Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_01122
- Subject:
- NM_001145281.2
- Aligned Length:
- 1206
- Identities:
- 941
- Gaps:
- 255
Alignment
Query 1 ATGGACAGCAGCGCTGCCCCCACGAACGCCAGCAATTGCACTGATGCCTTGGCGTACTCAAGTTGCTCCCCAGC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 ACCCAGCCCCGGTTCCTGGGTCAACTTGTCCCACTTAGATGGCAACCTGTCCGACCCATGCGGTCCGAACCGCA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CCGACCTGGGCGGGAGAGACAGCCTGTGCCCTCCGACCGGCAGTCCCTCCATGATCACGG------CCATCACG 216
|||||.|.|| ||||||..
Sbjct 1 --------------------------------------------------ATGATGAGGGCTAAATCCATCAGC 24
Query 217 ATCATGGCCCTCTACTCCATCGTGTGCGTGGTGGGGCTCTTCGGAAACTTCCTGGTCATGTATGTGATTGTCAG 290
|.||..|| |.||||.| ||| .|||
Sbjct 25 ACCAAAGC--------------------------------TGGGAAGC--CCT-----------------CCAG 47
Query 291 ATACACCAAGATGAAGACTGCCACCAACATCTACATTTTCAACCTTGCTCTGGCAGATGCCTTAGCCACCAGTA 364
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 48 ATACACCAAGATGAAGACTGCCACCAACATCTACATTTTCAACCTTGCTCTGGCAGATGCCTTAGCCACCAGTA 121
Query 365 CCCTGCCCTTCCAGAGTGTGAATTACCTAATGGGAACATGGCCATTTGGAACCATCCTTTGCAAGATAGTGATC 438
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 122 CCCTGCCCTTCCAGAGTGTGAATTACCTAATGGGAACATGGCCATTTGGAACCATCCTTTGCAAGATAGTGATC 195
Query 439 TCCATAGATTACTATAACATGTTCACCAGCATATTCACCCTCTGCACCATGAGTGTTGATCGATACATTGCAGT 512
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 196 TCCATAGATTACTATAACATGTTCACCAGCATATTCACCCTCTGCACCATGAGTGTTGATCGATACATTGCAGT 269
Query 513 CTGCCACCCTGTCAAGGCCTTAGATTTCCGTACTCCCCGAAATGCCAAAATTATCAATGTCTGCAACTGGATCC 586
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 270 CTGCCACCCTGTCAAGGCCTTAGATTTCCGTACTCCCCGAAATGCCAAAATTATCAATGTCTGCAACTGGATCC 343
Query 587 TCTCTTCAGCCATTGGTCTTCCTGTAATGTTCATGGCTACAACAAAATACAGGCAAGGTTCCATAGATTGTACA 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 344 TCTCTTCAGCCATTGGTCTTCCTGTAATGTTCATGGCTACAACAAAATACAGGCAAGGTTCCATAGATTGTACA 417
Query 661 CTAACATTCTCTCATCCAACCTGGTACTGGGAAAACCTGCTGAAGATCTGTGTTTTCATCTTCGCCTTCATTAT 734
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 418 CTAACATTCTCTCATCCAACCTGGTACTGGGAAAACCTGCTGAAGATCTGTGTTTTCATCTTCGCCTTCATTAT 491
Query 735 GCCAGTGCTCATCATTACCGTGTGCTATGGACTGATGATCTTGCGCCTCAAGAGTGTCCGCATGCTCTCTGGCT 808
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 492 GCCAGTGCTCATCATTACCGTGTGCTATGGACTGATGATCTTGCGCCTCAAGAGTGTCCGCATGCTCTCTGGCT 565
Query 809 CCAAAGAAAAGGACAGGAATCTTCGAAGGATCACCAGGATGGTGCTGGTGGTGGTGGCTGTGTTCATCGTCTGC 882
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 566 CCAAAGAAAAGGACAGGAATCTTCGAAGGATCACCAGGATGGTGCTGGTGGTGGTGGCTGTGTTCATCGTCTGC 639
Query 883 TGGACTCCCATTCACATTTACGTCATCATTAAAGCCTTGGTTACAATCCCAGAAACTACGTTCCAGACTGTTTC 956
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 640 TGGACTCCCATTCACATTTACGTCATCATTAAAGCCTTGGTTACAATCCCAGAAACTACGTTCCAGACTGTTTC 713
Query 957 TTGGCACTTCTGCATTGCTCTAGGTTACACAAACAGCTGCCTCAACCCAGTCCTTTATGCATTTCTGGATGAAA 1030
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 714 TTGGCACTTCTGCATTGCTCTAGGTTACACAAACAGCTGCCTCAACCCAGTCCTTTATGCATTTCTGGATGAAA 787
Query 1031 ACTTCAAACGATGCTTCAGAGAGTTCTGTATCCCAACCTCTTCCAACATTGAGCAACAAAACTCCACTCGAATT 1104
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 788 ACTTCAAACGATGCTTCAGAGAGTTCTGTATCCCAACCTCTTCCAACATTGAGCAACAAAACTCCACTCGAATT 861
Query 1105 CGTCAGAACACTAGAGACCACCCCTCCACGGCCAATACAGTGGATAGAACTAATCATCAGCTAGAAAATCTGGA 1178
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 862 CGTCAGAACACTAGAGACCACCCCTCCACGGCCAATACAGTGGATAGAACTAATCATCAGCTAGAAAATCTGGA 935
Query 1179 AGCAGAAACTGCTCCGTTGCCC 1200
||||||||||||||||||||||
Sbjct 936 AGCAGAAACTGCTCCGTTGCCC 957