Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00903
• Subject: XM_017321998.1
• Aligned Length: 1661
• Identities: 1316
• Gaps: 142

Alignment

Query    1  ATGGACTTCCTCATCGTCCTGGTCTGCCTCATCTTCAGCGTGCTGTCCACCATCGAGCAGTATGCCGCCCTGGC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CACGGGGACTCTCTTCTGGATGGAGATCGTGCTGGTGGTGTTCTTCGGGACGGAGTACGTGGTCCGCCTCTGGT  148
                               ||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------ATGGAGATTGTCCTTGTGGTGTTCTTTGGGACAGAATATGTGGTCCGCCTCTGGT  55

Query  149  CCGCCGGCTGCCGCAGCAAGTACGTGGGCCTCTGGGGGCGGCTGCGCTTTGCCCGGAAGCCCATTTCCATCATC  222
            |.||.||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct   56  CTGCAGGCTGCCGCAGCAAGTACGTGGGCATCTGGGGCCGGCTACGTTTTGCCCGGAAGCCCATTTCCATCATT  129

Query  223  GACCTCATCGTGGTCGTGGCCTCCATGGTGGTCCTCTGCGTGGGCTCCAAGGGGCAGGTGTTTGCCACGTCGGC  296
            ||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||.||.||
Sbjct  130  GACCTCATCGTGGTTGTAGCCTCTATGGTTGTCCTCTGCGTGGGTTCCAAAGGACAAGTGTTCGCCACATCAGC  203

Query  297  CATCAGGGGCATCCGCTTCCTGCAGATCCTGAGGATGCTACACGTCGACCGCCAGGGAGGCACCTGGAGGCTCC  370
            .||||||||.|||||||||||.|||||||||.|||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct  204  TATCAGGGGTATCCGCTTCCTTCAGATCCTGCGGATGCTGCATGTCGATCGCCAGGGGGGTACCTGGAGGCTCC  277

Query  371  TGGGCTCCGTGGTCTTCATCCACCGCCAGGAGCTGATAACCACCCTGTACATCGGCTTCCTGGGCCTCATCTTC  444
            |||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||
Sbjct  278  TGGGCTCTGTAGTCTTCATTCACCGCCAGGAGCTGATCACCACCCTGTACATTGGCTTTCTGGGCCTTATCTTC  351

Query  445  TCCTCGTACTTTGTGTACCTGGCTGAGAAGGACGCGGTGAACGAGTCAGGCCGCGTGGAGTTCGGCAGCTACGC  518
            |||||.||||||||.|||.||||||||||.||.||||||||||||||.||||||.|.|||||.|||||||||||
Sbjct  352  TCCTCCTACTTTGTCTACTTGGCTGAGAAAGATGCGGTGAACGAGTCCGGCCGCATCGAGTTTGGCAGCTACGC  425

Query  519  AGATGCGCTGTGGTGGGGGGTGGTCACAGTCACCACCATCGGCTATGGGGACAAGGTGCCCCAGACGTGGGTCG  592
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.|
Sbjct  426  AGATGCTCTGTGGTGGGGGGTGGTCACAGTCACTACCATTGGCTACGGGGATAAGGTACCTCAGACGTGGGTTG  499

Query  593  GGAAGACCATCGCCTCCTGCTTCTCTGTCTTTGCCATCTCCTTCTTTGCGCTCCCAGCGGGGATTCTTGGCTCG  666
            |||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.
Sbjct  500  GGAAGACCATCGCCTCCTGTTTCTCTGTCTTCGCCATATCCTTCTTTGCACTCCCAGCGGGGATACTTGGCTCT  573

Query  667  GGGTTTGCCCTGAAGGTGCAGCAGAAGCAGAGGCAGAAGCACTTCAACCGGCAGATCCCGGCGGCAGCCTCACT  740
            |||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct  574  GGGTTCGCGCTGAAGGTCCAGCAGAAGCAGAGGCAGAAGCACTTCAACCGGCAGATCCCAGCTGCAGCCTCACT  647

Query  741  CATTCAGACCGCATGGAGGTGCTATGCTGCCGAGAACCCCGACTCCTCCACCTGGAAGATCTACATCCGGAAGG  814
            |||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||..||||.|||||||||||..||||||||.
Sbjct  648  CATCCAGACTGCATGGAGGTGCTATGCCGCTGAGAACCCTGACTCAGCCACTTGGAAGATCTATGTCCGGAAGC  721

Query  815  CCCCCCGGAGCCACACTCTGCTGTCACCCAGCCCCAAACCCAAGAAGTCTGTGGTGGTAAAGAAAAAAAAGTTC  888
            |..|.|||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||..||||||||||.||.||||||
Sbjct  722  CTGCTCGGAGTCACACGCTTCTGTCCCCCAGCCCCAAACCTAAAAAGTCTGTCATGGTAAAGAAGAAGAAGTTC  795

Query  889  AAGCTGGACAAAGACAATGGGGTGACTCCTGGAGAGAAGATGCTCACAGTCCCCCATATCACGTGCGACCCCCC  962
            ||||||||.||.||.||||||.|||.||||||||||||||||.|||..||.||.||.|||||.|..||.|||||
Sbjct  796  AAGCTGGATAAGGATAATGGGATGAGTCCTGGAGAGAAGATGTTCAATGTTCCTCACATCACTTATGATCCCCC  869

Query  963  AGAAGAGCGGCGGCTGGACCACTTCTCTGTCGACGGCTATGACAGTTCTGTAAGGAAGAGCCCAACACTGCTGG  1036
            |||.||..||.|||..|||||.|||||..|.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  870  AGAGGATAGGAGGCCAGACCATTTCTCCATTGATGGCTATGACAGCTCAGTAAGGAAGAGCCCTACACTGCTGG  943

Query 1037  AAGTGAGCATGCCCCATTTCATGAGAACCAACAGCTTCGCCGAGGACCTGGACCTGGAAGGGGAGACTCTGCTG  1110
            ||||.||||..|||||||||.|||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  944  AAGTAAGCACACCCCATTTCTTGAGAACAAACAGCTTTGCAGAGGACCTGGACCTGGAAGGGGAGACACTGCTG  1017

Query 1111  ACACCCATCACCCACATCTCACAGCTGCGGGAACACCATCGGGCCACCATTAAGGTCATTCGACGCATGCAGTA  1184
            ||.|||||||||||..|.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||..|.|||||||||||
Sbjct 1018  ACCCCCATCACCCATGTGTCACAGCTGCGGGATCACCATCGGGCCACCATCAAGGTCATCAGGCGCATGCAGTA  1091

Query 1185  CTTTGTGGCCAAGAAGAAATTCCAGCAAGCGCGGAAGCCTTACGATGTGCGGGACGTCATTGAGCAGTACTCGC  1258
            ||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct 1092  CTTTGTAGCCAAGAAGAAATTCCAGCAAGCACGGAAGCCCTACGACGTGCGAGATGTCATCGAGCAGTACTCCC  1165

Query 1259  AGGGCCACCTCAACCTCATGGTGCGCATCAAGGAGCTGCAGAGGAGGCTGGACCAGTCCATTGGGAAGCCCTCA  1332
            ||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.
Sbjct 1166  AGGGCCACCTGAACCTTATGGTGCGCATTAAAGAACTACAGAGAAGGCTGGATCAGTCCATTGGGAAGCCATCT  1239

Query 1333  CTGTTCATCTCCGTCTCAGAAAAGAGCAAGGATCGCGGCAGCAACACGATCGGCGCCCGCCTGAACCGAGTAGA  1406
            .||||||||.||.||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||.|||||.||||||.|.||.||
Sbjct 1240  TTGTTCATCCCCATCTCAGAAAAGAGCAAAGACCGTGGCAGTAACACCATCGGTGCCCGTCTGAACAGGGTGGA  1313

Query 1407  AGACAAGGTGACGCAGCTGGACCAGAGGCTGGCACTCATCACCGACATGCTTCACCAGCTGCTCTCCTTG---C  1477
            ||||||||||||.||.|||||||||||.||||...|||||||.||||||||.|||||||||||.|||.||   |
Sbjct 1314  AGACAAGGTGACACAACTGGACCAGAGACTGGTGATCATCACAGACATGCTCCACCAGCTGCTGTCCATGCAAC  1387

Query 1478  ACGGTGG--CAGCACCCCCGGCAGCGGCGGCCCCCCCAGAGAGGGCGGGGCCCACATCAC---------CCAGC  1540
            |.|||||  ||  |||..|..||||                |||            ||||         |||||
Sbjct 1388  AAGGTGGTCCA--ACCTGCAACAGC----------------AGG------------TCACAAGTTGTAGCCAGC  1431

Query 1541  CCTGCGGCAGTGGCGGCTCCGTCGACCCTGAGCTCTTCCTGCCCAGCAACACCCTGCCCACCTACGAGCAGCTG  1614
            ..||     ..||.||||||.||.||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1432  AATG-----AAGGTGGCTCCATCAACCCTGAGCTCTTCCTACCCAGCAACAGCCTGCCCACCTACGAACAACTG  1500

Query 1615  ACCGTGCCCAGGAGGGGCCCCGATGAGGGGTCC  1647
            ||.||||||..||..|||||.||||||||.|||
Sbjct 1501  ACTGTGCCCCAGACAGGCCCTGATGAGGGTTCC  1533