Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01008
• Subject: XM_006513315.2
• Aligned Length: 942
• Identities: 650
• Gaps: 210

Alignment

Query   1  ATGAAGAAGACACAA-----------------------------------------------------------  15
           |||||||||||||||                                                           
Sbjct   1  ATGAAGAAGACACAAGTGAGTAGGGCACGCCCGGGAGGAGCTCGGAAGCTTTCCAAGAAAATCGCTCCGGGAGC  74

Query  16  -------------------------------------------------------------ACTTGGATTCTCA  28
                                                                        |||||||||.|||
Sbjct  75  CCCGGGGAGCCCGGCGCGCTCTGGGACCGGCAACCAGGCCATGTGGGGCTGCGCCCTCCCGACTTGGATTATCA  148

Query  29  CTTGCATTTATCTTCAGCTGCTCCTATTTAATCCTCTCGTCAAAACTGAAGG-GATCTGCAGGAATCGTGTGAC  101
           ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||| .|||| |||||||.||||||.||||||
Sbjct 149  CTTGCATTTATCTTCAACTGCTCCTATTTAATCCTCTTGTCAAAAC-CAAGGAGATCTGCGGGAATCCTGTGAC  221

Query 102  TAATAATGTAAAAGACGTCACTAAATTGGTGGCAAATCTTCCAAAAGACTACATGATAACCCTCAAATATGTCC  175
           |.||||||||||||||.|.||.|||.|||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||.
Sbjct 222  TGATAATGTAAAAGACATTACAAAACTGGTGGCAAATCTTCCAAATGACTATATGATAACCCTCAACTATGTCG  295

Query 176  CCGGGATGGATGTTTTGCCAAGTCATTGTTGGATAAGCGAGATGGTAGTACAATTGTCAGACAGCTTGACTGAT  249
           |||||||||||||||||||.||||||||||||.||.|.||.||||||.|||||||.|||..||||||||||..|
Sbjct 296  CCGGGATGGATGTTTTGCCTAGTCATTGTTGGCTACGAGATATGGTAATACAATTATCACTCAGCTTGACTACT  369

Query 250  CTTCTGGACAAGTTTTCAAATATTTCTGAAGGCTTGAGTAATTATTCCATCATAGACAAACTTGTGAATATAGT  323
           ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||.|||||
Sbjct 370  CTTCTGGACAAGTTCTCAAATATTTCTGAAGGCTTGAGTAATTACTCCATCATAGACAAACTTGGGAAAATAGT  443

Query 324  GGATGACCTTGTGGAGTGCGTGAAAGAAAACTCATCTAAGGATCTAAAAAAATCATTC--AAGAGCCCAGAACC  395
           |||||||||.|||...|||.||.||||||||.||.|.|||.||.|||||.||||  ||  |||||.||||||.|
Sbjct 444  GGATGACCTCGTGTTATGCATGGAAGAAAACGCACCGAAGAATATAAAAGAATC--TCCGAAGAGGCCAGAAAC  515

Query 396  CAGGCTCTTTACTCCTGAAGAATTCTTTAGAATTTTTAATAGATCCATTGATGCCTTCAAGGACTTTGTAGTGG  469
           .||...||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||.|.||||
Sbjct 516  TAGATCCTTTACTCCTGAAGAATTCTTTAGTATTTTCAATAGATCCATTGATGCCTTTAAGGACTTTATGGTGG  589

Query 470  CATCTGAAACTAGTGATTGTGTGGTTTCTTCAACATTAAGTCCTGAGAAAGATTCCAGAGTCAGTGTCACAAAA  543
           |||||||.||||||||.||||||.|.||||||||||||.||||.|||||||                       
Sbjct 590  CATCTGACACTAGTGACTGTGTGCTCTCTTCAACATTAGGTCCCGAGAAAG-----------------------  640

Query 544  CCATTTATGTTACCCCCTGTTGCAGCCAGCTCCCTTAGGAATGACAGCAGTAGCAGTAATAGGAAGGCCAAAAA  617
                                                                        ||||.|||..|||
Sbjct 641  -------------------------------------------------------------GGAAAGCCGCAAA  653

Query 618  TCCCCCTGGAGACTCCAGCCTACACTGGGCAGCCATGGCATTGCCAGCATTGTTTTCTCTTATAATTGGCTTTG  691
           ..||||||.||||||..|||||||.|||.||||||||||||||||.||..|..||||.|||.||||||||||||
Sbjct 654  GGCCCCTGAAGACTCGGGCCTACAATGGACAGCCATGGCATTGCCGGCTCTCATTTCGCTTGTAATTGGCTTTG  727

Query 692  CTTTTGGAGCCTTATACTGGAAGAAGAGACAGCCAAGTCTTACAAGGGCAGTTGAAAATATACAAATTAATGAA  765
           |||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 728  CTTTTGGAGCCTTATACTGGAAGAAGAAACAGTCAAGTCTTACAAGGGCAGTTGAAAATATACAGATTAATGAA  801

Query 766  GAGGATAATGAGATAAGTATGTTGCAAGAGAAAGAGAGAGAGTTTCAAGAAGTG  819
           |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 802  GAGGATAATGAGATAAGTATGTTGCAACAGAAAGAGAGAGAATTTCAAGAGGTG  855