Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00999
• Subject: NM_001159570.2
• Aligned Length: 1179
• Identities: 1080
• Gaps: 36

Alignment

Query    1  ------------------------------------ATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGGAGA  38
                                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTTTCTGTACGATGAGCTGCCCCATTACGGCGGGATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGGAGA  74

Query   39  CCCTCACGCGCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTGAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACACAGCACT  112
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct   75  CCCTCACGCGCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTAAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACGCAGCACT  148

Query  113  ACGGCGCGCACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCGGCCAGTATGGGATCCGCTGTCAACGACGCCTTGAAGCGG  186
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||..|.
Sbjct  149  ACGGCGCGCACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCAGCCAGCATGGGATCTGCTGTCAACGACGCCTTGAAAAGA  222

Query  187  GACAAGGACGCGATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTCTTTGAGAAGTGCGAGCTGGCGAC  260
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACAAGGACGCAATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTTTTTGAGAAGTGCGAGCTGGCGAC  296

Query  261  CTGCACTCCCCGGGAACCTGGAGTGGCTGGCGGAGACGTCTGCTCCTCCGACTCCTTCAACGAGGACATCGCGG  334
            ||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTGCACTCCCCGGGAACCCGGAGTGGCCGGCGGAGACGTCTGTTCCTCTGACTCCTTCAACGAGGACATCGCGG  370

Query  335  TCTTCGCCAAGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCACTTTTTTCCTCAAATCCAGAGCTGGACAATTTGATGATACAA  408
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  371  TCTTCGCCAAGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCTCTTTTTTCCTCAAACCCAGAGCTGGATAATTTGATGATACAA  444

Query  409  GCAATACAAGTACTAAGGTTTCATCTTTTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTGTGCGATAACTTCTGCCACCG  482
            |||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  445  GCAATTCAAGTACTAAGGTTTCATCTTCTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTATGTGATAACTTCTGCCACCG  518

Query  483  ATACATTAGCTGTTTGAAGGGGAAAATGCCCATCGACCTCGTCATTGATGAAAGAGACGGCAGCTCCAAGTCAG  556
            .||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||
Sbjct  519  GTACATTAGCTGTTTGAAGGGAAAAATGCCCATTGACCTCGTGATTGATGAGAGAGATGGAAGCTCCAAGTCAG  592

Query  557  ATCATGAAGAACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCTGACCATAACCCTTCTTCTTGGCGAGACCACGATGAT  630
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct  593  ATCATGAAGAACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCCGACCACAACCCTTCATCCTGGCGAGACCACGATGAC  666

Query  631  GCAACCTCAACCCACTCAGCAGGCACCCCAGGGCCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGCGGAGACAACAG  704
            |||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  667  GCAACCTCAACGCACTCCGCAGGCACCCCAGGACCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGTGGAGACAACAG  740

Query  705  CAGTGAGCAAGGGGATGGTTTAGACAACAGTGTAGCTTCACCTGGTACAGGTGACGATGATGATCCGGATAAGG  778
            ||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||.||||
Sbjct  741  CAGTGAGCAAGGCGATGGGTTAGACAACAGCGTAGCTTCACCTGGCACAGGTGATGACGACGATCCAGACAAGG  814

Query  779  ACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATTTTCCCCAAAGTAGCAACAAATATCATGAGAGCATGGCTCTTCCAG  852
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  815  ACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATATTCCCCAAAGTCGCGACAAATATCATGAGAGCGTGGCTCTTCCAG  888

Query  853  CATCTCACACATCCGTACCCTTCCGAAGAGCAGAAGAAACAGTTAGCGCAAGACACAGGACTTACAATTCTCCA  926
            |||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||
Sbjct  889  CATCTCACACACCCGTACCCTTCAGAAGAACAGAAGAAACAGTTAGCGCAAGACACGGGACTGACAATTCTGCA  962

Query  927  AGTAAACAACTGGTTTATTAATGCCAGAAGAAGAATAGTACAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAGCAGTGA  1000
            |||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGTGAACAACTGGTTTATCAATGCCAGAAGAAGAATAGTGCAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAGCAGTGA  1036

Query 1001  GCCAAGGAGCAGCATATAGTCCAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTTGTGTTGGATGGTCAGCAACACATGGGG  1074
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCCAAGGAGCAGCGTATAGTCCAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTTGTGTTGGATGGTCAGCAACACATGGGG  1110

Query 1075  ATCCGGCCTGCAGGACCTATGAGTGGAATGGGCATGAATATGGGCATGGATGGGCAATGGCACTACATG  1143
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1111  ATCCGGCCTGCAGGACCCATGAGTGGAATGGGCATGAATATGGGCATGGATGGGCAGTGGCACTATATG  1179