Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_00999
- Subject:
- NM_001159568.1
- Aligned Length:
- 1437
- Identities:
- 1066
- Gaps:
- 300
Alignment
Query 1 ---------------------------------------ATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGG 35
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGCAAAGGTACGATGAGCTGCCCCATTACGGCGGGATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGG 74
Query 36 AGACCCTCACGCGCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTGAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACACAGC 109
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 75 AGACCCTCACGCGCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTAAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACGCAGC 148
Query 110 ACTACGGCGCGCACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCGGCCAGTATGGGATCCGCTGTCAACGACGCCTTGAAG 183
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 149 ACTACGGCGCGCACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCAGCCAGCATGGGATCTGCTGTCAACGACGCCTTGAAA 222
Query 184 CGGGACAAGGACGCGATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTCTTTGAGAAGTGCGAGCTGGC 257
.|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AGAGACAAGGACGCAATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTTTTTGAGAAGTGCGAGCTGGC 296
Query 258 GACCTGCACTCCCCGGGAACCTGGAGTGGCTGGCGGAGACGTCTGCTCCTCCGACTCCTTCAACGAGGACATCG 331
|||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GACCTGCACTCCCCGGGAACCCGGAGTGGCCGGCGGAGACGTCTGTTCCTCTGACTCCTTCAACGAGGACATCG 370
Query 332 CGGTCTTCGCCAAGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCACTTTTTTCCTCAAATCCAGAGCTGGACAATTTGATGATA 405
||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 371 CGGTCTTCGCCAAGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCTCTTTTTTCCTCAAACCCAGAGCTGGATAATTTGATGATA 444
Query 406 CAAGCAATACAAGTACTAAGGTTTCATCTTTTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTGTGCGATAACTTCTGCCA 479
||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 445 CAAGCAATTCAAGTACTAAGGTTTCATCTTCTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTATGTGATAACTTCTGCCA 518
Query 480 CCGATACATTAGCTGTTTGAAGGGGAAAATGCCCATCGACCTCGTCATTGATGAAAGAGACGGCAGCTCCAAGT 553
|||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||
Sbjct 519 CCGGTACATTAGCTGTTTGAAGGGAAAAATGCCCATTGACCTCGTGATTGATGAGAGAGATGGAAGCTCCAAGT 592
Query 554 CAGATCATGAAGAACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCTGACCATAACCCTTCTTCTTGGCGAGACCACGAT 627
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 593 CAGATCATGAAGAACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCCGACCACAACCCTTCATCCTGGCGAGACCACGAT 666
Query 628 GATGCAACCTCAACCCACTCAGCAGGCACCCCAGGGCCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGCGGAGACAA 701
||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 667 GACGCAACCTCAACGCACTCCGCAGGCACCCCAGGACCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGTGGAGACAA 740
Query 702 CAGCAGTGAGCAAGGGGATGGTTTAGACAACAGTGTAGCTTCACCTGGTACAGGTGACGATGATGATCCGGATA 775
|||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||.|
Sbjct 741 CAGCAGTGAGCAAGGCGATGGGTTAGACAACAGCGTAGCTTCACCTGGCACAGGTGATGACGACGATCCAGACA 814
Query 776 AGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATTTTCCCCAAAGTAGCAACAAATATCATGAGAGCATGGCTCTTC 849
|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 815 AGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATATTCCCCAAAGTCGCGACAAATATCATGAGAGCGTGGCTCTTC 888
Query 850 CAGCATCTCACACATCCGTACCCTTCCGAAGAGCAGAAGAAACAGTTAGCGCAAGACACAGGACTTACAATTCT 923
||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 889 CAGCATCTCACACACCCGTACCCTTCAGAAGAACAGAAGAAACAGTTAGCGCAAGACACGGGACTGACAATTCT 962
Query 924 CCAAGTAAACAACTGGTTTATTAATGCCAGAAGAAGAATAGTACAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAG--- 994
.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GCAAGTGAACAACTGGTTTATCAATGCCAGAAGAAGAATAGTGCAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAGCAG 1036
Query 995 ------------------CAGTGAGCCAAGGAGCAGCATATAGTCCAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTTGTG 1050
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GTTTTCTTCTTGATCCTTCAGTGAGCCAAGGAGCAGCGTATAGTCCAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTTGTG 1110
Query 1051 TTGGATGGTCAGCAACACATGGGGATCCGGCCTGCA--------------------GGAC-------CTATGAG 1097
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||..|.|
Sbjct 1111 TTGGATGGTCAGCAACACATGGGGATCCGGCCTGCAGGTTTGCAGAGCATGCCAGGGGACTACGTTTCTCAGGG 1184
Query 1098 TGG---AATGGGCATGAATATGG-GCATGGATGGGCAA-TGGCACT-------ACATG---------------- 1143
||| ||||||.|||..||||| .|| |.||| |..|||| |.|||
Sbjct 1185 TGGTCCAATGGGAATGGGTATGGCCCA------GCCAAGTTACACTCCTCCCCAGATGACCCCACACCCTACTC 1252
Query 1144 -------------------------------------------------------------------------- 1143
Sbjct 1253 AGTTAAGACATGGACCCCCAATGCATTCATATTTGCCAAGCCATCCCCACCACCCAGCCATGGTGATGCACGGA 1326
Query 1144 -------------------------------------------------------------------------- 1143
Sbjct 1327 GGACCCCCTACCCACCCTGGAATGACTATGTCAGCACAGAGCCCCACAATGTTAAATTCTGTAGATCCCAATGT 1400
Query 1144 ------------------------------- 1143
Sbjct 1401 TGGCGGACAGGTTATGGACATTCATGCCCAA 1431