Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_00999
- Subject:
- NM_001346055.1
- Aligned Length:
- 1164
- Identities:
- 862
- Gaps:
- 246
Alignment
Query 1 ATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGGAGACCCTCACGCGCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CCTGAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACACAGCACTACGGCGCGCACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCGG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CCAGTATGGGATCCGCTGTCAACGACGCCTTGAAGCGGGACAAGGACGCGATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CTGTTAGCTCTGGTCTTTGAGAAGTGCGAGCTGGCGACCTGCACTCCCCGGGAACCTGGAGTGGCTGGCGGAGA 296
.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 1 ---ATGGCTCTGGTTTTTGAGAAGTGCGAGCTGGCGACCTGCACTCCCCGGGAACCCGGAGTGGCCGGCGGAGA 71
Query 297 CGTCTGCTCCTCCGACTCCTTCAACGAGGACATCGCGGTCTTCGCCAAGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCACTTT 370
||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 72 CGTCTGTTCCTCTGACTCCTTCAACGAGGACATCGCGGTCTTCGCCAAGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCTCTTT 145
Query 371 TTTCCTCAAATCCAGAGCTGGACAATTTGATGATACAAGCAATACAAGTACTAAGGTTTCATCTTTTGGAGTTA 444
||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 146 TTTCCTCAAACCCAGAGCTGGATAATTTGATGATACAAGCAATTCAAGTACTAAGGTTTCATCTTCTGGAGTTA 219
Query 445 GAAAAGGTCCACGAACTGTGCGATAACTTCTGCCACCGATACATTAGCTGTTTGAAGGGGAAAATGCCCATCGA 518
|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 220 GAAAAGGTCCACGAACTATGTGATAACTTCTGCCACCGGTACATTAGCTGTTTGAAGGGAAAAATGCCCATTGA 293
Query 519 CCTCGTCATTGATGAAAGAGACGGCAGCTCCAAGTCAGATCATGAAGAACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCG 592
||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 294 CCTCGTGATTGATGAGAGAGATGGAAGCTCCAAGTCAGATCATGAAGAACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCG 367
Query 593 CTGACCATAACCCTTCTTCTTGGCGAGACCACGATGATGCAACCTCAACCCACTCAGCAGGCACCCCAGGGCCC 666
|.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 368 CCGACCACAACCCTTCATCCTGGCGAGACCACGATGACGCAACCTCAACGCACTCCGCAGGCACCCCAGGACCC 441
Query 667 TCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGCGGAGACAACAGCAGTGAGCAAGGGGATGGTTTAGACAACAGTGTAGC 740
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 442 TCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGTGGAGACAACAGCAGTGAGCAAGGCGATGGGTTAGACAACAGCGTAGC 515
Query 741 TTCACCTGGTACAGGTGACGATGATGATCCGGATAAGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATTTTCCCCA 814
|||||||||.||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 516 TTCACCTGGCACAGGTGATGACGACGATCCAGACAAGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATATTCCCCA 589
Query 815 AAGTAGCAACAAATATCATGAGAGCATGGCTCTTCCAGCATCTCACACATCCGTACCCTTCCGAAGAGCAGAAG 888
||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 590 AAGTCGCGACAAATATCATGAGAGCGTGGCTCTTCCAGCATCTCACACACCCGTACCCTTCAGAAGAACAGAAG 663
Query 889 AAACAGTTAGCGCAAGACACAGGACTTACAATTCTCCAAGTAAACAACTGGTTTATTAATGCCAGAAGAAGAAT 962
||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 664 AAACAGTTAGCGCAAGACACGGGACTGACAATTCTGCAAGTGAACAACTGGTTTATCAATGCCAGAAGAAGAAT 737
Query 963 AGTACAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAG---------------------CAGTGAGCCAAGGAGCAGCAT 1015
|||.|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||.|
Sbjct 738 AGTGCAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAGCAGGTTTTCTTCTTGATCCTTCAGTGAGCCAAGGAGCAGCGT 811
Query 1016 ATAGTCCAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTTGTGTTGGATGGTCAGCAACACATGGGGATCCGGCCTGCAGGA 1089
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 812 ATAGTCCAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTTGTGTTGGATGGTCAGCAACACATGGGGATCCGGCCTGCAGGA 885
Query 1090 CCTATGAGTGGAATGGGCATGAATATGGGCATGGATGGGCAATGGCACTACATG 1143
||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 886 CCCATGAGTGGAATGGGCATGAATATGGGCATGGATGGGCAGTGGCACTATATG 939