Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_00894
Subject:
NM_000220.5
Aligned Length:
1173
Identities:
1173
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGAATGCTTCCAGTCGGAATGTGTTTGACACGTTGATCAGGGTGTTGACAGAAAGTATGTTCAAACATCTTCG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAATGCTTCCAGTCGGAATGTGTTTGACACGTTGATCAGGGTGTTGACAGAAAGTATGTTCAAACATCTTCG  74

Query   75  GAAATGGGTCGTCACTCGCTTTTTTGGGCATTCTCGGCAAAGAGCAAGGCTAGTCTCCAAAGATGGAAGGTGCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAAATGGGTCGTCACTCGCTTTTTTGGGCATTCTCGGCAAAGAGCAAGGCTAGTCTCCAAAGATGGAAGGTGCA  148

Query  149  ACATAGAATTTGGCAATGTGGAGGCACAGTCAAGGTTTATATTCTTTGTGGACATCTGGACAACGGTACTTGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACATAGAATTTGGCAATGTGGAGGCACAGTCAAGGTTTATATTCTTTGTGGACATCTGGACAACGGTACTTGAC  222

Query  223  CTCAAGTGGAGATACAAAATGACCATTTTCATCACAGCCTTCTTGGGGAGTTGGTTTTTCTTTGGTCTCCTGTG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTCAAGTGGAGATACAAAATGACCATTTTCATCACAGCCTTCTTGGGGAGTTGGTTTTTCTTTGGTCTCCTGTG  296

Query  297  GTATGCAGTAGCGTACATTCACAAAGACCTCCCGGAATTCCATCCTTCTGCCAATCACACTCCCTGTGTGGAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GTATGCAGTAGCGTACATTCACAAAGACCTCCCGGAATTCCATCCTTCTGCCAATCACACTCCCTGTGTGGAGA  370

Query  371  ATATTAATGGCTTGACCTCAGCTTTTCTGTTTTCTCTGGAGACTCAAGTGACCATTGGATATGGATTCAGGTGT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATATTAATGGCTTGACCTCAGCTTTTCTGTTTTCTCTGGAGACTCAAGTGACCATTGGATATGGATTCAGGTGT  444

Query  445  GTGACAGAACAGTGTGCCACTGCCATTTTTCTGCTTATCTTTCAGTCTATACTTGGAGTTATAATCAATTCTTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTGACAGAACAGTGTGCCACTGCCATTTTTCTGCTTATCTTTCAGTCTATACTTGGAGTTATAATCAATTCTTT  518

Query  519  CATGTGTGGGGCCATCTTAGCCAAGATCTCCAGGCCCAAAAAACGTGCCAAGACCATTACGTTCAGCAAGAACG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CATGTGTGGGGCCATCTTAGCCAAGATCTCCAGGCCCAAAAAACGTGCCAAGACCATTACGTTCAGCAAGAACG  592

Query  593  CAGTGATCAGCAAACGGGGAGGGAAGCTTTGCCTCCTAATCCGAGTGGCTAATCTCAGGAAGAGCCTTCTTATT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAGTGATCAGCAAACGGGGAGGGAAGCTTTGCCTCCTAATCCGAGTGGCTAATCTCAGGAAGAGCCTTCTTATT  666

Query  667  GGCAGTCACATTTATGGAAAGCTTCTGAAGACCACAGTCACTCCTGAAGGAGAGACCATTATTTTGGACCAGAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGCAGTCACATTTATGGAAAGCTTCTGAAGACCACAGTCACTCCTGAAGGAGAGACCATTATTTTGGACCAGAT  740

Query  741  CAATATCAACTTTGTAGTTGACGCTGGGAATGAAAATTTATTCTTCATCTCCCCATTGACAATTTACCATGTCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAATATCAACTTTGTAGTTGACGCTGGGAATGAAAATTTATTCTTCATCTCCCCATTGACAATTTACCATGTCA  814

Query  815  TTGATCACAACAGCCCTTTCTTCCACATGGCAGCGGAGACCCTTCTCCAGCAGGACTTTGAATTAGTGGTGTTT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTGATCACAACAGCCCTTTCTTCCACATGGCAGCGGAGACCCTTCTCCAGCAGGACTTTGAATTAGTGGTGTTT  888

Query  889  TTAGATGGCACAGTGGAGTCCACCAGTGCTACCTGCCAAGTCCGGACATCCTATGTCCCAGAGGAGGTGCTTTG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTAGATGGCACAGTGGAGTCCACCAGTGCTACCTGCCAAGTCCGGACATCCTATGTCCCAGAGGAGGTGCTTTG  962

Query  963  GGGCTACCGTTTTGCTCCCATAGTATCCAAGACAAAGGAAGGGAAATACCGAGTGGATTTCCATAACTTTAGCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGGCTACCGTTTTGCTCCCATAGTATCCAAGACAAAGGAAGGGAAATACCGAGTGGATTTCCATAACTTTAGCA  1036

Query 1037  AGACAGTGGAAGTGGAGACCCCTCACTGTGCCATGTGCCTTTATAATGAGAAAGATGTTAGAGCCAGGATGAAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGACAGTGGAAGTGGAGACCCCTCACTGTGCCATGTGCCTTTATAATGAGAAAGATGTTAGAGCCAGGATGAAG  1110

Query 1111  AGAGGCTATGACAACCCCAACTTCATCTTGTCAGAAGTCAATGAAACAGATGACACCAAAATG  1173
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGAGGCTATGACAACCCCAACTTCATCTTGTCAGAAGTCAATGAAACAGATGACACCAAAATG  1173