Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_00915
Subject:
NM_001005405.3
Aligned Length:
526
Identities:
401
Gaps:
77

Alignment

Query   1  ATGGGCTGCTGTGGCTGCTCCGGAGGCTGTGGCTCCAGCTGTGGAGGCTGTGACTCCAGCTGTGGGAGCTGTGG  74
           |||||||||||||||||.||.||||||||||||||..|||||||.|||||||.||||.||.|||||.|||||||
Sbjct   1  ATGGGCTGCTGTGGCTGTTCTGGAGGCTGTGGCTCTGGCTGTGGGGGCTGTGGCTCCGGCAGTGGGGGCTGTGG  74

Query  75  CTCTGGCTGCAGGGGCTGTGGCCCCAGCTGCTGTGCACCCGTCTACTGCTGCAAGCCCGTGTGCTGCTGTGTTC  148
           |||||||||..|||||||||||.||||||||||||..|||.|.|.||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct  75  CTCTGGCTGTGGGGGCTGTGGCTCCAGCTGCTGTGTGCCCATTTGCTGCTGCAAGCCTGTGTGCTGCTGTGTGC  148

Query 149  CAGCCTGTTCCTGCTCTAGCTGTGGC----------------AAGCGGGGCTGTGGCTCCTGTGGGGGCTCCAA  206
           ||||||||||||||||.|||||||||                ||| |||||||||||||.||||||.|||||||
Sbjct 149  CAGCCTGTTCCTGCTCCAGCTGTGGCTCCTGTGGGGGCTCCAAAG-GGGGCTGTGGCTCTTGTGGGAGCTCCAA  221

Query 207  GGGAGGCTGTGGTTCTTGTGGCTGCTCCCAGTGCAGTTGCTGCAAGCCCTGCTGTTGCTCTTCAGGCTGTGGGT  280
           |||.||.|||||||||||||||||||||||||.||..|||||.|||||||||||.|.|||.|||||||||||||
Sbjct 222  GGGTGGGTGTGGTTCTTGTGGCTGCTCCCAGTCCAACTGCTGTAAGCCCTGCTGCTCCTCCTCAGGCTGTGGGT  295

Query 281  CATCCTGCTGCCAGTGCAGCTGCTGCAAGCCCTACTGCTCCCAGTGCAGCTGCTGTAAGCCCTGTTGCTCCTCC  354
           |||.|||||||||||.||||||||.|||.||||.|||||.|||.|.|||                         
Sbjct 296  CATTCTGCTGCCAGTCCAGCTGCTCCAAACCCTGCTGCTGCCAATCCAG-------------------------  344

Query 355  TCGGGTCGTGGGTCATCCTGCTGCCAATCCAGCTGCTGCAAGCCCTGCTGCT---CATCCTCAGGCTGTGGGTC  425
                            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||   .|||  |||          
Sbjct 345  -----------------CTGCTGCCAGTCCAGCTGCTGCAAGCCCTGCTGCTGCCAATC--CAG----------  389

Query 426  ATCCTGCTGCCAGTCCAGCTGCTGCAAGCCCTGCTGCTCCCAGTCCAGATGCTGTGTCCCTGTGTGCTACCAGT  499
              ||||||||||||.|||||||.||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||.|||||||.|||||
Sbjct 390  ---CTGCTGCCAGTCTAGCTGCTTCAAGCCCTGCTGCTGCCAGTCCAGCTGCTGTGTCCCCGTGTGCTGCCAGT  460

Query 500  GCAAGATC  507
           |.||||||
Sbjct 461  GTAAGATC  468