Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00999
• Subject: NM_172316.2
• Aligned Length: 1143
• Identities: 916
• Gaps: 225

Alignment

Query    1  ATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGGAGACCCTCACGCGCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CCTGAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACACAGCACTACGGCGCGCACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CCAGTATGGGATCCGCTGTCAACGACGCCTTGAAGCGGGACAAGGACGCGATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CTGTTAGCTCTGGTCTTTGAGAAGTGCGAGCTGGCGACCTGCACTCCCCGGGAACCTGGAGTGGCTGGCGGAGA  296
               .|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ---ATGGCTCTGGTCTTTGAGAAGTGCGAGCTGGCGACCTGCACTCCCCGGGAACCTGGAGTGGCTGGCGGAGA  71

Query  297  CGTCTGCTCCTCCGACTCCTTCAACGAGGACATCGCGGTCTTCGCCAAGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCACTTT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   72  CGTCTGCTCCTCCGACTCCTTCAACGAGGACATCGCGGTCTTCGCCAAGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCACTTT  145

Query  371  TTTCCTCAAATCCAGAGCTGGACAATTTGATGATACAAGCAATACAAGTACTAAGGTTTCATCTTTTGGAGTTA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  146  TTTCCTCAAATCCAGAGCTGGACAATTTGATGATACAAGCAATACAAGTACTAAGGTTTCATCTTTTGGAGTTA  219

Query  445  GAAAAGGTCCACGAACTGTGCGATAACTTCTGCCACCGATACATTAGCTGTTTGAAGGGGAAAATGCCCATCGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  220  GAAAAGGTCCACGAACTGTGCGATAACTTCTGCCACCGATACATTAGCTGTTTGAAGGGGAAAATGCCCATCGA  293

Query  519  CCTCGTCATTGATGAAAGAGACGGCAGCTCCAAGTCAGATCATGAAGAACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  294  CCTCGTCATTGATGAAAGAGACGGCAGCTCCAAGTCAGATCATGAAGAACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCG  367

Query  593  CTGACCATAACCCTTCTTCTTGGCGAGACCACGATGATGCAACCTCAACCCACTCAGCAGGCACCCCAGGGCCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  368  CTGACCATAACCCTTCTTCTTGGCGAGACCACGATGATGCAACCTCAACCCACTCAGCAGGCACCCCAGGGCCC  441

Query  667  TCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGCGGAGACAACAGCAGTGAGCAAGGGGATGGTTTAGACAACAGTGTAGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  442  TCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGCGGAGACAACAGCAGTGAGCAAGGGGATGGTTTAGACAACAGTGTAGC  515

Query  741  TTCACCTGGTACAGGTGACGATGATGATCCGGATAAGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATTTTCCCCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  516  TTCACCTGGTACAGGTGACGATGATGATCCGGATAAGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATTTTCCCCA  589

Query  815  AAGTAGCAACAAATATCATGAGAGCATGGCTCTTCCAGCATCTCACACATCCGTACCCTTCCGAAGAGCAGAAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  590  AAGTAGCAACAAATATCATGAGAGCATGGCTCTTCCAGCATCTCACACATCCGTACCCTTCCGAAGAGCAGAAG  663

Query  889  AAACAGTTAGCGCAAGACACAGGACTTACAATTCTCCAAGTAAACAACTGGTTTATTAATGCCAGAAGAAGAAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  664  AAACAGTTAGCGCAAGACACAGGACTTACAATTCTCCAAGTAAACAACTGGTTTATTAATGCCAGAAGAAGAAT  737

Query  963  AGTACAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAGCAGTGAGCCAAGGAGCAGCATATAGTCCAGAGGGTCAGCCCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  738  AGTACAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAGCAGTGAGCCAAGGAGCAGCATATAGTCCAGAGGGTCAGCCCA  811

Query 1037  TGGGGAGCTTTGTGTTGGATGGTCAGCAACACATGGGGATCCGGCCTGCAGGACCTATGAGTGGAATGGGCATG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  812  TGGGGAGCTTTGTGTTGGATGGTCAGCAACACATGGGGATCCGGCCTGCAGGACCTATGAGTGGAATGGGCATG  885

Query 1111  AATATGGGCATGGATGGGCAATGGCACTACATG  1143
            |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  886  AATATGGGCATGGATGGGCAATGGCACTACATG  918