Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_00986
Subject:
NM_008564.2
Aligned Length:
905
Identities:
868
Gaps:
2

Alignment

Query   1  MAESSESFTMASSPA-QRRRGNDPLTSSPGRSSRRTDALTSSPGRDLPPFEDESEGLLGTEGPLEEEEDGEELI  73
           |||||||.. ||||| ||||..|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct   1  MAESSESLS-ASSPARQRRRISDPLTSSPGRSSRRADALTSSPGRDLPPFEDESEGLLGTEGPMEEEEDGEELI  73

Query  74  GDGMERDYRAIPELDAYEAEGLALDDEDVEELTASQREAAERAMRQRDREAGRGLGRMRRGLLYDSDEEDEERP  147
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Sbjct  74  GDGMERDYRPIPELDVYEAEGLALDDEDVEELTASQREAAERTMRQRDREAGRGLGRMRRGLLYDSSEEDEERP  147

Query 148  ARKRRQVERATEDGEEDEEMIESIENLEDLKGHSVREWVSMAGPRLEIHHRFKNFLRTHVDSHGHNVFKERISD  221
           |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 148  ARKRRHVERATEDGEEDEEMIESIENLEDLKGHSVREWVSMAGPRLEIHHRFKNFLRTHVDSHGHNVFKERISD  221

Query 222  MCKENRESLVVNYEDLAAREHVLAYFLPEAPAELLQIFDEAALEVVLAMYPKYDRITNHIHVRISHLPLVEELR  295
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Sbjct 222  MCKENRESLVVNYEDLAAREHVLAYFLPEAPAELLQIFDEAALEVVLAMYPKYDRITNHIHVRISHLPLVEELR  295

Query 296  SLRQLHLNQLIRTSGVVTSCTGVLPQLSMVKYNCNKCNFVLGPFCQSQNQEVKPGSCPECQSAGPFEVNMEETI  369
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 296  SLRQLHLNQLIRTSGVVTSCTGVLPQLSMVKYNCSKCNFVLGPFCQSQNQEVKPGSCPECQSAGPFEINMEETI  369

Query 370  YQNYQRIRIQESPGKVAAGRLPRSKDAILLADLVDSCKPGDEIELTGIYHNNYDGSLNTANGFPVFATVILANH  443
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Sbjct 370  YQNYQRIRIQESPGKVAAGRLPRSKDAILLADLVDSCKPGDEIELTGIYHNNYDGSLNTANGFPVFATIILANH  443

Query 444  VAKKDNKVAVGELTDEDVKMITSLSKDQQIGEKIFASIAPSIYGHEDIKRGLALALFGGEPKNPGGKHKVRGDI  517
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Sbjct 444  VAKKDNKVAVGELTDEDVKMITGLSKDQQIGEKIFASIAPSIYGHEDIKRGLALALFGGEPKNPGGKHKVRGDI  517

Query 518  NVLLCGDPGTAKSQFLKYIEKVSSRAIFTTGQGASAVGLTAYVQRHPVSREWTLEAGALVLADRGVCLIDEFDK  591
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Sbjct 518  NVLLCGDPGTAKSQFLKYIEKVSSRAIFTTGQGASAVGLTAYVQRHPVSREWTLEAGALVLADRGVCLIDEFDK  591

Query 592  MNDQDRTSIHEAMEQQSISISKAGIVTSLQARCTVIAAANPIGGRYDPSLTFSENVDLTEPIISRFDILCVVRD  665
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Sbjct 592  MNDQDRTSIHEAMEQQSISISKAGIVTSLQARCTVIAAANPIGGRYDPSLTFSENVDLTEPIISRFDVLCVVRD  665

Query 666  TVDPVQDEMLARFVVGSHVRHHPSNKEEEGLANGSAAEPAMPNTYGVEPLPQEVLKKYIIYAKERVHPKLNQMD  739
           ||||||||||||||||||||||||||..|||.||...|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 666  TVDPVQDEMLARFVVGSHVRHHPSNKKDEGLTNGGTLEPAMPNTYGVEPLPQEVLKKYIIYAKERVRPKLNQMD  739

Query 740  QDKVAKMYSDLRKESMATGSIPITVRHIESMIRMAEAHARIHLRDYVIEDDVNMAIRVMLESFIDTQKFSVMRS  813
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Sbjct 740  QDKVARMYSDLRKESMATGSIPITVRHIESMIRMAEAHARMHLRDYVMEDDVNMAIRVMMESFIDTQKFSVMRS  813

Query 814  MRKTFARYLSFRRDNNELLLFILKQLVAEQVTYQRNRFGAQQDTIEVPEKDLVDKARQINIHNLSAFYDSELFR  887
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Sbjct 814  MRKTFARYLSFRRDNNDLLLFILKQLVAEQVTYQRNRFGAQQDTIEIPEKDLMDKARQINIHNLSAFYDSDLFK  887

Query 888  MNKFSHDLKRKMILQQF  904
           .||||.|||||.|||||
Sbjct 888  FNKFSRDLKRKLILQQF  904