Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00875
• Subject: NM_001321042.1
• Aligned Length: 1245
• Identities: 1016
• Gaps: 210

Alignment

Query    1  ATGGCGGGGAAGGCGGCCGCCCCGGGCACCGCGGTGCTGCTGGTCACGGCCAACGTGGGCTCGCTCTTCGACGA  74
                                                                  .|||..|         |.||
Sbjct    1  ------------------------------------------------------ATGGAAT---------ATGA  11

Query   75  CCCA----GAAAACCTGCAG--AAGAA---CTGGCTTCGGGAATTTTACCAGGTCGTGCACACACACAAGCCGC  139
            ||||    .||||     ||  |||||   |||||      ||              ||||   .||||     
Sbjct   12  CCCAACCGTAAAA-----AGGAAAGAAATTCTGGC------AA--------------GCAC---TACAA-----  52

Query  140  ACTTCATGGCCTTGCACTGTCAGGAGTTTGGAGGGAAGAACTACGAGGCCTCCATGTCCCACGTGGACAAGTTC  213
                |||||                   |||||    |||||..||||.|...|||  |||.||   ||||...
Sbjct   53  ----CATGG-------------------TGGAG----GAACTTGGAGGACATTATG--CCAAGT---CAAGCCT  94

Query  214  GTCAAAGAACTATTGTCGAGTGATGCGATGAAAGAATATAACAGGGCTCGAGTCTACCTGGATGAAAACTACAA  287
            ||||.|||                               ||||     |||                       
Sbjct   95  GTCACAGA-------------------------------AACA-----CGA-----------------------  109

Query  288  ATCCCAGGAGCACTTCACGGCACTAGGAAGCTTTTATTTTCTTCATGAGTCCTTAAAAAACATCTACCAGTTTG  361
                          .||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  110  --------------ACATGGCACTAGGAAGCTTTTATTTTCTTCATGAGTCCTTAAAAAACATCTACCAGTTTG  169

Query  362  ACTTTAAAGCTAAGAAGTATAGAAAGGTCGCTGGCAAAGAGATCTACTCGGATACCTTAGAGAGCACGCCCATG  435
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  170  ACTTTAAAGCTAAGAAGTATAGAAAGGTCGCTGGCAAAGAGATCTACTCGGATACCTTAGAGAGCACGCCCATG  243

Query  436  CTGGAGAAGGAGAAGTTTCCGCAGGACTACTTCCCCGAGTGCAAATGGTCAAGAAAAGGCTTCATCCGGACGAG  509
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  244  CTGGAGAAGGAGAAGTTTCCGCAGGACTACTTCCCCGAGTGCAAATGGTCAAGAAAAGGCTTCATCCGGACGAG  317

Query  510  GTGGTGCATTGCAGACTGTGCCTTTGACTTGGTGAATATCCATCTTTTCCATGATGCTTCCAATCTGGTCGCCT  583
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  318  GTGGTGCATTGCAGACTGTGCCTTTGACTTGGTGAATATCCATCTTTTCCATGATGCTTCCAATCTGGTCGCCT  391

Query  584  GGGAAACAAGCCCTTCCGTGTACTCGGGAATCCGGCACAAGGCACTGGGCTACGTGCTGGACAGAATCATTGAT  657
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  392  GGGAAACAAGCCCTTCCGTGTACTCGGGAATCCGGCACAAGGCACTGGGCTACGTGCTGGACAGAATCATTGAT  465

Query  658  CAGCGATTCGAGAAGGTTTCCTACTTTGTATTTGGTGATTTCAACTTCCGGCTGGATTCCAAGTCCGTCGTGGA  731
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  466  CAGCGATTCGAGAAGGTTTCCTACTTTGTATTTGGTGATTTCAACTTCCGGCTGGATTCCAAGTCCGTCGTGGA  539

Query  732  GACGCTCTGCACAAAAGCCACCATGCAGACGGTCCGGGCCGCCGACACCAATGAAGTGGTGAAGCTCATATTTC  805
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  540  GACGCTCTGCACAAAAGCCACCATGCAGACGGTCCGGGCCGCCGACACCAATGAAGTGGTGAAGCTCATATTTC  613

Query  806  GTGAGTCGGACAACGACCGGAAGGTTATGCTCCAGTTAGAAAAGAAACTCTTCGACTACTTCAACCAGGAGGTT  879
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  614  GTGAGTCGGACAACGACCGGAAGGTTATGCTCCAGTTAGAAAAGAAACTCTTCGACTACTTCAACCAGGAGGTT  687

Query  880  TTCCGAGACAACAACGGCACCGCGCTCTTGGAGTTTGACAAGGAGTTGTCTGTCTTTAAGGACAGACTGTATGA  953
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  688  TTCCGAGACAACAACGGCACCGCGCTCTTGGAGTTTGACAAGGAGTTGTCTGTCTTTAAGGACAGACTGTATGA  761

Query  954  ACTGGACATCTCGTTCCCTCCCAGCTACCCGTACAGTGAGGACGCCCGCCAGGGTGAGCAGTACATGAACACCC  1027
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  762  ACTGGACATCTCGTTCCCTCCCAGCTACCCGTACAGTGAGGACGCCCGCCAGGGTGAGCAGTACATGAACACCC  835

Query 1028  GGTGCCCAGCCTGGTGTGACCGCATCCTCATGTCCCCGTCTGCCAAGGAGCTGGTGCTGCGGTCGGAGAGCGAG  1101
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  836  GGTGCCCAGCCTGGTGTGACCGCATCCTCATGTCCCCGTCTGCCAAGGAGCTGGTGCTGCGGTCGGAGAGCGAG  909

Query 1102  GAGAAGGTTGTCACCTATGACCACATTGGGCCCAACGTCTGCATGGGAGACCACAAGCCCGTGTTCCTGGCCTT  1175
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  910  GAGAAGGTTGTCACCTATGACCACATTGGGCCCAACGTCTGCATGGGAGACCACAAGCCCGTGTTCCTGGCCTT  983

Query 1176  CCGAATCATGCCCGGGGCAGGTAAACCTCATGCCCATGTGCACAAGTGTTGTGTCGTGCAG  1236
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  984  CCGAATCATGCCCGGGGCAGGTAAACCTCATGCCCATGTGCACAAGTGTTGTGTCGTGCAG  1044