Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_00806
- Subject:
- NM_008314.2
- Aligned Length:
- 1073
- Identities:
- 906
- Gaps:
- 4
Alignment
Query 1 ATGGATTTACCTGTGAACCTAACCTCCTTTTCCCTCTCCACCCCCTCCCCTTTGGAGACC-AACCACAGCCTCG 73
||||||.|.|||||.|||.|.|||||||||||.|||||.||.||||||.||||||| ||| ||||.||||.|.|
Sbjct 1 ATGGATCTGCCTGTAAACTTGACCTCCTTTTCTCTCTCTACTCCCTCCTCTTTGGA-ACCTAACCGCAGCTTGG 73
Query 74 GCAAAGACGACCTGCGCCCCAGCTC-GCCCCTGCTCTCGGTCTTCGGAGTGCTTATTCTCACCTTGCTGGGCTT 146
.||..||.|.|||||||||.|| || |||..|.|||||.|..|||.|||||||..|.||.||.|||.|||||||
Sbjct 74 ACACGGAAGTCCTGCGCCCTAG-TCGGCCTTTTCTCTCAGCTTTCCGAGTGCTAGTCCTGACTTTGTTGGGCTT 146
Query 147 TCTGGTGGCGGCGACGTTCGCCTGGAACCTGCTGGTGCTGGCGACCATCCTCCGTGTACGCACCTTCCACCGCG 220
|||.|..|||||.||.|||.|.||||||||||||||||||||.|||||||||...|||||||||||||||||.|
Sbjct 147 TCTAGCTGCGGCCACATTCACTTGGAACCTGCTGGTGCTGGCTACCATCCTCAAGGTACGCACCTTCCACCGAG 220
Query 221 TGCCCCACAACCTGGTGGCATCCATGGCCGTCTCGGATGTCCTGGTGGCCGCGCTGGTCATGCCGCTGAGCCTG 294
|.||.|||||||||||.||.|||||||||.||||||||||.||.|||||.|.||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 221 TACCACACAACCTGGTAGCTTCCATGGCCATCTCGGATGTGCTAGTGGCTGTGCTGGTTATGCCACTGAGCCTG 294
Query 295 GTGCACGAGCTGTCCGGGCGCCGCTGGCAGCTAGGTCGGAGGCTGTGCCAGCTTTGGATCGCGTGCGACGTGCT 368
||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||.|.||.||||||||.||||||||.||.||||||||
Sbjct 295 GTACATGAGCTGTCTGGGCGCCGCTGGCAGCTGGGCCGGCGTCTATGCCAGCTGTGGATCGCATGTGACGTGCT 368
Query 369 TTGCTGCACGGCCAGCATCTGGAACGTGACGGCCATAGCCCTGGACCGCTACTGGTCCATCACGCGCCACATGG 442
.|||||.||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||.|||
Sbjct 369 CTGCTGTACTGCCAGCATCTGGAATGTGACAGCAATAGCTCTGGACCGCTACTGGTCAATCACGCGCCACCTGG 442
Query 443 AATACACGCTCCGCACCCGCAAGTGCGTCTCCAACGTCATGATCGCGCTCACCTGGGCACTCTCCGCTGTCATC 516
|.|||||.|||||.|||||||||.|.||||||||.||.||||||..|||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 443 AGTACACACTCCGTACCCGCAAGCGTGTCTCCAATGTGATGATCCTGCTCACCTGGGCACTCTCCACTGTCATC 516
Query 517 TCTCTGGCCCCGCTGCTTTTTGGCTGGGGAGAGACGTACTCTGAGGGCAGCGAGGAGTGCCAGGTAAGCCGCGA 590
||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||..|||.|||||.|||||.||.||.|||||
Sbjct 517 TCTCTGGCTCCACTGCTATTTGGCTGGGGAGAGACTTATTCTGAGCCCAGTGAGGAATGCCAAGTCAGTCGCGA 590
Query 591 GCCTTCCTACGCCGTGTTCTCCACCGTAGGCGCCTTCTACCTGCCGCTCTGTGTGGTGCTCTTCGTGTACTGGA 664
||||||||||.||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 591 GCCTTCCTACACCGTGTTCTCCACCGTGGGTGCCTTCTACCTGCCGCTGTGCGTGGTGCTCTTTGTGTACTGGA 664
Query 665 AGATCTACAAGGCTGCCAAGTTCCGCGTGGGCTCCAGGAAGACCAATAGCGTCTCACCCATATCCGAAGCTGTG 738
|.||.||||.|||.||.||.||||||.|||||||||||||||||||.||||||||.|||.||.|||||||||||
Sbjct 665 AAATTTACAGGGCGGCGAAATTCCGCATGGGCTCCAGGAAGACCAACAGCGTCTCCCCCGTACCCGAAGCTGTG 738
Query 739 GAGGTGAAGGACTCTGCCAAACAGCCCCAGATGGTGTTCACGGTCCGCCACGCCACCGTCACCTTCCAGCCAGA 812
|||||||||.|..||.|..||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||
Sbjct 739 GAGGTGAAGAATGCTACACAACATCCCCAGATGGTGTTCACGGTCCGCCATGCCACCGTCACCTTCCAGACAGA 812
Query 813 AGGGGACACGTGGCGGGAGCAGAAGGAGCAGCGGGCCGCCCTCATGGTGGGCATCCTCATTGGCGTGTTCGTGC 886
||||||.||||||.||||||||||||||||..||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||
Sbjct 813 AGGGGATACGTGGAGGGAGCAGAAGGAGCAAAGGGCAGCCCTCATGGTGGGCATCCTCATCGGAGTGTTTGTGC 886
Query 887 TCTGCTGGATCCCCTTCTTTCTCACCGAGCTCATCAGTCCCCTCTGCTCCTGTGACATCCCCGCCATCTGGAAA 960
||||||||.||||.|||||..||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||.||||.|||||||||||.
Sbjct 887 TCTGCTGGTTCCCTTTCTTCGTCACAGAGCTCATCAGTCCCCTGTGTTCCTGGGACGTCCCTGCCATCTGGAAG 960
Query 961 AGCATCTTCCTGTGGCTTGGCTACTCCAACTCCTTCTTTAACCCCCTGATCTATACGGCTTTCAACAAGAACTA 1034
|||||||||||||||.|.|||||.||.||.||||||||.|||||.||.|||||.||.||.|||||||.||.|||
Sbjct 961 AGCATCTTCCTGTGGTTGGGCTATTCTAATTCCTTCTTCAACCCACTCATCTACACAGCATTCAACAGGAGCTA 1034
Query 1035 CAACAGCGCCTTCAAGAACTTCTTTTCTAGGCAACAC 1071
||.|||.||.||||||..||||||.||.|.||||||.
Sbjct 1035 CAGCAGTGCTTTCAAGGTCTTCTTCTCCAAGCAACAA 1071