Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01122
• Subject: NM_001304950.1
• Aligned Length: 1202
• Identities: 1030
• Gaps: 25

Alignment

Query    1  ATGGACAGCAGCGCTGCCCCCACGAACGCCAGCAATTGCACTGATGCCTTGGCGTACT-CAAGTTGCTCCCCAG  73
            ||||||||||||||.|.|||...||||..||||.|.|||.||||..||||.|| |.|| |||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACAGCAGCGCCGGCCCAGGGAACATCAGCGACTGCTCTGACCCCTTAGC-TCCTGCAAGTTGCTCCCCAG  73

Query   74  CACCCAGCCCCGGTTCCTGGGTCAACTTGTCCCACTTAGATGGCAACCTGTCCGACCCATGCGGTCCGAACCGC  147
            ||      ||.||.||||||.||||||||||||||.|.||||||||||.||||||||||||||||||.||||||
Sbjct   74  CA------CCTGGCTCCTGGCTCAACTTGTCCCACGTTGATGGCAACCAGTCCGACCCATGCGGTCCTAACCGC  141

Query  148  ACCGACCTGGGCGGGAGAGACAGCCTGTGCCCTCCGACCGGCAGTCCCTCCATGATCACGGCCATCACGATCAT  221
            ||.|..||.||||||||..|||||||||||||||.|||||||||.||.||||||.||||.||||||||.|||||
Sbjct  142  ACGGGGCTTGGCGGGAGCCACAGCCTGTGCCCTCAGACCGGCAGCCCTTCCATGGTCACAGCCATCACCATCAT  215

Query  222  GGCCCTCTACTCCATCGTGTGCGTGGTGGGGCTCTTCGGAAACTTCCTGGTCATGTATGTGATTGTCAGATACA  295
            |||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct  216  GGCCCTCTATTCTATCGTGTGTGTAGTGGGCCTCTTTGGAAACTTCCTGGTCATGTATGTGATTGTAAGATATA  289

Query  296  CCAAGATGAAGACTGCCACCAACATCTACATTTTCAACCTTGCTCTGGCAGATGCCTTAGCCACCAGTACCCTG  369
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct  290  CCAAAATGAAGACTGCCACCAACATCTACATTTTCAACCTTGCTCTGGCAGATGCCTTAGCCACTAGCACGCTG  363

Query  370  CCCTTCCAGAGTGTGAATTACCTAATGGGAACATGGCCATTTGGAACCATCCTTTGCAAGATAGTGATCTCCAT  443
            |||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||||.||||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct  364  CCCTTTCAGAGTGTTAACTACCTGATGGGAACGTGGCCCTTTGGAAACATCCTCTGCAAGATCGTGATCTCAAT  437

Query  444  AGATTACTATAACATGTTCACCAGCATATTCACCCTCTGCACCATGAGTGTTGATCGATACATTGCAGTCTGCC  517
            |||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||
Sbjct  438  AGACTACTACAACATGTTCACCAGTATCTTCACCCTCTGCACCATGAGTGTAGACCGCTACATTGCCGTCTGCC  511

Query  518  ACCCTGTCAAGGCCTTAGATTTCCGTACTCCCCGAAATGCCAAAATTATCAATGTCTGCAACTGGATCCTCTCT  591
            ||||.|||||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  512  ACCCGGTCAAGGCCCTGGATTTCCGTACCCCCCGAAATGCCAAAATTGTCAATGTCTGCAACTGGATCCTCTCT  585

Query  592  TCAGCCATTGGTCTTCCTGTAATGTTCATGGCTACAACAAAATACAGGCAAGGTTCCATAGATTGTACACTAAC  665
            ||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||
Sbjct  586  TCTGCCATTGGTCTGCCCGTAATGTTCATGGCAACCACAAAATACAGGCAGGGGTCCATAGATTGCACCCTCAC  659

Query  666  ATTCTCTCATCCAACCTGGTACTGGGAAAACCTGCTGAAGATCTGTGTTTTCATCTTCGCCTTCATTATGCCAG  739
            .|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct  660  GTTCTCTCATCCCACATGGTACTGGGAGAACCTGCTCAAAATCTGTGTCTTCATCTTCGCCTTCATCATGCCGG  733

Query  740  TGCTCATCATTACCGTGTGCTATGGACTGATGATCTTGCGCCTCAAGAGTGTCCGCATGCTCTCTGGCTCCAAA  813
            |.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  734  TCCTCATCATCACTGTGTGTTATGGACTGATGATCTTACGACTCAAGAGTGTCCGCATGCTGTCGGGCTCCAAA  807

Query  814  GAAAAGGACAGGAATCTTCGAAGGATCACCAGGATGGTGCTGGTGGTGGTGGCTGTGTTCATCGTCTGCTGGAC  887
            ||||||||||||||.||.||.|||||||||.||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||
Sbjct  808  GAAAAGGACAGGAACCTGCGCAGGATCACCCGGATGGTGCTGGTGGTCGTGGCTGTATTTATTGTCTGCTGGAC  881

Query  888  TCCCATTCACATTTACGTCATCATTAAAGCCTTGGTTACAATCCCAGAAACTACGTTCCAGACTGTTTCTTGGC  961
            .|||||.|||||.||.||||||||.|||||..||.|.||.||.||||||||.||.||||||||||||||.||||
Sbjct  882  CCCCATCCACATCTATGTCATCATCAAAGCACTGATCACGATTCCAGAAACCACTTTCCAGACTGTTTCCTGGC  955

Query  962  ACTTCTGCATTGCTCTAGGTTACACAAACAGCTGCCTCAACCCAGTCCTTTATGCATTTCTGGATGAAAACTTC  1035
            |||||||||||||..|.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct  956  ACTTCTGCATTGCCTTGGGTTACACAAACAGCTGCCTGAACCCAGTTCTTTATGCGTTCCTGGATGAAAACTTC  1029

Query 1036  AAACGATGCTTCAGAGAGTTCTGTATCCCAACCTCTTCCAACATTGAGCAACAAAACTCCACTCGAATTCGTCA  1109
            ||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.||||..||.||.||.||||||||..|||||||.|||||
Sbjct 1030  AAACGATGTTTTAGAGAGTTCTGCATCCCAACTTCCTCCACAATCGAACAGCAAAACTCTGCTCGAATCCGTCA  1103

Query 1110  GAACACTAGAGACCACCCCTCCACGGCCAATACAGTGGATAGAACTAATCATCAGCTAGAAAATCTGGAAGCAG  1183
            .||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||.|||||||.||.|||  ||.||   ||  ||  |
Sbjct 1104  AAACACTAGGGAACACCCCTCCACGGCTAATACAGTGGATCGAACTAACCACCAG--AGGAA---TG--AG--G  1168

Query 1184  AAACTGC-TCCGTTGCCC  1200
            ||.||.| |||       
Sbjct 1169  AACCTTCTTCC-------  1179