Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00894
• Subject: NM_153765.2
• Aligned Length: 1190
• Identities: 1149
• Gaps: 40

Alignment

Query    1  ATGAATGCTTCCAGTCGGAATG-----TGTTT------------GACACGTTGATCAGGGTGTTGACAGAAAGT  57
                               |||     |||||            .|||    ||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------ATGCCAACTGTTTATCTCTGCTCTGAACA----GATCAGGGTGTTGACAGAAAGT  51

Query   58  ATGTTCAAACATCTTCGGAAATGGGTCGTCACTCGCTTTTTTGGGCATTCTCGGCAAAGAGCAAGGCTAGTCTC  131
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   52  ATGTTCAAACATCTTCGGAAATGGGTCGTCACTCGCTTTTTTGGGCATTCTCGGCAAAGAGCAAGGCTAGTCTC  125

Query  132  CAAAGATGGAAGGTGCAACATAGAATTTGGCAATGTGGAGGCACAGTCAAGGTTTATATTCTTTGTGGACATCT  205
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  126  CAAAGATGGAAGGTGCAACATAGAATTTGGCAATGTGGAGGCACAGTCAAGGTTTATATTCTTTGTGGACATCT  199

Query  206  GGACAACGGTACTTGACCTCAAGTGGAGATACAAAATGACCATTTTCATCACAGCCTTCTTGGGGAGTTGGTTT  279
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  200  GGACAACGGTACTTGACCTCAAGTGGAGATACAAAATGACCATTTTCATCACAGCCTTCTTGGGGAGTTGGTTT  273

Query  280  TTCTTTGGTCTCCTGTGGTATGCAGTAGCGTACATTCACAAAGACCTCCCGGAATTCCATCCTTCTGCCAATCA  353
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  274  TTCTTTGGTCTCCTGTGGTATGCAGTAGCGTACATTCACAAAGACCTCCCGGAATTCCATCCTTCTGCCAATCA  347

Query  354  CACTCCCTGTGTGGAGAATATTAATGGCTTGACCTCAGCTTTTCTGTTTTCTCTGGAGACTCAAGTGACCATTG  427
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  348  CACTCCCTGTGTGGAGAATATTAATGGCTTGACCTCAGCTTTTCTGTTTTCTCTGGAGACTCAAGTGACCATTG  421

Query  428  GATATGGATTCAGGTGTGTGACAGAACAGTGTGCCACTGCCATTTTTCTGCTTATCTTTCAGTCTATACTTGGA  501
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  422  GATATGGATTCAGGTGTGTGACAGAACAGTGTGCCACTGCCATTTTTCTGCTTATCTTTCAGTCTATACTTGGA  495

Query  502  GTTATAATCAATTCTTTCATGTGTGGGGCCATCTTAGCCAAGATCTCCAGGCCCAAAAAACGTGCCAAGACCAT  575
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  496  GTTATAATCAATTCTTTCATGTGTGGGGCCATCTTAGCCAAGATCTCCAGGCCCAAAAAACGTGCCAAGACCAT  569

Query  576  TACGTTCAGCAAGAACGCAGTGATCAGCAAACGGGGAGGGAAGCTTTGCCTCCTAATCCGAGTGGCTAATCTCA  649
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  570  TACGTTCAGCAAGAACGCAGTGATCAGCAAACGGGGAGGGAAGCTTTGCCTCCTAATCCGAGTGGCTAATCTCA  643

Query  650  GGAAGAGCCTTCTTATTGGCAGTCACATTTATGGAAAGCTTCTGAAGACCACAGTCACTCCTGAAGGAGAGACC  723
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  644  GGAAGAGCCTTCTTATTGGCAGTCACATTTATGGAAAGCTTCTGAAGACCACAGTCACTCCTGAAGGAGAGACC  717

Query  724  ATTATTTTGGACCAGATCAATATCAACTTTGTAGTTGACGCTGGGAATGAAAATTTATTCTTCATCTCCCCATT  797
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  718  ATTATTTTGGACCAGATCAATATCAACTTTGTAGTTGACGCTGGGAATGAAAATTTATTCTTCATCTCCCCATT  791

Query  798  GACAATTTACCATGTCATTGATCACAACAGCCCTTTCTTCCACATGGCAGCGGAGACCCTTCTCCAGCAGGACT  871
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  792  GACAATTTACCATGTCATTGATCACAACAGCCCTTTCTTCCACATGGCAGCGGAGACCCTTCTCCAGCAGGACT  865

Query  872  TTGAATTAGTGGTGTTTTTAGATGGCACAGTGGAGTCCACCAGTGCTACCTGCCAAGTCCGGACATCCTATGTC  945
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  866  TTGAATTAGTGGTGTTTTTAGATGGCACAGTGGAGTCCACCAGTGCTACCTGCCAAGTCCGGACATCCTATGTC  939

Query  946  CCAGAGGAGGTGCTTTGGGGCTACCGTTTTGCTCCCATAGTATCCAAGACAAAGGAAGGGAAATACCGAGTGGA  1019
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  940  CCAGAGGAGGTGCTTTGGGGCTACCGTTTTGCTCCCATAGTATCCAAGACAAAGGAAGGGAAATACCGAGTGGA  1013

Query 1020  TTTCCATAACTTTAGCAAGACAGTGGAAGTGGAGACCCCTCACTGTGCCATGTGCCTTTATAATGAGAAAGATG  1093
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1014  TTTCCATAACTTTAGCAAGACAGTGGAAGTGGAGACCCCTCACTGTGCCATGTGCCTTTATAATGAGAAAGATG  1087

Query 1094  TTAGAGCCAGGATGAAGAGAGGCTATGACAACCCCAACTTCATCTTGTCAGAAGTCAATGAAACAGATGACACC  1167
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1088  TTAGAGCCAGGATGAAGAGAGGCTATGACAACCCCAACTTCATCTTGTCAGAAGTCAATGAAACAGATGACACC  1161

Query 1168  AAAATG  1173
            ||||||
Sbjct 1162  AAAATG  1167