Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_00999
- Subject:
- XM_017316117.1
- Aligned Length:
- 1260
- Identities:
- 1080
- Gaps:
- 117
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCCAAACATCCCCAACGCGACCCAGTTAGGCAGGAGCCAAGAGGAGTGGTGGGGAAATAAACGAGAATACGA 74
Query 1 ----------------------ATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGGAGACCCTCACGCGCCGC 52
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGAGCTGCCCCATTACGGCGGGATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGGAGACCCTCACGCGCCGC 148
Query 53 GGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTGAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACACAGCACTACGGCGCGCACGCC 126
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTAAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACGCAGCACTACGGCGCGCACGCC 222
Query 127 CCGCACCCCAATGTCATGCCGGCCAGTATGGGATCCGCTGTCAACGACGCCTTGAAGCGGGACAAGGACGCGAT 200
||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||..|.|||||||||||.||
Sbjct 223 CCGCACCCCAATGTCATGCCAGCCAGCATGGGATCTGCTGTCAACGACGCCTTGAAAAGAGACAAGGACGCAAT 296
Query 201 CTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTCTTTGAGAAGTGCGAGCTGGCGACCTGCACTCCCCGGG 274
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTTTTTGAGAAGTGCGAGCTGGCGACCTGCACTCCCCGGG 370
Query 275 AACCTGGAGTGGCTGGCGGAGACGTCTGCTCCTCCGACTCCTTCAACGAGGACATCGCGGTCTTCGCCAAGCAG 348
||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AACCCGGAGTGGCCGGCGGAGACGTCTGTTCCTCTGACTCCTTCAACGAGGACATCGCGGTCTTCGCCAAGCAG 444
Query 349 GTTCGCGCCGAAAAGCCACTTTTTTCCTCAAATCCAGAGCTGGACAATTTGATGATACAAGCAATACAAGTACT 422
|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 445 GTTCGCGCCGAAAAGCCTCTTTTTTCCTCAAACCCAGAGCTGGATAATTTGATGATACAAGCAATTCAAGTACT 518
Query 423 AAGGTTTCATCTTTTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTGTGCGATAACTTCTGCCACCGATACATTAGCTGTT 496
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 519 AAGGTTTCATCTTCTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTATGTGATAACTTCTGCCACCGGTACATTAGCTGTT 592
Query 497 TGAAGGGGAAAATGCCCATCGACCTCGTCATTGATGAAAGAGACGGCAGCTCCAAGTCAGATCATGAAGAACTT 570
|||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGAAGGGAAAAATGCCCATTGACCTCGTGATTGATGAGAGAGATGGAAGCTCCAAGTCAGATCATGAAGAACTT 666
Query 571 TCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCTGACCATAACCCTTCTTCTTGGCGAGACCACGATGATGCAACCTCAACCCA 644
|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 667 TCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCCGACCACAACCCTTCATCCTGGCGAGACCACGATGACGCAACCTCAACGCA 740
Query 645 CTCAGCAGGCACCCCAGGGCCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGCGGAGACAACAGCAGTGAGCAAGGGG 718
|||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 741 CTCCGCAGGCACCCCAGGACCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGTGGAGACAACAGCAGTGAGCAAGGCG 814
Query 719 ATGGTTTAGACAACAGTGTAGCTTCACCTGGTACAGGTGACGATGATGATCCGGATAAGGACAAAAAACGCCAG 792
||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 815 ATGGGTTAGACAACAGCGTAGCTTCACCTGGCACAGGTGATGACGACGATCCAGACAAGGACAAAAAACGCCAG 888
Query 793 AAGAAAAGAGGCATTTTCCCCAAAGTAGCAACAAATATCATGAGAGCATGGCTCTTCCAGCATCTCACACATCC 866
||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 889 AAGAAAAGAGGCATATTCCCCAAAGTCGCGACAAATATCATGAGAGCGTGGCTCTTCCAGCATCTCACACACCC 962
Query 867 GTACCCTTCCGAAGAGCAGAAGAAACAGTTAGCGCAAGACACAGGACTTACAATTCTCCAAGTAAACAACTGGT 940
|||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 963 GTACCCTTCAGAAGAACAGAAGAAACAGTTAGCGCAAGACACGGGACTGACAATTCTGCAAGTGAACAACTGGT 1036
Query 941 TTATTAATGCCAGAAGAAGAATAGTACAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAG-------------------- 994
||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TTATCAATGCCAGAAGAAGAATAGTGCAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAGCAGGTTTTCTTCTTGATCCT 1110
Query 995 -CAGTGAGCCAAGGAGCAGCATATAGTCCAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTTGTGTTGGATGGTCAGCAACA 1067
|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TCAGTGAGCCAAGGAGCAGCGTATAGTCCAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTTGTGTTGGATGGTCAGCAACA 1184
Query 1068 CATGGGGATCCGGCCTGCAGGACCTATGAGTGGAATGGGCATGAATATGGGCATGGATGGGCAATGGCACTACA 1141
||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 1185 CATGGGGATCCGGCCTGCAGGACCCATGAGTGGAATGGGCATGAATATGGGCATGGATGGGCAGTGGCACTATA 1258
Query 1142 TG 1143
||
Sbjct 1259 TG 1260