTGTGACCAAAGACGATGCCATGCTCTTAAAAGGAAAAGGTGACAAGGCTCAAATTGAAAAACGT  1110
            |.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1037  GGGAGGTCATTGTCACCAAAGATGATGCCATGCTTTTGAAAGGAAAAGGTGACAAAGCTCACATTGAAAAACGT  1110

Query 1111  ATTCAAGAAATCATTGAGCAGTTAGATGTCACAACTAGTGAATATGAAAAGGAAAAACTGAATGAACGGCTTGC  1184
            |||||||||||||.|||||||.||||..||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||
Sbjct 1111  ATTCAAGAAATCACTGAGCAGCTAGACATCACAACTAGTGAATATGAAAAAGAAAAGCTGAACGAGCGACTTGC  1184

Query 1185  AAAACTTTCAGATGGAGTGGCTGTGCTGAAGGTTGGTGGGACAAGTGATGTTGAAGTGAATGAAAAGAAAGACA  1258
            .|||||||||||||||||.||||||.||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1185  TAAACTTTCAGATGGAGTAGCTGTGTTGAAGGTTGGAGGAACAAGTGATGTTGAAGTGAATGAGAAAAAAGACA  1258

Query 1259  GAGTTACAGATGCCCTTAATGCTACAAGAGCTGCTGTTGAAGAAGGCATTGTTTTGGGAGGGGGTTGTGCCCTC  1332
            |||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|.||||||||.||.||.||.
Sbjct 1259  GAGTTACTGATGCTCTCAATGCTACAAGAGCAGCTGTTGAAGAAGGCATTGTTCTAGGAGGGGGCTGCGCTCTG  1332

Query 1333  CTTCGATGCATTCCAGCCTTGGACTCATTGACTCCAGCTAATGAAGATCAAAAAATTGGTATAGAAATTATTAA  1406
            |||||.|||||.|||||||||||.|||||.|..||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTTCGGTGCATCCCAGCCTTGGATTCATTAAAGCCTGCTAATGAAGACCAGAAAATAGGTATAGAAATTATTAA  1406

Query 1407  AAGAACACTCAAAATTCCAGCAATGACCATTGCTAAGAATGCAGGTGTTGAAGGATCTTTGATAGTTGAGAAAA  1480
            ||||.||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AAGAGCACTTAAAATTCCTGCAATGACGATTGCTAAGAATGCAGGTGTTGAAGGATCTTTGATAGTTGAGAAAA  1480

Query 1481  TTATGCAAAGTTCCTCAGAAGTTGGTTATGATGCTATGGCTGGAGATTTTGTGAATATGGTGGAAAAAGGAATC  1554
            ||.||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||..|||||||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 1481  TTCTGCAGAGTTCCTCAGAAGTTGGTTATGACGCCATGCTTGGAGATTTTGTGAACATGGTGGAAAAAGGGATC  1554

Query 1555  ATTGACCCAACAAAGGTTGTGAGAACTGCTTTATTGGATGCTGCTGGTGTGGCCTCTCTGTTAACTACAGCAGA  1628
            |||||.|||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||.||||||||..||.||||||||||.||
Sbjct 1555  ATTGATCCAACAAAGGTTGTGAGAACTGCCTTACTGGATGCTGCTGGGGTGGCCTCCTTGCTAACTACAGCCGA  1628

Query 1629  AGTTGTAGTCACAGAAATTCCTAAAGAAGAGAAGGACCCTGGAATGGGTGCAATGGGTGGAATGGGAGGTGGTA  1702
            ||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 1629  AGCTGTAGTGACAGAAATTCCTAAAGAAGAGAAGGACCCTGGAATGGGTGCAATGGGTGGCATGGGAGGGGGTA  1702

Query 1703  TGGGAGGTGGCATGTTC  1719
            |||||||.|||||||||
Sbjct 1703  TGGGAGGCGGCATGTTC  1719