Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00908
• Subject: NM_014513.2
• Aligned Length: 1198
• Identities: 781
• Gaps: 338

Alignment

Query    1  ATGTTGCTCATGGTCGTCAGCATGGCGTGTGTTGGGTTGTTCTTGGTCCAGAGGGCCGGTCCACACATGGGTGG  74
            ||||.||||||||||.||||||||||||||||||.|||.||||||.|.|||.||                    
Sbjct    1  ATGTCGCTCATGGTCATCAGCATGGCGTGTGTTGCGTTCTTCTTGCTGCAGGGG--------------------  54

Query   75  TCAGGACAAGCCCTTCCTGTCTGCCTGGCCCAGCGCTGTGGTGCCTCGCGGAGGACACGTGACTCTTCGGTGTC  148
                                  ||||||||                                            
Sbjct   55  ----------------------GCCTGGCC--------------------------------------------  62

Query  149  ACTATCGTCATAGGTTTAACAATTTCATGCTATACAAAGAAGACAGAATCCACGTTCCCATCTTCCATGGCAGA  222
                                                                                      
Sbjct   63  --------------------------------------------------------------------------  62

Query  223  ATATTCCAGGAGGGCTTCAACATGAGCCCTGTGACCACAGCACATGCAGGGAACTACACATGTCGGGGTTCACA  296
                               |||||||                                                
Sbjct   63  -------------------ACATGAG------------------------------------------------  69

Query  297  CCCACACTCCCCCACTGGGTGGTCGGCACCCAGCAACCCCATGGTGATCATGGTCACAGGAAACCACAGAAAAC  370
                                                                      |||..||.||||||||
Sbjct   70  ----------------------------------------------------------GGATTCCGCAGAAAAC  85

Query  371  CTTCCCTCCTGGCCCACCCAGGTCCCCTGGTGAAATCAGGAGAGAGAGTCATCCTGCAATGTTGGTCAGATATC  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct   86  CTTCCCTCCTGGCCCACCCAGGTCCCCTGGTGAAATCAGAAGAGACAGTCATCCTGCAATGTTGGTCAGATGTC  159

Query  445  ATGTTTGAGCACTTCTTTCTGCACAAAGAGTGGATCTCTAAGGACCCCTCACGCCTCGTTGGACAGATCCATGA  518
            |||||||||||||||.|||||||||.||||.|||..|.|||..||.|.|..||||||.|||||.||..|..|||
Sbjct  160  ATGTTTGAGCACTTCCTTCTGCACAGAGAGGGGACGTTTAACCACACTTTGCGCCTCATTGGAGAGCACATTGA  233

Query  519  TGGGGTCTCCAAGGCCAATTTCTCCATCGGTTCCATGATGCGTGCCCTTGCAGGGACCTACAGATGCTACGGTT  592
            ||||||||||||||.|||.||||||||||||..|||||..|..|.|||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  234  TGGGGTCTCCAAGGGCAACTTCTCCATCGGTCGCATGACACAAGACCTGGCAGGGACCTACAGATGCTACGGTT  307

Query  593  CTGTTACTCACACCCCCTATCAGTTGTCAGCTCCCAGTGATCCCCTGGACATCGTGGTCACAGGTCTATATGAG  666
            |||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  308  CTGTTACTCACTCCCCCTATCAGTTGTCAGCGCCCAGTGACCCTCTGGACATCGTGATCACAGGTCTATATGAG  381

Query  667  AAACCTTCTCTCTCAGCCCAGCCGGGCCCCAAGGTTCAGGCAGGAGAGAGCGTGACCTTGTCCTGTAGCTCCCG  740
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  382  AAACCTTCTCTCTCAGCCCAGCCGGGCCCCACGGTTCTGGCAGGAGAGAGCGTGACCTTGTCCTGCAGCTCCCG  455

Query  741  GAGCTCCTATGACATGTACCATCTATCCAGGGAGGGGGGAGCCCATGAACGTAGGCTCCCTGCAGTGCGCAAGG  814
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||..|||||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  456  GAGCTCCTATGACATGTACCATCTATCCAGGGAAGGGGAGGCCCATGAACGTAGGCTCCCTGCAGGGCCCAAGG  529

Query  815  TCAACAGAACATTCCAGGCAGATTTCCCTCTGGGCCCTGCCACCCACGGAGGGACCTACAGATGCTTCGGCTCT  888
            |||||||||||||||||||.||.||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  530  TCAACAGAACATTCCAGGCCGACTTTCCTCTGGACCCTGCCACCCACGGAGGGACCTACAGATGCTTCGGCTCT  603

Query  889  TTCCGTCACTCTCCCTACGAGTGGTCAGACCCGAGTGACCCACTGCTTGTTTCTGTCACAGGAAACCCTTCAAG  962
            ||||||.|||||||.||||||||||||.|..|.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.
Sbjct  604  TTCCGTGACTCTCCATACGAGTGGTCAAAGTCAAGTGACCCACTGCTTGTTTCTGTCACAGGAAACTCTTCAAA  677

Query  963  TAGTTGGCCTTCACCCACAGAACCAAGCTCCAAATCTGGTAACCTCAGACACCTGCACATTCTGATTGGGACCT  1036
            ||||||||||||||||||.||||||||||||.||.|.|||||||.|||||||||.|||.|||||||||||||||
Sbjct  678  TAGTTGGCCTTCACCCACTGAACCAAGCTCCGAAACCGGTAACCCCAGACACCTACACGTTCTGATTGGGACCT  751

Query 1037  CAGTGGTCAAAATCCCTTTCACCATCCTCCTCTTCTTTCTCCTTCATCGCTGGTGCTCCAACAAAAAAAAATGC  1110
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  752  CAGTGGTCAAACTCCCTTTCACCATCCTCCTCTTCTTTCTCCTTCATCGCTGGTGCTCCAAC-AAAAAAAATGC  824

Query 1111  TGCTGTAATGGACCAAGAGCCTGCAGGGAACAGAAG--------------------------------------  1146
            ..|||||||||||||||.||||||.||||||||||.                                      
Sbjct  825  ATCTGTAATGGACCAAGGGCCTGCGGGGAACAGAACAGTGAACAGGGAGGATTCTGATGAACAGGACCATCAGG  898

Query 1147  --------------  1146
                          
Sbjct  899  AGGTGTCATACGCA  912