Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01008
• Subject: NM_003994.5
• Aligned Length: 819
• Identities: 735
• Gaps: 84

Alignment

Query   1  ATGAAGAAGACACAAACTTGGATTCTCACTTGCATTTATCTTCAGCTGCTCCTATTTAATCCTCTCGTCAAAAC  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGAAGAAGACACAAACTTGGATTCTCACTTGCATTTATCTTCAGCTGCTCCTATTTAATCCTCTCGTCAAAAC  74

Query  75  TGAAGGGATCTGCAGGAATCGTGTGACTAATAATGTAAAAGACGTCACTAAATTGGTGGCAAATCTTCCAAAAG  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  TGAAGGGATCTGCAGGAATCGTGTGACTAATAATGTAAAAGACGTCACTAAATTGGTGGCAAATCTTCCAAAAG  148

Query 149  ACTACATGATAACCCTCAAATATGTCCCCGGGATGGATGTTTTGCCAAGTCATTGTTGGATAAGCGAGATGGTA  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  ACTACATGATAACCCTCAAATATGTCCCCGGGATGGATGTTTTGCCAAGTCATTGTTGGATAAGCGAGATGGTA  222

Query 223  GTACAATTGTCAGACAGCTTGACTGATCTTCTGGACAAGTTTTCAAATATTTCTGAAGGCTTGAGTAATTATTC  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  GTACAATTGTCAGACAGCTTGACTGATCTTCTGGACAAGTTTTCAAATATTTCTGAAGGCTTGAGTAATTATTC  296

Query 297  CATCATAGACAAACTTGTGAATATAGTGGATGACCTTGTGGAGTGCGTGAAAGAAAACTCATCTAAGGATCTAA  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  CATCATAGACAAACTTGTGAATATAGTGGATGACCTTGTGGAGTGCGTGAAAGAAAACTCATCTAAGGATCTAA  370

Query 371  AAAAATCATTCAAGAGCCCAGAACCCAGGCTCTTTACTCCTGAAGAATTCTTTAGAATTTTTAATAGATCCATT  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  AAAAATCATTCAAGAGCCCAGAACCCAGGCTCTTTACTCCTGAAGAATTCTTTAGAATTTTTAATAGATCCATT  444

Query 445  GATGCCTTCAAGGACTTTGTAGTGGCATCTGAAACTAGTGATTGTGTGGTTTCTTCAACATTAAGTCCTGAGAA  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  GATGCCTTCAAGGACTTTGTAGTGGCATCTGAAACTAGTGATTGTGTGGTTTCTTCAACATTAAGTCCTGAGAA  518

Query 519  AGATTCCAGAGTCAGTGTCACAAAACCATTTATGTTACCCCCTGTTGCAGCCAGCTCCCTTAGGAATGACAGCA  592
           ||                                                                        
Sbjct 519  AG------------------------------------------------------------------------  520

Query 593  GTAGCAGTAATAGGAAGGCCAAAAATCCCCCTGGAGACTCCAGCCTACACTGGGCAGCCATGGCATTGCCAGCA  666
                       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 521  ------------GGAAGGCCAAAAATCCCCCTGGAGACTCCAGCCTACACTGGGCAGCCATGGCATTGCCAGCA  582

Query 667  TTGTTTTCTCTTATAATTGGCTTTGCTTTTGGAGCCTTATACTGGAAGAAGAGACAGCCAAGTCTTACAAGGGC  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 583  TTGTTTTCTCTTATAATTGGCTTTGCTTTTGGAGCCTTATACTGGAAGAAGAGACAGCCAAGTCTTACAAGGGC  656

Query 741  AGTTGAAAATATACAAATTAATGAAGAGGATAATGAGATAAGTATGTTGCAAGAGAAAGAGAGAGAGTTTCAAG  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 657  AGTTGAAAATATACAAATTAATGAAGAGGATAATGAGATAAGTATGTTGCAAGAGAAAGAGAGAGAGTTTCAAG  730

Query 815  AAGTG  819
           |||||
Sbjct 731  AAGTG  735