Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00894
• Subject: NM_153767.3
• Aligned Length: 1173
• Identities: 1116
• Gaps: 57

Alignment

Query    1  ATGAATGCTTCCAGTCGGAATGTGTTTGACACGTTGATCAGGGTGTTGACAGAAAGTATGTTCAAACATCTTCG  74
                                                                     |||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------------------------------------------------------ATGTTCAAACATCTTCG  17

Query   75  GAAATGGGTCGTCACTCGCTTTTTTGGGCATTCTCGGCAAAGAGCAAGGCTAGTCTCCAAAGATGGAAGGTGCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   18  GAAATGGGTCGTCACTCGCTTTTTTGGGCATTCTCGGCAAAGAGCAAGGCTAGTCTCCAAAGATGGAAGGTGCA  91

Query  149  ACATAGAATTTGGCAATGTGGAGGCACAGTCAAGGTTTATATTCTTTGTGGACATCTGGACAACGGTACTTGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   92  ACATAGAATTTGGCAATGTGGAGGCACAGTCAAGGTTTATATTCTTTGTGGACATCTGGACAACGGTACTTGAC  165

Query  223  CTCAAGTGGAGATACAAAATGACCATTTTCATCACAGCCTTCTTGGGGAGTTGGTTTTTCTTTGGTCTCCTGTG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  166  CTCAAGTGGAGATACAAAATGACCATTTTCATCACAGCCTTCTTGGGGAGTTGGTTTTTCTTTGGTCTCCTGTG  239

Query  297  GTATGCAGTAGCGTACATTCACAAAGACCTCCCGGAATTCCATCCTTCTGCCAATCACACTCCCTGTGTGGAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  240  GTATGCAGTAGCGTACATTCACAAAGACCTCCCGGAATTCCATCCTTCTGCCAATCACACTCCCTGTGTGGAGA  313

Query  371  ATATTAATGGCTTGACCTCAGCTTTTCTGTTTTCTCTGGAGACTCAAGTGACCATTGGATATGGATTCAGGTGT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  314  ATATTAATGGCTTGACCTCAGCTTTTCTGTTTTCTCTGGAGACTCAAGTGACCATTGGATATGGATTCAGGTGT  387

Query  445  GTGACAGAACAGTGTGCCACTGCCATTTTTCTGCTTATCTTTCAGTCTATACTTGGAGTTATAATCAATTCTTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  388  GTGACAGAACAGTGTGCCACTGCCATTTTTCTGCTTATCTTTCAGTCTATACTTGGAGTTATAATCAATTCTTT  461

Query  519  CATGTGTGGGGCCATCTTAGCCAAGATCTCCAGGCCCAAAAAACGTGCCAAGACCATTACGTTCAGCAAGAACG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  462  CATGTGTGGGGCCATCTTAGCCAAGATCTCCAGGCCCAAAAAACGTGCCAAGACCATTACGTTCAGCAAGAACG  535

Query  593  CAGTGATCAGCAAACGGGGAGGGAAGCTTTGCCTCCTAATCCGAGTGGCTAATCTCAGGAAGAGCCTTCTTATT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  536  CAGTGATCAGCAAACGGGGAGGGAAGCTTTGCCTCCTAATCCGAGTGGCTAATCTCAGGAAGAGCCTTCTTATT  609

Query  667  GGCAGTCACATTTATGGAAAGCTTCTGAAGACCACAGTCACTCCTGAAGGAGAGACCATTATTTTGGACCAGAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  610  GGCAGTCACATTTATGGAAAGCTTCTGAAGACCACAGTCACTCCTGAAGGAGAGACCATTATTTTGGACCAGAT  683

Query  741  CAATATCAACTTTGTAGTTGACGCTGGGAATGAAAATTTATTCTTCATCTCCCCATTGACAATTTACCATGTCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  684  CAATATCAACTTTGTAGTTGACGCTGGGAATGAAAATTTATTCTTCATCTCCCCATTGACAATTTACCATGTCA  757

Query  815  TTGATCACAACAGCCCTTTCTTCCACATGGCAGCGGAGACCCTTCTCCAGCAGGACTTTGAATTAGTGGTGTTT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  758  TTGATCACAACAGCCCTTTCTTCCACATGGCAGCGGAGACCCTTCTCCAGCAGGACTTTGAATTAGTGGTGTTT  831

Query  889  TTAGATGGCACAGTGGAGTCCACCAGTGCTACCTGCCAAGTCCGGACATCCTATGTCCCAGAGGAGGTGCTTTG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  832  TTAGATGGCACAGTGGAGTCCACCAGTGCTACCTGCCAAGTCCGGACATCCTATGTCCCAGAGGAGGTGCTTTG  905

Query  963  GGGCTACCGTTTTGCTCCCATAGTATCCAAGACAAAGGAAGGGAAATACCGAGTGGATTTCCATAACTTTAGCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  906  GGGCTACCGTTTTGCTCCCATAGTATCCAAGACAAAGGAAGGGAAATACCGAGTGGATTTCCATAACTTTAGCA  979

Query 1037  AGACAGTGGAAGTGGAGACCCCTCACTGTGCCATGTGCCTTTATAATGAGAAAGATGTTAGAGCCAGGATGAAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  980  AGACAGTGGAAGTGGAGACCCCTCACTGTGCCATGTGCCTTTATAATGAGAAAGATGTTAGAGCCAGGATGAAG  1053

Query 1111  AGAGGCTATGACAACCCCAACTTCATCTTGTCAGAAGTCAATGAAACAGATGACACCAAAATG  1173
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1054  AGAGGCTATGACAACCCCAACTTCATCTTGTCAGAAGTCAATGAAACAGATGACACCAAAATG  1116