Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_01016
- Subject:
- XM_011535098.3
- Aligned Length:
- 2143
- Identities:
- 1855
- Gaps:
- 284
Alignment
Query 1 ATGCTGTGCGTCGGAAGGCTGGGCGGCTTGGGAGCCAGAGCAGCAGCTCTGCCGCCCCGCCGGGCGGGCCGGGG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCTGTGCGTCGGAAGGCTGGGCGGCTTGGGAGCCAGAGCAGCAGCTCTGCCGCCCCGCCGGGCGGGCCGGGG 74
Query 75 AAGCCTCGAAGCCGGGATCCGGGCCCGAAGGGTCAGCACCAGCTGGTCTCCCGTGGGCGCCGCCTTCAATGTCA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AAGCCTCGAAGCCGGGATCCGGGCCCGAAGGGTCAGCACCAGCTGGTCTCCCGTGGGCGCCGCCTTCAATGTCA 148
Query 149 AGCCCCAGGGCAGCCGCTTGGACCTGTTCGGCGAGCGCCGGGGTCTTTTTGGAGTTCCTGAGCTGAGTGCCCCA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGCCCCAGGGCAGCCGCTTGGACCTGTTCGGCGAGCGCCGGGGTCTTTTTGGAGTTCCTGAGCTGAGTGCCCCA 222
Query 223 GAAGGATTTCATATTGCACAAGAAAAAGCCTTGAGAAAGACAGAATTGCTTGTGGACCGTGCATGTTCCACCCC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAAGGATTTCATATTGCACAAGAAAAAGCCTTGAGAAAGACAGAATTGCTTGTGGACCGTGCATGTTCCACCCC 296
Query 297 ACCTGGGCCCCAGACCGTGCTGATCTTCGATGAGCTCTCGGATTCCTTATGCAGAGTGGCCGACTTGGCTGATT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ACCTGGGCCCCAGACCGTGCTGATCTTCGATGAGCTCTCGGATTCCTTATGCAGAGTGGCCGACTTGGCTGATT 370
Query 371 TTGTGAAAATCGCTCACCCTGAGCCAGCATTCAGAGAAGCTGCGGAAGAAGCTTGTAGAAGTATTGGCACCATG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TTGTGAAAATCGCTCACCCTGAGCCAGCATTCAGAGAAGCTGCGGAAGAAGCTTGTAGAAGTATTGGCACCATG 444
Query 445 GTAGAGAAGTTGAACACAAATGTGGATTTATATCAAAGTTTGCAAAAATTACTAGCTGATAAAAAACTTGTGGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GTAGAGAAGTTGAACACAAATGTGGATTTATATCAAAGTTTGCAAAAATTACTAGCTGATAAAAAACTTGTGGA 518
Query 519 TTCCCTTGATCCAGAAACAAGGCGAGTGGCTGAACTGTTTATGTTTGATTTTGAAATTAGTGGAATCCATCTAG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TTCCCTTGATCCAGAAACAAGGCGAGTGGCTGAACTGTTTATGTTTGATTTTGAAATTAGTGGAATCCATCTAG 592
Query 593 ACAAAGAAAAGCGTAAAAGAGCAGTGGACCTCAATGTTAAAATCTTGGATTTGAGTAGTACATTTCTTATGGGA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACAAAGAAAAGCGTAAAAGAGCAGTGGACCTCAATGTTAAAATCTTGGATTTGAGTAGTACATTTCTTATGGGA 666
Query 667 ACCAATTTTCCCAACAAGATTGAGAAGCATCTCTTACCAGAACACATTCGTCGTAACTTTACATCTGCTGGGGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ACCAATTTTCCCAACAAGATTGAGAAGCATCTCTTACCAGAACACATTCGTCGTAACTTTACATCTGCTGGGGA 740
Query 741 TCATATCATAATTGATGGTCTCCACGCAGAATCACCAGATGACTTGGTGCGAGAAGCTGCTTATAAAATTTTTC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TCATATCATAATTGATGGTCTCCACGCAGAATCACCAGATGACTTGGTGCGAGAAGCTGCTTATAAAATTTTTC 814
Query 815 TTTATCCCAATGCTGGTCAATTGAAATGTTTAGAAGAATTGCTCAGCAGCAGAGATCTTCTGGCAAAGTTGGTG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TTTATCCCAATGCTGGTCAATTGAAATGTTTAGAAGAATTGCTCAGCAGCAGAGATCTTCTGGCAAAGTTGGTG 888
Query 889 GGGTATTCCACGTTTTCTCACAGGGCTCTCCAAGGAACGATAGCTAAAAATCCAGAGACTGTCATGCAGTTCCT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGGTATTCCACGTTTTCTCACAGGGCTCTCCAAGGAACGATAGCTAAAAATCCAGAGACTGTCATGCAGTTCCT 962
Query 963 TGAAAAACTATCTGACAAACTTTCTGAAAGAACTCTGAAAGATTTTGAGATGATACGAGGGATGAAAATGAAAC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGAAAAACTATCTGACAAACTTTCTGAAAGAACTCTGAAAGATTTTGAGATGATACGAGGGATGAAAATGAAAC 1036
Query 1037 TGAATCCTCAAAATTCCGAAGTAATGCCCTGGGACCCCCCTTACTACAGTGGTGTGATTCGTGCAGAAAGGTAT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGAATCCTCAAAATTCCGAAGTAATGCCCTGGGACCCCCCTTACTACAGTGGTGTGATTCGTGCAGAAAGGTAT 1110
Query 1111 AATATTGAGCCCAGCCTATATTGCCCGTTTTTCTCTCTTGGAGCATGCATGGAAGGCCTGAATATTTTGCTTAA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AATATTGAGCCCAGCCTATATTGCCCGTTTTTCTCTCTTGGAGCATGCATGGAAGGCCTGAATATTTTGCTTAA 1184
Query 1185 CAGACTGTTGGGGATTTCATTATATGCAGAGCAGCCTGCAAAAGGAGAGGTGTGGAGCGAAGATGTCCGAAAAC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CAGACTGTTGGGGATTTCATTATATGCAGAGCAGCCTGCAAAAGGAGAGGTGTGGAGCGAAGATGTCCGAAAAC 1258
Query 1259 TGGCTGTTGTTCATGAATCTGAAGGATTGTTGGGGTACATTTACTGTGATTTTTTTCAGCGAGCAGACAAACCA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TGGCTGTTGTTCATGAATCTGAAGGATTGTTGGGGTACATTTACTGTGATTTTTTTCAGCGAGCAGACAAACCA 1332
Query 1333 CATCAGGATTGCCATTTCACTATCCGTGGAGGCAGACTAAAGGAAGATGGAGACTATCAACTCCCAGTTGTAGT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CATCAGGATTGCCATTTCACTATCCGTGGAGGCAGACTAAAGGAAGATGGAGACTATCAACTCCCAGTTGTAGT 1406
Query 1407 TCTTATGCTGAATCTTCCCCGTTCCTCAAGGAGTTCTCCAACTTTGCTAACTCCTGGCATGATGGAAAATCTTT 1480
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TCTTATGCTGAATCTTCCCCGTTCCTCAAGGAGTTCTCCAACTTTGCTAACTCCTAGCATGATGGAAAATCTTT 1480
Query 1481 TCCATGAAATGGGACATGCCATGCATTCAATGCTAGGACGTACTCGTTACCAACACGTCACTGGGACCAGGTGC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TCCATGAAATGGGACATGCCATGCATTCAATGCTAGGACGTACTCGTTACCAACACGTCACTGGGACCAGGTGC 1554
Query 1555 CCTACTGATTTTGCTGAGGTTCCTTCTATTCTGATGGAGTACTTTGCAAATGATTATCGAGTAGTTAACCAATT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CCTACTGATTTTGCTGAGGTTCCTTCTATTCTGATGGAGTACTTTGCAAATGATTATCGAGTAGTTAACCAATT 1628
Query 1629 TGCCAGACATTATCAGACTGGACAGCCACTGCCAAAAAATATGGTGTCTCGTCTTTGTGAATCTAAAAAGGTTT 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TGCCAGACATTATCAGACTGGACAGCCACTGCCAAAAAATATGGTGTCTCGTCTTTGTGAATCTAAAAAGGTTT 1702
Query 1703 GTGCTGCAGCTGATATGCAACTTCAGGTCTTTTATGCCACTCTGGATCAAATCTACCATGGGAAGCATCCCCTG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GTGCTGCAGCTGATATGCAACTTCAGGTCTTTTATGCCACTCTGGATCAAATCTACCATGGGAAGCATCCCCTG 1776
Query 1777 AGGAATTCAACCACAGACATTCTCAAGGAAACACAAGAGAAATTCTATGGCCTACCATATGTTCCAAATACTGC 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 AGGAATTCAACCACAGACATTCTCAAGGAAACACAAGAGAAATTCTATGGCCTACCATATGTTCCAAATACTGC 1850
Query 1851 ----CTGGCAGCTGCGATTCAGCCACCTCGTGGGGTATGGTGCTAGATATTACTCTTACCTCATGTCCAGAGCG 1920
|.||.|||.
Sbjct 1851 TGTACAGGAAGCA------------------------------------------------------------- 1863
Query 1921 GTCGCCTCCATGGTTTGGAAGGAGTGTTTTCTACAGGATCCTTTCAACAGGGCTGCCGGGGAGCGCTATCGCAG 1994
Sbjct 1864 -------------------------------------------------------------------------- 1863
Query 1995 GGAGATGCTGGCCCACGGTGGAGGCAGGGAGCCCATGCTCATGGTTGAAGGTATGCTTCAGAAGTGTCCTTCTG 2068
Sbjct 1864 -------------------------------------------------------------------------- 1863
Query 2069 TTGATGACTTCGTAAGTGCCCTCGTTTCCGACTTGGATCTGGACTTCGAAACTTTCCTCATGGATTCTGAA 2139
Sbjct 1864 ----------------------------------------------------------------------- 1863