Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00875
• Subject: XM_017016204.1
• Aligned Length: 1248
• Identities: 1024
• Gaps: 198

Alignment

Query    1  ATGGCGGGGAAGGCGGCCGCCCCGGGCACCGCGGTGCTGCTGGTCACGGCCAACGTGGGCTCGCTCTTCGACG-  73
                                                                                  |.| 
Sbjct    1  ----------------------------------------------------------------------ATGA  4

Query   74  -ACCCAGAAAACCTGCAGAAGAACTGGCTTCGGGAATT--TTAC--CAGG---TCGTGCACACACACAAGCCGC  139
             |.|.|.|||.||  |||.||.|    ||||..|||.|  |.||  ||||   ..||||         ||||||
Sbjct    5  AAACTACAAATCC--CAGGAGCA----CTTCACGAAATGGTAACCGCAGGGGACGGTGC---------AGCCGC  63

Query  140  A-CTT-CATGGCCTTGCACTGTCAGGAGTTTGGAGGGAAGAACTACGAGGCCTCCATGTCCCACGTGGACAAGT  211
            | ||| |.||.||                |||||||.|                 |||||              
Sbjct   64  ATCTTCCGTGTCC----------------TTGGAGGAA-----------------ATGTC--------------  90

Query  212  TCGTCAAAGAACTATTGTCGAGTGATGCGATGAAAGAATATAACAGGGCTCGAGTC-TACCTGGATGAAAACTA  284
                                              ||.|||           |.||| ||||.||  .|||   |
Sbjct   91  ----------------------------------AGCATA-----------GGGTCTTACCCGG--CAAA---A  114

Query  285  CAAATCCCAGGAGCACTTCACGGCACTAGGAAGCTTTTATTTTCTTCATGAGTCCTTAAAAAACATCTACCAGT  358
            ||..|||.|.||    ||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  115  CATCTCCTAAGA----TTGAAGGCACTAGGAAGCTTTTATTTTCTTCATGAGTCCTTAAAAAACATCTACCAGT  184

Query  359  TTGACTTTAAAGCTAAGAAGTATAGAAAGGTCGCTGGCAAAGAGATCTACTCGGATACCTTAGAGAGCACGCCC  432
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  185  TTGACTTTAAAGCTAAGAAGTATAGAAAGGTCGCTGGCAAAGAGATCTACTCGGATACCTTAGAGAGCACGCCC  258

Query  433  ATGCTGGAGAAGGAGAAGTTTCCGCAGGACTACTTCCCCGAGTGCAAATGGTCAAGAAAAGGCTTCATCCGGAC  506
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  259  ATGCTGGAGAAGGAGAAGTTTCCGCAGGACTACTTCCCCGAGTGCAAATGGTCAAGAAAAGGCTTCATCCGGAC  332

Query  507  GAGGTGGTGCATTGCAGACTGTGCCTTTGACTTGGTGAATATCCATCTTTTCCATGATGCTTCCAATCTGGTCG  580
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  333  GAGGTGGTGCATTGCAGACTGTGCCTTTGACTTGGTGAATATCCATCTTTTCCATGATGCTTCCAATCTGGTCG  406

Query  581  CCTGGGAAACAAGCCCTTCCGTGTACTCGGGAATCCGGCACAAGGCACTGGGCTACGTGCTGGACAGAATCATT  654
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  407  CCTGGGAAACAAGCCCTTCCGTGTACTCGGGAATCCGGCACAAGGCACTGGGCTACGTGCTGGACAGAATCATT  480

Query  655  GATCAGCGATTCGAGAAGGTTTCCTACTTTGTATTTGGTGATTTCAACTTCCGGCTGGATTCCAAGTCCGTCGT  728
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  GATCAGCGATTCGAGAAGGTTTCCTACTTTGTATTTGGTGATTTCAACTTCCGGCTGGATTCCAAGTCCGTCGT  554

Query  729  GGAGACGCTCTGCACAAAAGCCACCATGCAGACGGTCCGGGCCGCCGACACCAATGAAGTGGTGAAGCTCATAT  802
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  555  GGAGACGCTCTGCACAAAAGCCACCATGCAGACGGTCCGGGCCGCCGACACCAATGAAGTGGTGAAGCTCATAT  628

Query  803  TTCGTGAGTCGGACAACGACCGGAAGGTTATGCTCCAGTTAGAAAAGAAACTCTTCGACTACTTCAACCAGGAG  876
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  629  TTCGTGAGTCGGACAACGACCGGAAGGTTATGCTCCAGTTAGAAAAGAAACTCTTCGACTACTTCAACCAGGAG  702

Query  877  GTTTTCCGAGACAACAACGGCACCGCGCTCTTGGAGTTTGACAAGGAGTTGTCTGTCTTTAAGGACAGACTGTA  950
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  703  GTTTTCCGAGACAACAACGGCACCGCGCTCTTGGAGTTTGACAAGGAGTTGTCTGTCTTTAAGGACAGACTGTA  776

Query  951  TGAACTGGACATCTCGTTCCCTCCCAGCTACCCGTACAGTGAGGACGCCCGCCAGGGTGAGCAGTACATGAACA  1024
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  777  TGAACTGGACATCTCGTTCCCTCCCAGCTACCCGTACAGTGAGGACGCCCGCCAGGGTGAGCAGTACATGAACA  850

Query 1025  CCCGGTGCCCAGCCTGGTGTGACCGCATCCTCATGTCCCCGTCTGCCAAGGAGCTGGTGCTGCGGTCGGAGAGC  1098
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  851  CCCGGTGCCCAGCCTGGTGTGACCGCATCCTCATGTCCCCGTCTGCCAAGGAGCTGGTGCTGCGGTCGGAGAGC  924

Query 1099  GAGGAGAAGGTTGTCACCTATGACCACATTGGGCCCAACGTCTGCATGGGAGACCACAAGCCCGTGTTCCTGGC  1172
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  925  GAGGAGAAGGTTGTCACCTATGACCACATTGGGCCCAACGTCTGCATGGGAGACCACAAGCCCGTGTTCCTGGC  998

Query 1173  CTTCCGAATCATGCCCGGGGCAGGTAAACCTCATGCCCATGTGCACAAGTGTTGTGTCGTGCAG  1236
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  999  CTTCCGAATCATGCCCGGGGCAGGTAAACCTCATGCCCATGTGCACAAGTGTTGTGTCGTGCAG  1062