Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_00999
- Subject:
- NM_001346045.1
- Aligned Length:
- 1371
- Identities:
- 1080
- Gaps:
- 228
Alignment
Query 1 ---------------------------------------ATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGG 35
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGCAAAGGTACGATGAGCTGCCCCATTACGGCGGGATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGG 74
Query 36 AGACCCTCACGCGCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTGAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACACAGC 109
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 75 AGACCCTCACGCGCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTAAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACGCAGC 148
Query 110 ACTACGGCGCGCACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCGGCCAGTATGGGATCCGCTGTCAACGACGCCTTGAAG 183
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 149 ACTACGGCGCGCACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCAGCCAGCATGGGATCTGCTGTCAACGACGCCTTGAAA 222
Query 184 CGGGACAAGGACGCGATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTCTTTGAGAAGTGCGAGCTGGC 257
.|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AGAGACAAGGACGCAATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTTTTTGAGAAGTGCGAGCTGGC 296
Query 258 GACCTGCACTCCCCGGGAACCTGGAGTGGCTGGCGGAGACGTCTGCTCCTCCGACTCCTTCAACGAGGACATCG 331
|||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GACCTGCACTCCCCGGGAACCCGGAGTGGCCGGCGGAGACGTCTGTTCCTCTGACTCCTTCAACGAGGACATCG 370
Query 332 CGGTCTTCGCCAAGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCACTTTTTTCCTCAAATCCAGAGCTGGACAATTTGATGATA 405
||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 371 CGGTCTTCGCCAAGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCTCTTTTTTCCTCAAACCCAGAGCTGGATAATTTGATGATA 444
Query 406 CAAGCAATACAAGTACTAAGGTTTCATCTTTTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTGTGCGATAACTTCTGCCA 479
||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 445 CAAGCAATTCAAGTACTAAGGTTTCATCTTCTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTATGTGATAACTTCTGCCA 518
Query 480 CCGATACATTAGCTGTTTGAAGGGGAAAATGCCCATCGACCTCGTCATTGATGAAAGAGACGGCAGCTCCAAGT 553
|||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||
Sbjct 519 CCGGTACATTAGCTGTTTGAAGGGAAAAATGCCCATTGACCTCGTGATTGATGAGAGAGATGGAAGCTCCAAGT 592
Query 554 CAGATCATGAAGAACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCTGACCATAACCCTTCTTCTTGGCGAGACCACGAT 627
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 593 CAGATCATGAAGAACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCCGACCACAACCCTTCATCCTGGCGAGACCACGAT 666
Query 628 GATGCAACCTCAACCCACTCAGCAGGCACCCCAGGGCCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGCGGAGACAA 701
||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 667 GACGCAACCTCAACGCACTCCGCAGGCACCCCAGGACCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGTGGAGACAA 740
Query 702 CAGCAGTGAGCA-------------------------------------------------------------- 713
||||||||||||
Sbjct 741 CAGCAGTGAGCAAGGCGCTTCGGAGACTGAGGCTGACCATTTACTATTGTGGAAGCCCATGACTGATCGCACAG 814
Query 714 -------------------------------------------------------------------------- 713
Sbjct 815 GATGCGTTTCAGTGCAAATGTCAAGAGAAGATAGAGAAGAAAGCAGAGAGGGAAAACACTCTCCACAACCACTT 888
Query 714 -----------------------------------------------------AGGGGATGGTTTAGACAACAG 734
|||.|||||.|||||||||||
Sbjct 889 GAAAACATCATCATTCCCTGTCAGCCGCCCTTTCGTGGGGAAAGCGAAGCTGGAGGCGATGGGTTAGACAACAG 962
Query 735 TGTAGCTTCACCTGGTACAGGTGACGATGATGATCCGGATAAGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATTT 808
.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 963 CGTAGCTTCACCTGGCACAGGTGATGACGACGATCCAGACAAGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATAT 1036
Query 809 TCCCCAAAGTAGCAACAAATATCATGAGAGCATGGCTCTTCCAGCATCTCACACATCCGTACCCTTCCGAAGAG 882
||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.
Sbjct 1037 TCCCCAAAGTCGCGACAAATATCATGAGAGCGTGGCTCTTCCAGCATCTCACACACCCGTACCCTTCAGAAGAA 1110
Query 883 CAGAAGAAACAGTTAGCGCAAGACACAGGACTTACAATTCTCCAAGTAAACAACTGGTTTATTAATGCCAGAAG 956
||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1111 CAGAAGAAACAGTTAGCGCAAGACACGGGACTGACAATTCTGCAAGTGAACAACTGGTTTATCAATGCCAGAAG 1184
Query 957 AAGAATAGTACAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAGCAGTGAGCCAAGGAGCAGCATATAGTCCAGAGGGTC 1030
|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1185 AAGAATAGTGCAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAGCAGTGAGCCAAGGAGCAGCGTATAGTCCAGAGGGTC 1258
Query 1031 AGCCCATGGGGAGCTTTGTGTTGGATGGTCAGCAACACATGGGGATCCGGCCTGCAGGACCTATGAGTGGAATG 1104
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1259 AGCCCATGGGGAGCTTTGTGTTGGATGGTCAGCAACACATGGGGATCCGGCCTGCAGGACCCATGAGTGGAATG 1332
Query 1105 GGCATGAATATGGGCATGGATGGGCAATGGCACTACATG 1143
||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1333 GGCATGAATATGGGCATGGATGGGCAGTGGCACTATATG 1371