Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00914
• Subject: NM_001366307.2
• Aligned Length: 1617
• Identities: 1608
• Gaps: 9

Alignment

Query    1  ATGGATGCCATGGCTAGTCCAGGGAAAGATAACTATAGAATGAAAAGTTATAAGAATAAAGCCCTAAATCCTCA  74
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------ATGGCTAGTCCAGGGAAAGATAACTATAGAATGAAAAGTTATAAGAATAAAGCCCTAAATCCTCA  65

Query   75  AGAGATGCGTAGACGAAGAGAAGAAGAAGGAATACAGCTTAGAAAACAAAAAAGAGAAGAACAGTTGTTCAAAC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   66  AGAGATGCGTAGACGAAGAGAAGAAGAAGGAATACAGCTTAGAAAACAAAAAAGAGAAGAACAGTTGTTCAAAC  139

Query  149  GCAGAAATGTCTATTTGCCCAGAAATGATGAATCTATGCTTGAAAGTCCTATACAGGATCCAGATATTAGTTCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  140  GCAGAAATGTCTATTTGCCCAGAAATGATGAATCTATGCTTGAAAGTCCTATACAGGATCCAGATATTAGTTCC  213

Query  223  ACTGTACCCATTCCAGAGGAAGAAGTTGTTACTACAGATATGGTTCAGATGATTTTTTCTAATAATGCTGATCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  214  ACTGTACCCATTCCAGAGGAAGAAGTTGTTACTACAGATATGGTTCAGATGATTTTTTCTAATAATGCTGATCA  287

Query  297  ACAGCTAACAGCAACACAGAAATTTAGAAAGCTGCTTTCTAAAGAACCTAATCCACCAATAGATCAAGTTATAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  288  ACAGCTAACAGCAACACAGAAATTTAGAAAGCTGCTTTCTAAAGAACCTAATCCACCAATAGATCAAGTTATAC  361

Query  371  AGAAACCAGGAGTTGTACAGAGATTTGTGAAATTTCTTGAAAGAAATGAAAATTGCACTTTACAATTTGAAGCT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  362  AGAAACCAGGAGTTGTACAGAGATTTGTGAAATTTCTTGAAAGAAATGAAAATTGCACTTTACAATTTGAAGCT  435

Query  445  GCATGGGCATTAACAAATATAGCATCTGGAACTTTTCTGCATACCAAGGTAGTGATTGAAACTGGGGCTGTTCC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  436  GCATGGGCATTAACAAATATAGCATCTGGAACTTTTCTGCATACCAAGGTAGTGATTGAAACTGGGGCTGTTCC  509

Query  519  GATTTTTATCAAACTTCTTAATTCTGAACATGAAGATGTTCAGGAACAGGCTGTTTGGGCACTTGGTAATATTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  510  GATTTTTATCAAACTTCTTAATTCTGAACATGAAGATGTTCAGGAACAGGCTGTTTGGGCACTTGGTAATATTG  583

Query  593  CTGGTGACAATGCAGAATGCAGAGATTTTGTTTTGAATTGTGAAATACTTCCACCTCTTTTAGAGTTATTAACA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  584  CTGGTGACAATGCAGAATGCAGAGATTTTGTTTTGAATTGTGAAATACTTCCACCTCTTTTAGAGTTATTAACA  657

Query  667  AATTCAAACAGACTCACAACAACAAGAAATGCCGTGTGGGCCCTCTCAAATTTATGTAGAGGCAAAAACCCTCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  658  AATTCAAACAGACTCACAACAACAAGAAATGCCGTGTGGGCCCTCTCAAATTTATGTAGAGGCAAAAACCCTCC  731

Query  741  TCCAAACTTTAGTAAGGTTTCACCTTGCTTAAATGTCCTGTCACGACTGTTGTTTAGCAGTGACCCAGATGTGT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  732  TCCAAACTTTAGTAAGGTTTCACCTTGCTTAAATGTCCTGTCACGACTGTTGTTTAGCAGTGACCCAGATGTGT  805

Query  815  TAGCAGACGTGTGTTGGGCCCTTTCTTATCTCTCCGATGGACCCAATGATAAAATTCAAGCAGTCATTGATTCT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  806  TAGCAGACGTGTGTTGGGCCCTTTCTTATCTCTCCGATGGACCCAATGATAAAATTCAAGCAGTCATTGATTCT  879

Query  889  GGAGTCTGTCGAAGATTGGTGGAACTTTTGATGCACAATGATTATAAAGTTGTATCACCTGCATTAAGGGCAGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  880  GGAGTCTGTCGAAGATTGGTGGAACTTTTGATGCACAATGATTATAAAGTTGTATCACCTGCATTAAGGGCAGT  953

Query  963  TGGTAATATTGTGACTGGTGATGATATTCAAACACAGGTAATTTTGAATTGTTCTGCATTACCCTGTCTCTTAC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  954  TGGTAATATTGTGACTGGTGATGATATTCAAACACAGGTAATTTTGAATTGTTCTGCATTACCCTGTCTCTTAC  1027

Query 1037  ATTTATTGAGTAGCCCAAAGGAGTCAATTAGAAAAGAAGCCTGCTGGACTGTTTCTAACATCACTGCTGGAAAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1028  ATTTATTGAGTAGCCCAAAGGAGTCAATTAGAAAAGAAGCCTGCTGGACTGTTTCTAACATCACTGCTGGAAAT  1101

Query 1111  AGAGCTCAGATTCAGGCTGTTATAGATGCAAATATTTTTCCTGTTTTGATTGAGATTCTTCAGAAAGCAGAGTT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1102  AGAGCTCAGATTCAGGCTGTTATAGATGCAAATATTTTTCCTGTTTTGATTGAGATTCTTCAGAAAGCAGAGTT  1175

Query 1185  TCGTACCAGAAAAGAAGCAGCTTGGGCTATAACTAATGCAACATCAGGAGGTACTCCAGAGCAAATAAGGTATT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1176  TCGTACCAGAAAAGAAGCAGCTTGGGCTATAACTAATGCAACATCAGGAGGTACTCCAGAGCAAATAAGGTATT  1249

Query 1259  TGGTAGCTTTAGGCTGCATTAAACCACTTTGTGATCTTTTGACTGTTATGGACTCCAAAATAGTCCAAGTGGCT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1250  TGGTAGCTTTAGGCTGCATTAAACCACTTTGTGATCTTTTGACTGTTATGGACTCCAAAATAGTCCAAGTGGCT  1323

Query 1333  TTAAATGGACTTGAAAATATTTTACGTCTTGGAGAACAAGAATCTAAGCAGAATGGAATAGGCATTAATCCATA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1324  TTAAATGGACTTGAAAATATTTTACGTCTTGGAGAACAAGAATCTAAGCAGAATGGAATAGGCATTAATCCATA  1397

Query 1407  CTGTGCTCTCATTGAAGAAGCATATGGTCTGGATAAAATTGAGTTTTTGCAAAGCCATGAAAATCAGGAAATTT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1398  CTGTGCTCTCATTGAAGAAGCATATGGTCTGGATAAAATTGAGTTTTTGCAAAGCCATGAAAATCAGGAAATTT  1471

Query 1481  ACCAGAAGGCATTTGATCTGATTGAACATTACTTTGGTGTAGAAGAAGATGACCCCAGCATTGTACCTCAGGTG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1472  ACCAGAAGGCATTTGATCTGATTGAACATTACTTTGGTGTAGAAGAAGATGACCCCAGCATTGTACCTCAGGTG  1545

Query 1555  GATGAAAACCAACAACAGTTTATATTTCAGCAGCAGGAAGCACCAATGGATGGATTTCAACTT  1617
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1546  GATGAAAACCAACAACAGTTTATATTTCAGCAGCAGGAAGCACCAATGGATGGATTTCAACTT  1608