Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01008
• Subject: NM_013598.3
• Aligned Length: 822
• Identities: 734
• Gaps: 6

Alignment

Query   1  ATGAAGAAGACACAAACTTGGATTCTCACTTGCATTTATCTTCAGCTGCTCCTATTTAATCCTCTCGTCAAAAC  74
           ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct   1  ATGAAGAAGACACAAACTTGGATTATCACTTGCATTTATCTTCAACTGCTCCTATTTAATCCTCTTGTCAAAAC  74

Query  75  TGAAGG-GATCTGCAGGAATCGTGTGACTAATAATGTAAAAGACGTCACTAAATTGGTGGCAAATCTTCCAAAA  147
            .|||| |||||||.||||||.|||||||.||||||||||||||.|.||.|||.|||||||||||||||||||.
Sbjct  75  -CAAGGAGATCTGCGGGAATCCTGTGACTGATAATGTAAAAGACATTACAAAACTGGTGGCAAATCTTCCAAAT  147

Query 148  GACTACATGATAACCCTCAAATATGTCCCCGGGATGGATGTTTTGCCAAGTCATTGTTGGATAAGCGAGATGGT  221
           |||||.||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||.||.|.||.|||||
Sbjct 148  GACTATATGATAACCCTCAACTATGTCGCCGGGATGGATGTTTTGCCTAGTCATTGTTGGCTACGAGATATGGT  221

Query 222  AGTACAATTGTCAGACAGCTTGACTGATCTTCTGGACAAGTTTTCAAATATTTCTGAAGGCTTGAGTAATTATT  295
           |.|||||||.|||..||||||||||..|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 222  AATACAATTATCACTCAGCTTGACTACTCTTCTGGACAAGTTCTCAAATATTTCTGAAGGCTTGAGTAATTACT  295

Query 296  CCATCATAGACAAACTTGTGAATATAGTGGATGACCTTGTGGAGTGCGTGAAAGAAAACTCATCTAAGGATCTA  369
           ||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||.|||...|||.||.||||||||.||.|.|||.||.||
Sbjct 296  CCATCATAGACAAACTTGGGAAAATAGTGGATGACCTCGTGTTATGCATGGAAGAAAACGCACCGAAGAATATA  369

Query 370  AAAAAATCATTC--AAGAGCCCAGAACCCAGGCTCTTTACTCCTGAAGAATTCTTTAGAATTTTTAATAGATCC  441
           |||.||||  ||  |||||.||||||.|.||...||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 370  AAAGAATC--TCCGAAGAGGCCAGAAACTAGATCCTTTACTCCTGAAGAATTCTTTAGTATTTTCAATAGATCC  441

Query 442  ATTGATGCCTTCAAGGACTTTGTAGTGGCATCTGAAACTAGTGATTGTGTGGTTTCTTCAACATTAAGTCCTGA  515
           |||||||||||.|||||||||.|.|||||||||||.||||||||.||||||.|.||||||||||||.||||.||
Sbjct 442  ATTGATGCCTTTAAGGACTTTATGGTGGCATCTGACACTAGTGACTGTGTGCTCTCTTCAACATTAGGTCCCGA  515

Query 516  GAAAGATTCCAGAGTCAGTGTCACAAAACCATTTATGTTACCCCCTGTTGCAGCCAGCTCCCTTAGGAATGACA  589
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 516  GAAAGATTCCAGAGTCAGTGTCACAAAACCATTTATGTTACCCCCTGTTGCAGCCAGCTCCCTTAGGAATGACA  589

Query 590  GCAGTAGCAGTAATAGGAAGGCCAAAAATCCCCCTGGAGACTCCAGCCTACACTGGGCAGCCATGGCATTGCCA  663
           |||||||||||||||||||.|||..|||..||||||.||||||..|||||||.|||.||||||||||||||||.
Sbjct 590  GCAGTAGCAGTAATAGGAAAGCCGCAAAGGCCCCTGAAGACTCGGGCCTACAATGGACAGCCATGGCATTGCCG  663

Query 664  GCATTGTTTTCTCTTATAATTGGCTTTGCTTTTGGAGCCTTATACTGGAAGAAGAGACAGCCAAGTCTTACAAG  737
           ||..|..||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||
Sbjct 664  GCTCTCATTTCGCTTGTAATTGGCTTTGCTTTTGGAGCCTTATACTGGAAGAAGAAACAGTCAAGTCTTACAAG  737

Query 738  GGCAGTTGAAAATATACAAATTAATGAAGAGGATAATGAGATAAGTATGTTGCAAGAGAAAGAGAGAGAGTTTC  811
           ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||
Sbjct 738  GGCAGTTGAAAATATACAGATTAATGAAGAGGATAATGAGATAAGTATGTTGCAACAGAAAGAGAGAGAATTTC  811

Query 812  AAGAAGTG  819
           ||||.|||
Sbjct 812  AAGAGGTG  819