Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_01122
- Subject:
- NM_001039652.2
- Aligned Length:
- 1333
- Identities:
- 1032
- Gaps:
- 152
Alignment
Query 1 ATGGACAGCAGCGCTGCCCCCACGAACGCCAGCAATTGCACTGATGCCTTGGCGTACT-CAAGTTGCTCCCCAG 73
||||||||||||||.|.|||...||||..||||.|.|||.||||..||||.|| |.|| |||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGACAGCAGCGCCGGCCCAGGGAACATCAGCGACTGCTCTGACCCCTTAGC-TCCTGCAAGTTGCTCCCCAG 73
Query 74 CACCCAGCCCCGGTTCCTGGGTCAACTTGTCCCACTTAGATGGCAACCTGTCCGACCCATGCGGTCCGAACCGC 147
|| ||.||.||||||.||||||||||||||.|.||||||||||.||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 74 CA------CCTGGCTCCTGGCTCAACTTGTCCCACGTTGATGGCAACCAGTCCGACCCATGCGGTCCTAACCGC 141
Query 148 ACCGACCTGGGCGGGAGAGACAGCCTGTGCCCTCCGACCGGCAGTCCCTCCATGATCACGGCCATCACGATCAT 221
||.|..||.||||||||..|||||||||||||||.|||||||||.||.||||||.||||.||||||||.|||||
Sbjct 142 ACGGGGCTTGGCGGGAGCCACAGCCTGTGCCCTCAGACCGGCAGCCCTTCCATGGTCACAGCCATCACCATCAT 215
Query 222 GGCCCTCTACTCCATCGTGTGCGTGGTGGGGCTCTTCGGAAACTTCCTGGTCATGTATGTGATTGTCAGATACA 295
|||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 216 GGCCCTCTATTCTATCGTGTGTGTAGTGGGCCTCTTTGGAAACTTCCTGGTCATGTATGTGATTGTAAGATATA 289
Query 296 CCAAGATGAAGACTGCCACCAACATCTACATTTTCAACCTTGCTCTGGCAGATGCCTTAGCCACCAGTACCCTG 369
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct 290 CCAAAATGAAGACTGCCACCAACATCTACATTTTCAACCTTGCTCTGGCAGATGCCTTAGCCACTAGCACGCTG 363
Query 370 CCCTTCCAGAGTGTGAATTACCTAATGGGAACATGGCCATTTGGAACCATCCTTTGCAAGATAGTGATCTCCAT 443
|||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||||.||||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct 364 CCCTTTCAGAGTGTTAACTACCTGATGGGAACGTGGCCCTTTGGAAACATCCTCTGCAAGATCGTGATCTCAAT 437
Query 444 AGATTACTATAACATGTTCACCAGCATATTCACCCTCTGCACCATGAGTGTTGATCGATACATTGCAGTCTGCC 517
|||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||
Sbjct 438 AGACTACTACAACATGTTCACCAGTATCTTCACCCTCTGCACCATGAGTGTAGACCGCTACATTGCCGTCTGCC 511
Query 518 ACCCTGTCAAGGCCTTAGATTTCCGTACTCCCCGAAATGCCAAAATTATCAATGTCTGCAACTGGATCCTCTCT 591
||||.|||||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 512 ACCCGGTCAAGGCCCTGGATTTCCGTACCCCCCGAAATGCCAAAATTGTCAATGTCTGCAACTGGATCCTCTCT 585
Query 592 TCAGCCATTGGTCTTCCTGTAATGTTCATGGCTACAACAAAATACAGGCAAGGTTCCATAGATTGTACACTAAC 665
||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||
Sbjct 586 TCTGCCATTGGTCTGCCCGTAATGTTCATGGCAACCACAAAATACAGGCAGGGGTCCATAGATTGCACCCTCAC 659
Query 666 ATTCTCTCATCCAACCTGGTACTGGGAAAACCTGCTGAAGATCTGTGTTTTCATCTTCGCCTTCATTATGCCAG 739
.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 660 GTTCTCTCATCCCACATGGTACTGGGAGAACCTGCTCAAAATCTGTGTCTTCATCTTCGCCTTCATCATGCCGG 733
Query 740 TGCTCATCATTACCGTGTGCTATGGACTGATGATCTTGCGCCTCAAGAGTGTCCGCATGCTCTCTGGCTCCAAA 813
|.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 734 TCCTCATCATCACTGTGTGTTATGGACTGATGATCTTACGACTCAAGAGTGTCCGCATGCTGTCGGGCTCCAAA 807
Query 814 GAAAAGGACAGGAATCTTCGAAGGATCACCAGGATGGTGCTGGTGGTGGTGGCTGTGTTCATCGTCTGCTGGAC 887
||||||||||||||.||.||.|||||||||.||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 808 GAAAAGGACAGGAACCTGCGCAGGATCACCCGGATGGTGCTGGTGGTCGTGGCTGTATTTATTGTCTGCTGGAC 881
Query 888 TCCCATTCACATTTACGTCATCATTAAAGCCTTGGTTACAATCCCAGAAACTACGTTCCAGACTGTTTCTTGGC 961
.|||||.|||||.||.||||||||.|||||..||.|.||.||.||||||||.||.||||||||||||||.||||
Sbjct 882 CCCCATCCACATCTATGTCATCATCAAAGCACTGATCACGATTCCAGAAACCACTTTCCAGACTGTTTCCTGGC 955
Query 962 ACTTCTGCATTGCTCTAGGTTACACAAACAGCTGCCTCAACCCAGTCCTTTATGCATTTCTGGATGAAAACTTC 1035
|||||||||||||..|.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 956 ACTTCTGCATTGCCTTGGGTTACACAAACAGCTGCCTGAACCCAGTTCTTTATGCGTTCCTGGATGAAAACTTC 1029
Query 1036 AAACGATGCTTCAGAGAGTTCTGTATCCCAACCTCTTCCAACATTGAGCAACAAAACTCCACTCGAATTCGTCA 1109
||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.||||..||.||.||.||||||||..|||||||.|||||
Sbjct 1030 AAACGATGTTTTAGAGAGTTCTGCATCCCAACTTCCTCCACAATCGAACAGCAAAACTCTGCTCGAATCCGTCA 1103
Query 1110 GAACACTAGAGACCACCCCTCCACGGCCAATACAGTGGATAGAACTAATCATCAGCTAGAAAATCTGGAAG-CA 1182
.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||.|||||||.||.|||| .||..||||.|| ||
Sbjct 1104 AAACACTAGGGAACACCCCTCCACGGCTAATACAGTGGATCGAACTAACCACCAGC---CAACCCTGGCAGTCA 1174
Query 1183 GAAACTGCTCCGTTGCCC-------------------------------------------------------- 1200
| |||.||||
Sbjct 1175 G---------CGTGGCCCAGATCTTTACAGGATATCCTTCTCCGACTCATGTTGAAAAACCCTGCAAGAGTTGC 1239
Query 1201 -------------------------------------------------------------------------- 1200
Sbjct 1240 ATGGACAGAGGAATGAGGAACCTTCTTCCTGATGATGGCCCAAGACAGGAATCCGGGGAAGGCCAGCTTGGCAG 1313
Query 1201 - 1200
Sbjct 1314 G 1314