Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00814
• Subject: NM_001363907.1
• Aligned Length: 1308
• Identities: 1278
• Gaps: 30

Alignment

Query    1  ------------------------------ATGTGTGACCGGAATGGTGGTCGGCGGCTTCGACAGTGGCTGAT  44
                                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCAGGTGTCCCGGAGTCCCTGAATCTGATGTGTGACCGGAATGGTGGTCGGCGGCTTCGACAGTGGCTGAT  74

Query   45  CGAGCAGATTGACAGTAGCATGTATCCAGGACTGATTTGGGAGAATGAGGAGAAGAGCATGTTCCGGATCCCTT  118
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGAGCAGATTGACAGTAGCATGTATCCAGGACTGATTTGGGAGAATGAGGAGAAGAGCATGTTCCGGATCCCTT  148

Query  119  GGAAACACGCTGGCAAGCAAGATTATAATCAGGAAGTGGATGCCTCCATTTTTAAGGCCTGGGCAGTTTTTAAA  192
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGAAACACGCTGGCAAGCAAGATTATAATCAGGAAGTGGATGCCTCCATTTTTAAGGCCTGGGCAGTTTTTAAA  222

Query  193  GGGAAGTTTAAAGAAGGGGACAAAGCTGAACCAGCCACTTGGAAGACGAGGTTACGCTGTGCTTTGAATAAGAG  266
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGGAAGTTTAAAGAAGGGGACAAAGCTGAACCAGCCACTTGGAAGACGAGGTTACGCTGTGCTTTGAATAAGAG  296

Query  267  CCCAGATTTTGAGGAAGTGACGGACCGGTCCCAACTGGACATTTCCGAGCCATACAAAGTTTACCGAATTGTTC  340
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCCAGATTTTGAGGAAGTGACGGACCGGTCCCAACTGGACATTTCCGAGCCATACAAAGTTTACCGAATTGTTC  370

Query  341  CTGAGGAAGAGCAAAAATGCAAACTAGGCGTGGCAACTGCTGGCTGCGTGAATGAAGTTACAGAGATGGAGTGC  414
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTGAGGAAGAGCAAAAATGCAAACTAGGCGTGGCAACTGCTGGCTGCGTGAATGAAGTTACAGAGATGGAGTGC  444

Query  415  GGTCGCTCTGAAATCGACGAGCTGATCAAGGAGCCTTCTGTGGACGATTACATGGGGATGATCAAAAGGAGCCC  488
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGTCGCTCTGAAATCGACGAGCTGATCAAGGAGCCTTCTGTGGACGATTACATGGGGATGATCAAAAGGAGCCC  518

Query  489  TTCCCCGCCGGAGGCCTGTCGGAGTCAGCTCCTTCCAGACTGGTGGGCGCAGCAGCCCAGCACAGGCGTGCCGC  562
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TTCCCCGCCGGAGGCCTGTCGGAGTCAGCTCCTTCCAGACTGGTGGGCGCAGCAGCCCAGCACAGGCGTGCCGC  592

Query  563  TGGTGACGGGGTACACCACCTACGACGCGCACCATTCAGCATTCTCCCAGATGGTGATCAGCTTCTACTATGGG  636
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGTGACGGGGTACACCACCTACGACGCGCACCATTCAGCATTCTCCCAGATGGTGATCAGCTTCTACTATGGG  666

Query  637  GGCAAGCTGGTGGGCCAGGCCACCACCACCTGCCCCGAGGGCTGCCGCCTGTCCCTGAGCCAGCCTGGGCTGCC  710
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGCAAGCTGGTGGGCCAGGCCACCACCACCTGCCCCGAGGGCTGCCGCCTGTCCCTGAGCCAGCCTGGGCTGCC  740

Query  711  CGGCACCAAGCTGTATGGGCCCGAGGGCCTGGAGCTGGTGCGCTTCCCGCCGGCCGACGCCATCCCCAGCGAGC  784
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CGGCACCAAGCTGTATGGGCCCGAGGGCCTGGAGCTGGTGCGCTTCCCGCCGGCCGACGCCATCCCCAGCGAGC  814

Query  785  GACAGAGGCAGGTGACGCGGAAGCTGTTCGGGCACCTGGAGCGCGGGGTGCTGCTGCACAGCAGCCGGCAGGGC  858
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GACAGAGGCAGGTGACGCGGAAGCTGTTCGGGCACCTGGAGCGCGGGGTGCTGCTGCACAGCAGCCGGCAGGGC  888

Query  859  GTGTTCGTCAAGCGGCTGTGCCAGGGCCGCGTGTTCTGCAGCGGCAACGCCGTGGTGTGCAAAGGCAGGCCCAA  932
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTGTTCGTCAAGCGGCTGTGCCAGGGCCGCGTGTTCTGCAGCGGCAACGCCGTGGTGTGCAAAGGCAGGCCCAA  962

Query  933  CAAGCTGGAGCGTGATGAGGTGGTCCAGGTCTTCGACACCAGCCAGTTCTTCCGAGAGCTGCAGCAGTTCTATA  1006
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAAGCTGGAGCGTGATGAGGTGGTCCAGGTCTTCGACACCAGCCAGTTCTTCCGAGAGCTGCAGCAGTTCTATA  1036

Query 1007  ACAGCCAGGGCCGGCTTCCTGACGGCAGGGTGGTGCTGTGCTTTGGGGAAGAGTTTCCGGATATGGCCCCCTTG  1080
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACAGCCAGGGCCGGCTTCCTGACGGCAGGGTGGTGCTGTGCTTTGGGGAAGAGTTTCCGGATATGGCCCCCTTG  1110

Query 1081  CGCTCCAAACTCATTCTCGTGCAGATTGAGCAGCTGTATGTCCGGCAACTGGCAGAAGAGGCTGGGAAGAGCTG  1154
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CGCTCCAAACTCATTCTCGTGCAGATTGAGCAGCTGTATGTCCGGCAACTGGCAGAAGAGGCTGGGAAGAGCTG  1184

Query 1155  TGGAGCCGGCTCTGTGATGCAGGCCCCCGAGGAGCCGCCGCCAGACCAGGTCTTCCGGATGTTTCCAGATATTT  1228
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGGAGCCGGCTCTGTGATGCAGGCCCCCGAGGAGCCGCCGCCAGACCAGGTCTTCCGGATGTTTCCAGATATTT  1258

Query 1229  GTGCCTCACACCAGAGATCATTTTTCAGAGAAAACCAACAGATCACCGTC  1278
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GTGCCTCACACCAGAGATCATTTTTCAGAGAAAACCAACAGATCACCGTC  1308