Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01122
• Subject: NM_001145286.2
• Aligned Length: 1261
• Identities: 1193
• Gaps: 62

Alignment

Query    1  ATGGACAGCAGCGCTGCCCCCACGAACGCCAGCAATTGCACTGATGCCTTGGCGTACTCAAGTTGCTCCCCAGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACAGCAGCGCTGCCCCCACGAACGCCAGCAATTGCACTGATGCCTTGGCGTACTCAAGTTGCTCCCCAGC  74

Query   75  ACCCAGCCCCGGTTCCTGGGTCAACTTGTCCCACTTAGATGGCAACCTGTCCGACCCATGCGGTCCGAACCGCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACCCAGCCCCGGTTCCTGGGTCAACTTGTCCCACTTAGATGGCAACCTGTCCGACCCATGCGGTCCGAACCGCA  148

Query  149  CCGACCTGGGCGGGAGAGACAGCCTGTGCCCTCCGACCGGCAGTCCCTCCATGATCACGGCCATCACGATCATG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCGACCTGGGCGGGAGAGACAGCCTGTGCCCTCCGACCGGCAGTCCCTCCATGATCACGGCCATCACGATCATG  222

Query  223  GCCCTCTACTCCATCGTGTGCGTGGTGGGGCTCTTCGGAAACTTCCTGGTCATGTATGTGATTGTCAGATACAC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCCCTCTACTCCATCGTGTGCGTGGTGGGGCTCTTCGGAAACTTCCTGGTCATGTATGTGATTGTCAGATACAC  296

Query  297  CAAGATGAAGACTGCCACCAACATCTACATTTTCAACCTTGCTCTGGCAGATGCCTTAGCCACCAGTACCCTGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAAGATGAAGACTGCCACCAACATCTACATTTTCAACCTTGCTCTGGCAGATGCCTTAGCCACCAGTACCCTGC  370

Query  371  CCTTCCAGAGTGTGAATTACCTAATGGGAACATGGCCATTTGGAACCATCCTTTGCAAGATAGTGATCTCCATA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCTTCCAGAGTGTGAATTACCTAATGGGAACATGGCCATTTGGAACCATCCTTTGCAAGATAGTGATCTCCATA  444

Query  445  GATTACTATAACATGTTCACCAGCATATTCACCCTCTGCACCATGAGTGTTGATCGATACATTGCAGTCTGCCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GATTACTATAACATGTTCACCAGCATATTCACCCTCTGCACCATGAGTGTTGATCGATACATTGCAGTCTGCCA  518

Query  519  CCCTGTCAAGGCCTTAGATTTCCGTACTCCCCGAAATGCCAAAATTATCAATGTCTGCAACTGGATCCTCTCTT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCCTGTCAAGGCCTTAGATTTCCGTACTCCCCGAAATGCCAAAATTATCAATGTCTGCAACTGGATCCTCTCTT  592

Query  593  CAGCCATTGGTCTTCCTGTAATGTTCATGGCTACAACAAAATACAGGCAAGGTTCCATAGATTGTACACTAACA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAGCCATTGGTCTTCCTGTAATGTTCATGGCTACAACAAAATACAGGCAAGGTTCCATAGATTGTACACTAACA  666

Query  667  TTCTCTCATCCAACCTGGTACTGGGAAAACCTGCTGAAGATCTGTGTTTTCATCTTCGCCTTCATTATGCCAGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTCTCTCATCCAACCTGGTACTGGGAAAACCTGCTGAAGATCTGTGTTTTCATCTTCGCCTTCATTATGCCAGT  740

Query  741  GCTCATCATTACCGTGTGCTATGGACTGATGATCTTGCGCCTCAAGAGTGTCCGCATGCTCTCTGGCTCCAAAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCTCATCATTACCGTGTGCTATGGACTGATGATCTTGCGCCTCAAGAGTGTCCGCATGCTCTCTGGCTCCAAAG  814

Query  815  AAAAGGACAGGAATCTTCGAAGGATCACCAGGATGGTGCTGGTGGTGGTGGCTGTGTTCATCGTCTGCTGGACT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAAAGGACAGGAATCTTCGAAGGATCACCAGGATGGTGCTGGTGGTGGTGGCTGTGTTCATCGTCTGCTGGACT  888

Query  889  CCCATTCACATTTACGTCATCATTAAAGCCTTGGTTACAATCCCAGAAACTACGTTCCAGACTGTTTCTTGGCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCCATTCACATTTACGTCATCATTAAAGCCTTGGTTACAATCCCAGAAACTACGTTCCAGACTGTTTCTTGGCA  962

Query  963  CTTCTGCATTGCTCTAGGTTACACAAACAGCTGCCTCAACCCAGTCCTTTATGCATTTCTGGATGAAAACTTCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTTCTGCATTGCTCTAGGTTACACAAACAGCTGCCTCAACCCAGTCCTTTATGCATTTCTGGATGAAAACTTCA  1036

Query 1037  AACGATGCTTCAGAGAGTTCTGTATCCCAACCTCTTCCAACATTGAGCAACAAAACTCCACTCGAATTCGTCAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AACGATGCTTCAGAGAGTTCTGTATCCCAACCTCTTCCAACATTGAGCAACAAAACTCCACTCGAATTCGTCAG  1110

Query 1111  AACACTAGAGACCACCCCTCCACGGCCAATACAGTGGATAGAACTAATCATCAGCTAGAA---AATCTGG----  1177
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||   ||.||||    
Sbjct 1111  AACACTAGAGACCACCCCTCCACGGCCAATACAGTGGATAGAACTAATCATCAGGTGGAATTGAACCTGGACTG  1184

Query 1178  -----------AAGCAGAA---------ACTG-------------------CTCCGTTGCCC------------  1200
                       |.||| ||         ||||                   ||||.||.|||            
Sbjct 1185  TCACTGTGAAAATGCA-AAGCCTTGGCCACTGAGCTACAATGCAGGGCAGTCTCCATTTCCCTTCCCAGGAAGA  1257

Query 1201  ---  1200
               
Sbjct 1258  GTC  1260