Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_00875
- Subject:
- NM_183144.3
- Aligned Length:
- 1275
- Identities:
- 1101
- Gaps:
- 48
Alignment
Query 1 ATGGCGGGGAAGGCGGCCGCCCCGGGCACCGCGGTGCTGCTGGTCACGGCCAACGTGGGCTCGCTCTTCGACGA 74
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGGGGAAGGCGGCCGCCCCCGGCACCGCGGTCCTGCTGGTCACGGCCAACGTGGGCTCGCTCTTCGACGA 74
Query 75 CCCAGAAAACCTGCAGAAGAACTGGCTTCGGGAATTTTACCAGGTCGTGCACACACACAAGCCGCACTTCATGG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 75 CCCAGAAAACCTGCAGAAGAACTGGCTTCGGGAATTTTACCAGGTCCTGCACACACACAAGCCTCACTTCATGG 148
Query 149 CCTTGCACTGTCAGGAGTTTGGAGGGAAGAACTACGAGGCCTCCATGTCCCACGTGGACAAGTTCGTCAAAGAA 222
||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||
Sbjct 149 CCTTGCACTGCCAAGAATTTGGAGGGAAAAACTACGAGGCCTCCATGTCCCATGTGGACAAATTTGTCAAAGAA 222
Query 223 CTATTGTCGAGTGATGCGATGAAAGAATATAACAGGGCTCGAGTCTACCTGGATGAAAACTACAAATCCCAGGA 296
|||.|.||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 223 CTACTATCCAGTGACGCAATGAAAGAATACAACAGGGCGCGTGTCTACCTGGATGAAAACTACAAGTCACAGGA 296
Query 297 GCACTTCACGGCACTAGGAAGCTTTTATTTTCTTCATGAGTCCTTAAAAAACATCTACCAGTTTGACTTTAAAG 370
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ACACTTCACGGCACTAGGAAGCTTTTATTTTCTTCACGAATCCTTAAAAAACATCTACCAGTTTGACTTTAAAG 370
Query 371 CTAAGAAGTATAGAAAGGTCGCTGGCAAAGAGATCTACTCGGATACCTTAGAGAGCACGCCCATGCTGGAGAAG 444
||||||||||||.|||.|||.|||||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 371 CTAAGAAGTATAAAAAAGTCACTGGCAAGGAGATCTATTCGGACACTTTGGAGAGCACACCCATGCTGGAGAAG 444
Query 445 GAGAAGTTTCCGCAGGACTACTTCCCCGAGTGCAAATGGTCAAGAAAAGGCTTCATCCGGACGAGGTGGTGCAT 518
||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 445 GAGAAGTTCCCACAGGACTACTTTCCTGAGTGCAAATGGTCAAGAAAAGGCTTCATCAGGACGCGGTGGTGCAT 518
Query 519 TGCAGACTGTGCCTTTGACTTGGTGAATATCCATCTTTTCCATGATGCTTCCAATCTGGTCGCCTGGGAAACAA 592
|||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||..|.||.||||||||.||||
Sbjct 519 TGCTGACTGTGCCTTCGACTTGGTGAACATTCATCTTTTTCATGATGCATCCAACTTAGTGGCCTGGGAGACAA 592
Query 593 GCCCTTCCGTGTACTCGGGAATCCGGCACAAGGCACTGGGCTACGTGCTGGACAGAATCATTGATCAGCGATTC 666
||||.||.||||||||.||..||.||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.
Sbjct 593 GCCCCTCAGTGTACTCCGGTGTCAGGCACAAGGCTCTGGGCTATGTGCTGGACAGAATCATCGACCAGCGATTT 666
Query 667 GAGAAGGTTTCCTACTTTGTATTTGGTGATTTCAACTTCCGGCTGGATTCCAAGTCCGTCGTGGAGACGCTCTG 740
|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct 667 GAGAAAGTTTCCTACTTTGTCTTCGGTGATTTCAACTTCCGCCTGGATTCCAAGTCTGTCGTAGAGACACTCTG 740
Query 741 CACAAAAGCCACCATGCAGACGGTCCGGGCCGCCGACACCAATGAAGTGGTGAAGCTCATATTTCGTGAGTCGG 814
||||||.|||||.||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||.|||.|.||||||||.|||||.|
Sbjct 741 CACAAAGGCCACAATGCAGACAGTCCGCGCTGCTGATACCAATGAAGTTGTAAAGTTGATATTTCGGGAGTCAG 814
Query 815 ACAACGACCGGAAGGTTATGCTCCAGTTAGAAAAGAAACTCTTCGACTACTTCAACCAGGAGGTTTTCCGAGAC 888
||||.|||||||||||..||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||
Sbjct 815 ACAATGACCGGAAGGTCGTGCTCCAGTTGGAAAAGAAGCTCTTCGACTACTTCAACCAGGATGTCTTCCGGGAC 888
Query 889 AACAACGGCACCGCGCTCTTGGAGTTTGACAAGGAGTTGTCTGTCTTTAAGGACAGACTGTATGAACTGGACAT 962
|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AACAACGGCACTGCGCTCTTGGAATTTGACAAGGAGTTGTCTGTCTTTAAGGACAGACTGTATGAACTGGACAT 962
Query 963 CTCGTTCCCTCCCAGCTACCCGTACAGTGAGGACGCCCGCCAGGGTGAGCAGTACATGAACACCCGGTGCCCAG 1036
|||.|||||.||||||||||||||||||||||||.||.|||||||.||.||||||||||||||..|.|||||.|
Sbjct 963 CTCATTCCCCCCCAGCTACCCGTACAGTGAGGACTCCAGCCAGGGAGAACAGTACATGAACACGAGATGCCCTG 1036
Query 1037 CCTGGTGTGACCGCATCCTCATGTCCCCGTCTGCCAAGGAGCTGGTGCTGCGGTCGGAGAGCGAGGAGAAGGTT 1110
|.||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||...|||.||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTTGGTGTGATCGCATCCTCATGTCCCTGTCTGCCAAGGAGCTGGTTCTTAAGTCAGAGAGCGAGGAGAAGGTT 1110
Query 1111 GTCACCTATGACCACATTGGGCCCAACGTCTGCATGGGAGACCACAAGCCCGTGTTCCTGGCCTTCCGAATCAT 1184
|.||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||..
Sbjct 1111 GCCACCTACGACCACATCGGGCCTAATGTCTGCATGGGAGACCACAAGCCGGTGTTCCTGGCCTTCCGAATCGC 1184
Query 1185 GCCCGGGGCAGGTA-----------------------AACCTC---ATGC--CCATGT-GCACAAGTGTTGTGT 1229
.||.||||||||.| |.|||| |.|| ||.||| || |||||
Sbjct 1185 ACCTGGGGCAGGGAAGAGGTGCCAGCGCCGCGAGAGGATCCTCGAGAGGCCTCCCTGTAGC---AGTGT----- 1250
Query 1230 CGTGCAG---------- 1236
.|.||.
Sbjct 1251 -ATCCAACTCATCCTCC 1266