Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00875
• Subject: NM_001127363.1
• Aligned Length: 1236
• Identities: 1115
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCGGGGAAGGCGGCCGCCCCGGGCACCGCGGTGCTGCTGGTCACGGCCAACGTGGGCTCGCTCTTCGACGA  74
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGGGAAGGCGGCCGCCCCCGGCACCGCGGTCCTGCTGGTCACGGCCAACGTGGGCTCGCTCTTCGACGA  74

Query   75  CCCAGAAAACCTGCAGAAGAACTGGCTTCGGGAATTTTACCAGGTCGTGCACACACACAAGCCGCACTTCATGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct   75  CCCAGAAAACCTGCAGAAGAACTGGCTTCGGGAATTTTACCAGGTCCTGCACACACACAAGCCTCACTTCATGG  148

Query  149  CCTTGCACTGTCAGGAGTTTGGAGGGAAGAACTACGAGGCCTCCATGTCCCACGTGGACAAGTTCGTCAAAGAA  222
            ||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||
Sbjct  149  CCTTGCACTGCCAAGAATTTGGAGGGAAAAACTACGAGGCCTCCATGTCCCATGTGGACAAATTTGTCAAAGAA  222

Query  223  CTATTGTCGAGTGATGCGATGAAAGAATATAACAGGGCTCGAGTCTACCTGGATGAAAACTACAAATCCCAGGA  296
            |||.|.||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  223  CTACTATCCAGTGACGCAATGAAAGAATACAACAGGGCGCGTGTCTACCTGGATGAAAACTACAAGTCACAGGA  296

Query  297  GCACTTCACGGCACTAGGAAGCTTTTATTTTCTTCATGAGTCCTTAAAAAACATCTACCAGTTTGACTTTAAAG  370
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACACTTCACGGCACTAGGAAGCTTTTATTTTCTTCACGAATCCTTAAAAAACATCTACCAGTTTGACTTTAAAG  370

Query  371  CTAAGAAGTATAGAAAGGTCGCTGGCAAAGAGATCTACTCGGATACCTTAGAGAGCACGCCCATGCTGGAGAAG  444
            ||||||||||||.|||.|||.|||||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  371  CTAAGAAGTATAAAAAAGTCACTGGCAAGGAGATCTATTCGGACACTTTGGAGAGCACACCCATGCTGGAGAAG  444

Query  445  GAGAAGTTTCCGCAGGACTACTTCCCCGAGTGCAAATGGTCAAGAAAAGGCTTCATCCGGACGAGGTGGTGCAT  518
            ||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct  445  GAGAAGTTCCCACAGGACTACTTTCCTGAGTGCAAATGGTCAAGAAAAGGCTTCATCAGGACGCGGTGGTGCAT  518

Query  519  TGCAGACTGTGCCTTTGACTTGGTGAATATCCATCTTTTCCATGATGCTTCCAATCTGGTCGCCTGGGAAACAA  592
            |||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||..|.||.||||||||.||||
Sbjct  519  TGCTGACTGTGCCTTCGACTTGGTGAACATTCATCTTTTTCATGATGCATCCAACTTAGTGGCCTGGGAGACAA  592

Query  593  GCCCTTCCGTGTACTCGGGAATCCGGCACAAGGCACTGGGCTACGTGCTGGACAGAATCATTGATCAGCGATTC  666
            ||||.||.||||||||.||..||.||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.
Sbjct  593  GCCCCTCAGTGTACTCCGGTGTCAGGCACAAGGCTCTGGGCTATGTGCTGGACAGAATCATCGACCAGCGATTT  666

Query  667  GAGAAGGTTTCCTACTTTGTATTTGGTGATTTCAACTTCCGGCTGGATTCCAAGTCCGTCGTGGAGACGCTCTG  740
            |||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct  667  GAGAAAGTTTCCTACTTTGTCTTCGGTGATTTCAACTTCCGCCTGGATTCCAAGTCTGTCGTAGAGACACTCTG  740

Query  741  CACAAAAGCCACCATGCAGACGGTCCGGGCCGCCGACACCAATGAAGTGGTGAAGCTCATATTTCGTGAGTCGG  814
            ||||||.|||||.||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||.|||.|.||||||||.|||||.|
Sbjct  741  CACAAAGGCCACAATGCAGACAGTCCGCGCTGCTGATACCAATGAAGTTGTAAAGTTGATATTTCGGGAGTCAG  814

Query  815  ACAACGACCGGAAGGTTATGCTCCAGTTAGAAAAGAAACTCTTCGACTACTTCAACCAGGAGGTTTTCCGAGAC  888
            ||||.|||||||||||..||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||
Sbjct  815  ACAATGACCGGAAGGTCGTGCTCCAGTTGGAAAAGAAGCTCTTCGACTACTTCAACCAGGATGTCTTCCGGGAC  888

Query  889  AACAACGGCACCGCGCTCTTGGAGTTTGACAAGGAGTTGTCTGTCTTTAAGGACAGACTGTATGAACTGGACAT  962
            |||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AACAACGGCACTGCGCTCTTGGAATTTGACAAGGAGTTGTCTGTCTTTAAGGACAGACTGTATGAACTGGACAT  962

Query  963  CTCGTTCCCTCCCAGCTACCCGTACAGTGAGGACGCCCGCCAGGGTGAGCAGTACATGAACACCCGGTGCCCAG  1036
            |||.|||||.||||||||||||||||||||||||.||.|||||||.||.||||||||||||||..|.|||||.|
Sbjct  963  CTCATTCCCCCCCAGCTACCCGTACAGTGAGGACTCCAGCCAGGGAGAACAGTACATGAACACGAGATGCCCTG  1036

Query 1037  CCTGGTGTGACCGCATCCTCATGTCCCCGTCTGCCAAGGAGCTGGTGCTGCGGTCGGAGAGCGAGGAGAAGGTT  1110
            |.||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||...|||.||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTTGGTGTGATCGCATCCTCATGTCCCTGTCTGCCAAGGAGCTGGTTCTTAAGTCAGAGAGCGAGGAGAAGGTT  1110

Query 1111  GTCACCTATGACCACATTGGGCCCAACGTCTGCATGGGAGACCACAAGCCCGTGTTCCTGGCCTTCCGAATCAT  1184
            |.||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||..
Sbjct 1111  GCCACCTACGACCACATCGGGCCTAATGTCTGCATGGGAGACCACAAGCCGGTGTTCCTGGCCTTCCGAATCGC  1184

Query 1185  GCCCGGGGCAGGTAAACCTCATGCCCATGTGCACAAGTGTTGTGTCGTGCAG  1236
            .||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ACCTGGGGCAGGTAAACCTCACGCCCATGTACACAAGTGTTGTGTCGTGCAG  1236