Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00882
• Subject: NM_005544.2
• Aligned Length: 3726
• Identities: 3726
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCGAGCCCTCCGGAGAGCGATGGCTTCTCGGACGTGCGCAAGGTGGGCTACCTGCGCAAACCCAAGAGCAT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGAGCCCTCCGGAGAGCGATGGCTTCTCGGACGTGCGCAAGGTGGGCTACCTGCGCAAACCCAAGAGCAT  74

Query   75  GCACAAACGCTTCTTCGTACTGCGCGCGGCCAGCGAGGCTGGGGGCCCGGCGCGCCTCGAGTACTACGAGAACG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCACAAACGCTTCTTCGTACTGCGCGCGGCCAGCGAGGCTGGGGGCCCGGCGCGCCTCGAGTACTACGAGAACG  148

Query  149  AGAAGAAGTGGCGGCACAAGTCGAGCGCCCCCAAACGCTCGATCCCCCTTGAGAGCTGCTTCAACATCAACAAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGAAGAAGTGGCGGCACAAGTCGAGCGCCCCCAAACGCTCGATCCCCCTTGAGAGCTGCTTCAACATCAACAAG  222

Query  223  CGGGCTGACTCCAAGAACAAGCACCTGGTGGCTCTCTACACCCGGGACGAGCACTTTGCCATCGCGGCGGACAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGGGCTGACTCCAAGAACAAGCACCTGGTGGCTCTCTACACCCGGGACGAGCACTTTGCCATCGCGGCGGACAG  296

Query  297  CGAGGCCGAGCAAGACAGCTGGTACCAGGCTCTCCTACAGCTGCACAACCGTGCTAAGGGCCACCACGACGGAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGAGGCCGAGCAAGACAGCTGGTACCAGGCTCTCCTACAGCTGCACAACCGTGCTAAGGGCCACCACGACGGAG  370

Query  371  CTGCGGCCCTCGGGGCGGGAGGTGGTGGGGGCAGCTGCAGCGGCAGCTCCGGCCTTGGTGAGGCTGGGGAGGAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTGCGGCCCTCGGGGCGGGAGGTGGTGGGGGCAGCTGCAGCGGCAGCTCCGGCCTTGGTGAGGCTGGGGAGGAC  444

Query  445  TTGAGCTACGGTGACGTGCCCCCAGGACCCGCATTCAAAGAGGTCTGGCAAGTGATCCTGAAGCCCAAGGGCCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTGAGCTACGGTGACGTGCCCCCAGGACCCGCATTCAAAGAGGTCTGGCAAGTGATCCTGAAGCCCAAGGGCCT  518

Query  519  GGGTCAGACAAAGAACCTGATTGGTATCTACCGCCTTTGCCTGACCAGCAAGACCATCAGCTTCGTGAAGCTGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGGTCAGACAAAGAACCTGATTGGTATCTACCGCCTTTGCCTGACCAGCAAGACCATCAGCTTCGTGAAGCTGA  592

Query  593  ACTCGGAGGCAGCGGCCGTGGTGCTGCAGCTGATGAACATCAGGCGCTGTGGCCACTCGGAAAACTTCTTCTTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACTCGGAGGCAGCGGCCGTGGTGCTGCAGCTGATGAACATCAGGCGCTGTGGCCACTCGGAAAACTTCTTCTTC  666

Query  667  ATCGAGGTGGGCCGTTCTGCCGTGACGGGGCCCGGGGAGTTCTGGATGCAGGTGGATGACTCTGTGGTGGCCCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATCGAGGTGGGCCGTTCTGCCGTGACGGGGCCCGGGGAGTTCTGGATGCAGGTGGATGACTCTGTGGTGGCCCA  740

Query  741  GAACATGCACGAGACCATCCTGGAGGCCATGCGGGCCATGAGTGATGAGTTCCGCCCTCGCAGCAAGAGCCAGT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAACATGCACGAGACCATCCTGGAGGCCATGCGGGCCATGAGTGATGAGTTCCGCCCTCGCAGCAAGAGCCAGT  814

Query  815  CCTCGTCCAACTGCTCTAACCCCATCAGCGTCCCCCTGCGCCGGCACCATCTCAACAATCCCCCGCCCAGCCAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCTCGTCCAACTGCTCTAACCCCATCAGCGTCCCCCTGCGCCGGCACCATCTCAACAATCCCCCGCCCAGCCAG  888

Query  889  GTGGGGCTGACCCGCCGATCACGCACTGAGAGCATCACCGCCACCTCCCCGGCCAGCATGGTGGGCGGGAAGCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTGGGGCTGACCCGCCGATCACGCACTGAGAGCATCACCGCCACCTCCCCGGCCAGCATGGTGGGCGGGAAGCC  962

Query  963  AGGCTCCTTCCGTGTCCGCGCCTCCAGTGACGGCGAAGGCACCATGTCCCGCCCAGCCTCGGTGGACGGCAGCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGGCTCCTTCCGTGTCCGCGCCTCCAGTGACGGCGAAGGCACCATGTCCCGCCCAGCCTCGGTGGACGGCAGCC  1036

Query 1037  CTGTGAGTCCCAGCACCAACAGAACCCACGCCCACCGGCATCGGGGCAGCGCCCGGCTGCACCCCCCGCTCAAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTGTGAGTCCCAGCACCAACAGAACCCACGCCCACCGGCATCGGGGCAGCGCCCGGCTGCACCCCCCGCTCAAC  1110

Query 1111  CACAGCCGCTCCATCCCCATGCCGGCTTCCCGCTGCTCGCCTTCGGCCACCAGCCCGGTCAGTCTGTCGTCCAG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CACAGCCGCTCCATCCCCATGCCGGCTTCCCGCTGCTCGCCTTCGGCCACCAGCCCGGTCAGTCTGTCGTCCAG  1184

Query 1185  TAGCACCAGTGGCCATGGCTCCACCTCGGATTGTCTCTTCCCACGGCGATCTAGTGCTTCGGTGTCTGGTTCCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TAGCACCAGTGGCCATGGCTCCACCTCGGATTGTCTCTTCCCACGGCGATCTAGTGCTTCGGTGTCTGGTTCCC  1258

Query 1259  CCAGCGATGGCGGTTTCATCTCCTCGGATGAGTATGGCTCCAGTCCCTGCGATTTCCGGAGTTCCTTCCGCAGT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCAGCGATGGCGGTTTCATCTCCTCGGATGAGTATGGCTCCAGTCCCTGCGATTTCCGGAGTTCCTTCCGCAGT  1332

Query 1333  GTCACTCCGGATTCCCTGGGCCACACCCCACCAGCCCGCGGTGAGGAGGAGCTAAGCAACTATATCTGCATGGG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTCACTCCGGATTCCCTGGGCCACACCCCACCAGCCCGCGGTGAGGAGGAGCTAAGCAACTATATCTGCATGGG  1406

Query 1407  TGGCAAGGGGCCCTCCACCCTGACCGCCCCCAACGGTCACTACATTTTGTCTCGGGGTGGCAATGGCCACCGCT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGGCAAGGGGCCCTCCACCCTGACCGCCCCCAACGGTCACTACATTTTGTCTCGGGGTGGCAATGGCCACCGCT  1480

Query 1481  GCACCCCAGGAACAGGCTTGGGCACGAGTCCAGCCTTGGCTGGGGATGAAGCAGCCAGTGCTGCAGATCTGGAT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GCACCCCAGGAACAGGCTTGGGCACGAGTCCAGCCTTGGCTGGGGATGAAGCAGCCAGTGCTGCAGATCTGGAT  1554

Query 1555  AATCGGTTCCGAAAGAGAACTCACTCGGCAGGCACATCCCCTACCATTACCCACCAGAAGACCCCGTCCCAGTC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AATCGGTTCCGAAAGAGAACTCACTCGGCAGGCACATCCCCTACCATTACCCACCAGAAGACCCCGTCCCAGTC  1628

Query 1629  CTCAGTGGCTTCCATTGAGGAGTACACAGAGATGATGCCTGCCTACCCACCAGGAGGTGGCAGTGGAGGCCGAC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CTCAGTGGCTTCCATTGAGGAGTACACAGAGATGATGCCTGCCTACCCACCAGGAGGTGGCAGTGGAGGCCGAC  1702

Query 1703  TGCCGGGACACAGGCACTCCGCCTTCGTGCCCACCCGCTCCTACCCAGAGGAGGGTCTGGAAATGCACCCCTTG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TGCCGGGACACAGGCACTCCGCCTTCGTGCCCACCCGCTCCTACCCAGAGGAGGGTCTGGAAATGCACCCCTTG  1776

Query 1777  GAGCGTCGGGGGGGGCACCACCGCCCAGACAGCTCCACCCTCCACACGGATGATGGCTACATGCCCATGTCCCC  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GAGCGTCGGGGGGGGCACCACCGCCCAGACAGCTCCACCCTCCACACGGATGATGGCTACATGCCCATGTCCCC  1850

Query 1851  AGGGGTGGCCCCAGTGCCCAGTGGCCGAAAGGGCAGTGGAGACTATATGCCCATGAGCCCCAAGAGCGTATCTG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AGGGGTGGCCCCAGTGCCCAGTGGCCGAAAGGGCAGTGGAGACTATATGCCCATGAGCCCCAAGAGCGTATCTG  1924

Query 1925  CCCCACAGCAGATCATCAATCCCATCAGACGCCATCCCCAGAGAGTGGACCCCAATGGCTACATGATGATGTCC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CCCCACAGCAGATCATCAATCCCATCAGACGCCATCCCCAGAGAGTGGACCCCAATGGCTACATGATGATGTCC  1998

Query 1999  CCCAGCGGTGGCTGCTCTCCTGACATTGGAGGTGGCCCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACGCCGTCCCTTC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CCCAGCGGTGGCTGCTCTCCTGACATTGGAGGTGGCCCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACGCCGTCCCTTC  2072

Query 2073  CGGGACCAGCTATGGAAAGCTGTGGACAAACGGGGTAGGGGGCCACCACTCTCATGTCTTGCCTCACCCCAAAC  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CGGGACCAGCTATGGAAAGCTGTGGACAAACGGGGTAGGGGGCCACCACTCTCATGTCTTGCCTCACCCCAAAC  2146

Query 2147  CCCCAGTGGAGAGCAGCGGTGGTAAGCTCTTACCTTGCACAGGTGACTACATGAACATGTCACCAGTGGGGGAC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CCCCAGTGGAGAGCAGCGGTGGTAAGCTCTTACCTTGCACAGGTGACTACATGAACATGTCACCAGTGGGGGAC  2220

Query 2221  TCCAACACCAGCAGCCCCTCCGACTGCTACTACGGCCCTGAGGACCCCCAGCACAAGCCAGTCCTCTCCTACTA  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  TCCAACACCAGCAGCCCCTCCGACTGCTACTACGGCCCTGAGGACCCCCAGCACAAGCCAGTCCTCTCCTACTA  2294

Query 2295  CTCATTGCCAAGATCCTTTAAGCACACCCAGCGCCCCGGGGAGCCGGAGGAGGGTGCCCGGCATCAGCACCTCC  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CTCATTGCCAAGATCCTTTAAGCACACCCAGCGCCCCGGGGAGCCGGAGGAGGGTGCCCGGCATCAGCACCTCC  2368

Query 2369  GCCTTTCCACTAGCTCTGGTCGCCTTCTCTATGCTGCAACAGCAGATGATTCTTCCTCTTCCACCAGCAGCGAC  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  GCCTTTCCACTAGCTCTGGTCGCCTTCTCTATGCTGCAACAGCAGATGATTCTTCCTCTTCCACCAGCAGCGAC  2442

Query 2443  AGCCTGGGTGGGGGATACTGCGGGGCTAGGCTGGAGCCCAGCCTTCCACATCCCCACCATCAGGTTCTGCAGCC  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  AGCCTGGGTGGGGGATACTGCGGGGCTAGGCTGGAGCCCAGCCTTCCACATCCCCACCATCAGGTTCTGCAGCC  2516

Query 2517  CCATCTGCCTCGAAAGGTGGACACAGCTGCTCAGACCAATAGCCGCCTGGCCCGGCCCACGAGGCTGTCCCTGG  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  CCATCTGCCTCGAAAGGTGGACACAGCTGCTCAGACCAATAGCCGCCTGGCCCGGCCCACGAGGCTGTCCCTGG  2590

Query 2591  GGGATCCCAAGGCCAGCACCTTACCTCGGGCCCGAGAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCCTTGCTGCACCCTCCA  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  GGGATCCCAAGGCCAGCACCTTACCTCGGGCCCGAGAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCCTTGCTGCACCCTCCA  2664

Query 2665  GAGCCCAAGAGCCCGGGGGAATATGTCAATATTGAATTTGGGAGTGATCAGTCTGGCTACTTGTCTGGCCCGGT  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  GAGCCCAAGAGCCCGGGGGAATATGTCAATATTGAATTTGGGAGTGATCAGTCTGGCTACTTGTCTGGCCCGGT  2738

Query 2739  GGCTTTCCACAGCTCACCTTCTGTCAGGTGTCCATCCCAGCTCCAGCCAGCTCCCAGAGAGGAAGAGACTGGCA  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  GGCTTTCCACAGCTCACCTTCTGTCAGGTGTCCATCCCAGCTCCAGCCAGCTCCCAGAGAGGAAGAGACTGGCA  2812

Query 2813  CTGAGGAGTACATGAAGATGGACCTGGGGCCGGGCCGGAGGGCAGCCTGGCAGGAGAGCACTGGGGTCGAGATG  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  CTGAGGAGTACATGAAGATGGACCTGGGGCCGGGCCGGAGGGCAGCCTGGCAGGAGAGCACTGGGGTCGAGATG  2886

Query 2887  GGCAGACTGGGCCCTGCACCTCCCGGGGCTGCTAGCATTTGCAGGCCTACCCGGGCAGTGCCCAGCAGCCGGGG  2960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  GGCAGACTGGGCCCTGCACCTCCCGGGGCTGCTAGCATTTGCAGGCCTACCCGGGCAGTGCCCAGCAGCCGGGG  2960

Query 2961  TGACTACATGACCATGCAGATGAGTTGTCCCCGTCAGAGCTACGTGGACACCTCGCCAGCTGCCCCTGTAAGCT  3034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  TGACTACATGACCATGCAGATGAGTTGTCCCCGTCAGAGCTACGTGGACACCTCGCCAGCTGCCCCTGTAAGCT  3034

Query 3035  ATGCTGACATGCGAACAGGCATTGCTGCAGAGGAGGTGAGCCTGCCCAGGGCCACCATGGCTGCTGCCTCCTCA  3108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  ATGCTGACATGCGAACAGGCATTGCTGCAGAGGAGGTGAGCCTGCCCAGGGCCACCATGGCTGCTGCCTCCTCA  3108

Query 3109  TCCTCAGCAGCCTCTGCTTCCCCGACTGGGCCTCAAGGGGCAGCAGAGCTGGCTGCCCACTCGTCCCTGCTGGG  3182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  TCCTCAGCAGCCTCTGCTTCCCCGACTGGGCCTCAAGGGGCAGCAGAGCTGGCTGCCCACTCGTCCCTGCTGGG  3182

Query 3183  GGGCCCACAAGGACCTGGGGGCATGAGCGCCTTCACCCGGGTGAACCTCAGTCCTAACCGCAACCAGAGTGCCA  3256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183  GGGCCCACAAGGACCTGGGGGCATGAGCGCCTTCACCCGGGTGAACCTCAGTCCTAACCGCAACCAGAGTGCCA  3256

Query 3257  AAGTGATCCGTGCAGACCCACAAGGGTGCCGGCGGAGGCATAGCTCCGAGACTTTCTCCTCAACACCCAGTGCC  3330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257  AAGTGATCCGTGCAGACCCACAAGGGTGCCGGCGGAGGCATAGCTCCGAGACTTTCTCCTCAACACCCAGTGCC  3330

Query 3331  ACCCGGGTGGGCAACACAGTGCCCTTTGGAGCGGGGGCAGCAGTAGGGGGCGGTGGCGGTAGCAGCAGCAGCAG  3404
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331  ACCCGGGTGGGCAACACAGTGCCCTTTGGAGCGGGGGCAGCAGTAGGGGGCGGTGGCGGTAGCAGCAGCAGCAG  3404

Query 3405  CGAGGATGTGAAACGCCACAGCTCTGCTTCCTTTGAGAATGTGTGGCTGAGGCCTGGGGAGCTTGGGGGAGCCC  3478
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405  CGAGGATGTGAAACGCCACAGCTCTGCTTCCTTTGAGAATGTGTGGCTGAGGCCTGGGGAGCTTGGGGGAGCCC  3478

Query 3479  CCAAGGAGCCAGCCAAACTGTGTGGGGCTGCTGGGGGTTTGGAGAATGGTCTTAACTACATAGACCTGGATTTG  3552
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479  CCAAGGAGCCAGCCAAACTGTGTGGGGCTGCTGGGGGTTTGGAGAATGGTCTTAACTACATAGACCTGGATTTG  3552

Query 3553  GTCAAGGACTTCAAACAGTGCCCTCAGGAGTGCACCCCTGAACCGCAGCCTCCCCCACCCCCACCCCCTCATCA  3626
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3553  GTCAAGGACTTCAAACAGTGCCCTCAGGAGTGCACCCCTGAACCGCAGCCTCCCCCACCCCCACCCCCTCATCA  3626

Query 3627  ACCCCTGGGCAGCGGTGAGAGCAGCTCCACCCGCCGCTCAAGTGAGGATTTAAGCGCCTATGCCAGCATCAGTT  3700
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3627  ACCCCTGGGCAGCGGTGAGAGCAGCTCCACCCGCCGCTCAAGTGAGGATTTAAGCGCCTATGCCAGCATCAGTT  3700

Query 3701  TCCAGAAGCAGCCAGAGGACCGTCAG  3726
            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3701  TCCAGAAGCAGCCAGAGGACCGTCAG  3726