Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01122
• Subject: NM_001285524.1
• Aligned Length: 1479
• Identities: 1200
• Gaps: 279

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTGTTTGCACAGAAGAGTGCCCAGTGAAGAGACCTACTCCTTGGATCGCTTTGCGCAAAATCCACCCCTTTT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CCCTCCTCCCTCCCTTCCAGCCTCCGAATCCCGCATGGCCCACGCTCCCCTCCTGCAGCGGTGCGGGGCAGCCA  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GGACTGGTTTCTGTAAGAAACAGCAGGAGCTGTGGCAGCGGCGAAAGGAAGCGGCTGAGGCGCTTGGAACCCGA  222

Query    1  ---------------------------------------------------------ATGGACAGCAGCGCTGC  17
                                                                     |||||||||||||||||
Sbjct  223  AAAGTCTCGGTGCTCCTGGCTACCTCGCACAGCGGTGCCCGCCCGGCCGTCAGTACCATGGACAGCAGCGCTGC  296

Query   18  CCCCACGAACGCCAGCAATTGCACTGATGCCTTGGCGTACTCAAGTTGCTCCCCAGCACCCAGCCCCGGTTCCT  91
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCCCACGAACGCCAGCAATTGCACTGATGCCTTGGCGTACTCAAGTTGCTCCCCAGCACCCAGCCCCGGTTCCT  370

Query   92  GGGTCAACTTGTCCCACTTAGATGGCAACCTGTCCGACCCATGCGGTCCGAACCGCACCGACCTGGGCGGGAGA  165
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGGTCAACTTGTCCCACTTAGATGGCAACCTGTCCGACCCATGCGGTCCGAACCGCACCGACCTGGGCGGGAGA  444

Query  166  GACAGCCTGTGCCCTCCGACCGGCAGTCCCTCCATGATCACGGCCATCACGATCATGGCCCTCTACTCCATCGT  239
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GACAGCCTGTGCCCTCCGACCGGCAGTCCCTCCATGATCACGGCCATCACGATCATGGCCCTCTACTCCATCGT  518

Query  240  GTGCGTGGTGGGGCTCTTCGGAAACTTCCTGGTCATGTATGTGATTGTCAGATACACCAAGATGAAGACTGCCA  313
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTGCGTGGTGGGGCTCTTCGGAAACTTCCTGGTCATGTATGTGATTGTCAGATACACCAAGATGAAGACTGCCA  592

Query  314  CCAACATCTACATTTTCAACCTTGCTCTGGCAGATGCCTTAGCCACCAGTACCCTGCCCTTCCAGAGTGTGAAT  387
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCAACATCTACATTTTCAACCTTGCTCTGGCAGATGCCTTAGCCACCAGTACCCTGCCCTTCCAGAGTGTGAAT  666

Query  388  TACCTAATGGGAACATGGCCATTTGGAACCATCCTTTGCAAGATAGTGATCTCCATAGATTACTATAACATGTT  461
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TACCTAATGGGAACATGGCCATTTGGAACCATCCTTTGCAAGATAGTGATCTCCATAGATTACTATAACATGTT  740

Query  462  CACCAGCATATTCACCCTCTGCACCATGAGTGTTGATCGATACATTGCAGTCTGCCACCCTGTCAAGGCCTTAG  535
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CACCAGCATATTCACCCTCTGCACCATGAGTGTTGATCGATACATTGCAGTCTGCCACCCTGTCAAGGCCTTAG  814

Query  536  ATTTCCGTACTCCCCGAAATGCCAAAATTATCAATGTCTGCAACTGGATCCTCTCTTCAGCCATTGGTCTTCCT  609
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATTTCCGTACTCCCCGAAATGCCAAAATTATCAATGTCTGCAACTGGATCCTCTCTTCAGCCATTGGTCTTCCT  888

Query  610  GTAATGTTCATGGCTACAACAAAATACAGGCAAGGTTCCATAGATTGTACACTAACATTCTCTCATCCAACCTG  683
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTAATGTTCATGGCTACAACAAAATACAGGCAAGGTTCCATAGATTGTACACTAACATTCTCTCATCCAACCTG  962

Query  684  GTACTGGGAAAACCTGCTGAAGATCTGTGTTTTCATCTTCGCCTTCATTATGCCAGTGCTCATCATTACCGTGT  757
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GTACTGGGAAAACCTGCTGAAGATCTGTGTTTTCATCTTCGCCTTCATTATGCCAGTGCTCATCATTACCGTGT  1036

Query  758  GCTATGGACTGATGATCTTGCGCCTCAAGAGTGTCCGCATGCTCTCTGGCTCCAAAGAAAAGGACAGGAATCTT  831
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCTATGGACTGATGATCTTGCGCCTCAAGAGTGTCCGCATGCTCTCTGGCTCCAAAGAAAAGGACAGGAATCTT  1110

Query  832  CGAAGGATCACCAGGATGGTGCTGGTGGTGGTGGCTGTGTTCATCGTCTGCTGGACTCCCATTCACATTTACGT  905
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CGAAGGATCACCAGGATGGTGCTGGTGGTGGTGGCTGTGTTCATCGTCTGCTGGACTCCCATTCACATTTACGT  1184

Query  906  CATCATTAAAGCCTTGGTTACAATCCCAGAAACTACGTTCCAGACTGTTTCTTGGCACTTCTGCATTGCTCTAG  979
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CATCATTAAAGCCTTGGTTACAATCCCAGAAACTACGTTCCAGACTGTTTCTTGGCACTTCTGCATTGCTCTAG  1258

Query  980  GTTACACAAACAGCTGCCTCAACCCAGTCCTTTATGCATTTCTGGATGAAAACTTCAAACGATGCTTCAGAGAG  1053
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GTTACACAAACAGCTGCCTCAACCCAGTCCTTTATGCATTTCTGGATGAAAACTTCAAACGATGCTTCAGAGAG  1332

Query 1054  TTCTGTATCCCAACCTCTTCCAACATTGAGCAACAAAACTCCACTCGAATTCGTCAGAACACTAGAGACCACCC  1127
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TTCTGTATCCCAACCTCTTCCAACATTGAGCAACAAAACTCCACTCGAATTCGTCAGAACACTAGAGACCACCC  1406

Query 1128  CTCCACGGCCAATACAGTGGATAGAACTAATCATCAGCTAGAAAATCTGGAAGCAGAAACTGCTCCGTTGCCC  1200
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CTCCACGGCCAATACAGTGGATAGAACTAATCATCAGCTAGAAAATCTGGAAGCAGAAACTGCTCCGTTGCCC  1479