Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_01147
- Subject:
- NM_001162946.1
- Aligned Length:
- 3537
- Identities:
- 3151
- Gaps:
- 3
Alignment
Query 1 ---ATGCTGAAGTTCCGAACAGTCCATGGGGGCCTGAGGCTCCTGGGAATCCGCCGAACCTCCACCGCCCCCGC 71
|||||||||||||.||||||.|..||||||||||||||||||||..||||||||.|||||.|.|||||.|.
Sbjct 1 ATGATGCTGAAGTTCCAAACAGTTCGAGGGGGCCTGAGGCTCCTGGGTGTCCGCCGATCCTCCTCGGCCCCTGT 74
Query 72 TGCCTCCCCAAATGTCCGGCGCCTGGAGTATAAGCCCATCAAGAAAGTCATGGTGGCCAACAGAGGTGAGATTG 145
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGCCTCCCCAAATGTCCGGCGTCTGGAGTATAAGCCTATCAAGAAAGTAATGGTGGCCAACAGAGGTGAGATTG 148
Query 146 CCATCCGTGTGTTCCGGGCCTGCACGGAGCTGGGCATCCGCACCGTAGCCATCTACTCTGAGCAGGACACGGGC 219
|||||||.|||||.||.||.|||||.||||||||.||||||||.||.||..|||||||.|||||||||||.||.
Sbjct 149 CCATCCGAGTGTTTCGTGCGTGCACAGAGCTGGGTATCCGCACAGTGGCTGTCTACTCGGAGCAGGACACAGGG 222
Query 220 CAGATGCACCGGCAGAAAGCAGATGAAGCCTATCTCATCGGCCGCGGCCTGGCCCCCGTGCAGGCCTACCTGCA 293
|||||||||.||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 223 CAGATGCACAGGCAGAAAGCTGATGAAGCCTACCTTATTGGCCGTGGCCTGGCACCTGTGCAGGCCTACCTGCA 296
Query 294 CATCCCAGACATCATCAAGGTGGCCAAGGAGAACAACGTAGATGCAGTGCACCCTGGCTACGGGTTCCTCTCTG 367
|||.||||||||||||||||||||||||||.||....||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 297 CATTCCAGACATCATCAAGGTGGCCAAGGAAAATGGTGTAGATGCGGTGCATCCTGGCTATGGGTTCCTCTCAG 370
Query 368 AGCGAGCGGACTTCGCCCAGGCCTGCCAGGATGCAGGGGTCCGGTTTATTGGGCCAAGCCCAGAAGTGGTCCGC 441
|||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 371 AGCGAGCAGACTTTGCCCAGGCCTGCCAAGATGCTGGAGTCCGGTTCATTGGTCCAAGCCCAGAGGTGGTCCGC 444
Query 442 AAGATGGGAGACAAGGTGGAGGCCCGGGCCATCGCCATTGCTGCGGGTGTTCCCGTTGTCCCTGGCACAGATGC 515
||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||.|||||.|||||.||..|
Sbjct 445 AAGATGGGAGACAAGGTGGAAGCCCGGGCCATTGCCATCGCTGCAGGCGTTCCAGTGGTCCCCGGCACGGACTC 518
Query 516 CCCCATCACGTCCCTGCATGAGGCCCACGAGTTCTCCAACACCTACGGCTTCCCCATCATCTTCAAGGCGGCCT 589
||||||||..||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||
Sbjct 519 CCCCATCAGCTCCCTGCACGAGGCGCATGAGTTCTCCAACACCTACGGCTTCCCTATTATCTTCAAGGCCGCCT 592
Query 590 ATGGGGGTGGAGGGCGTGGCATGAGGGTGGTGCACAGCTACGAGGAGCTGGAGGAGAATTACACCCGGGCCTAC 663
|.||.|||||.||.||.||||||.||||.|||||.|||||.||||||.||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACGGAGGTGGGGGCCGCGGCATGCGGGTCGTGCATAGCTATGAGGAGTTGGAAGAGAATTACACCCGGGCCTAC 666
Query 664 TCAGAGGCTCTGGCCGCCTTTGGGAATGGGGCGCTGTTTGTGGAGAAGTTCATCGAGAAGCCACGGCACATCGA 737
||.|||||..||||.||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||.||
Sbjct 667 TCCGAGGCCTTGGCAGCCTTTGGGAATGGAGCGTTGTTTGTGGAGAAGTTCATTGAGAAGCCAAGGCACATTGA 740
Query 738 GGTGCAGATCTTGGGGGACCAGTATGGGAACATCCTGCACCTGTACGAGCGAGACTGCTCCATCCAGCGGCGGC 811
||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 741 GGTGCAGATCCTAGGGGACCAGTATGGGAACATCCTGCACCTGTACGAGCGAGACTGCTCCATCCAGCGTCGGC 814
Query 812 ACCAGAAGGTGGTCGAGATTGCCCCCGCCGCCCACCTGGACCCGCAGCTTCGGACTCGGCTCACCAGCGACTCT 885
|||||||||||||.|||||.|||||.||..||||||||||.||.||.|||||..|.||.||||||||.||||||
Sbjct 815 ACCAGAAGGTGGTAGAGATCGCCCCTGCTACCCACCTGGATCCCCAACTTCGCTCACGTCTCACCAGTGACTCT 888
Query 886 GTGAAACTCGCTAAACAGGTGGGCTACGAGAACGCAGGCACCGTGGAGTTCCTGGTGGACAGGCACGGCAAGCA 959
||.|||||.||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 889 GTCAAACTTGCCAAGCAGGTAGGCTATGAGAACGCCGGCACTGTGGAGTTCCTGGTGGACAAGCACGGCAAGCA 962
Query 960 CTACTTCATCGAGGTCAACTCCCGCCTGCAGGTGGAGCACACGGTCACAGAGGAGATCACCGACGTAGACCTGG 1033
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||
Sbjct 963 CTACTTCATCGAGGTCAATTCCCGCCTGCAGGTGGAGCACACGGTCACCGAGGAGATCACAGATGTGGACCTGG 1036
Query 1034 TCCATGCTCAGATCCACGTGGCTGAGGGCAGGAGCCTACCCGACCTGGGCCTGCGGCAGGAGAACATCCGCATC 1107
||||||||||||||||||||.|.||.|||.|||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TCCATGCTCAGATCCACGTGTCCGAAGGCCGGAGCCTGCCTGACCTGGGCCTGCGGCAGGAGAACATCCGCATC 1110
Query 1108 AACGGGTGTGCCATCCAGTGCCGGGTCACCACCGAGGACCCCGCGCGCAGCTTCCAGCCGGACACCGGCCGCAT 1181
||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1111 AATGGCTGTGCCATTCAGTGTCGGGTCACCACCGAGGACCCTGCACGCAGCTTCCAGCCAGACACCGGCCGCAT 1184
Query 1182 TGAGGTGTTCCGGAGCGGAGAGGGCATGGGCATCCGCCTGGATAATGCTTCCGCCTTCCAAGGAGCCGTCATCT 1255
||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.||.||.|||||.|
Sbjct 1185 TGAGGTTTTCCGGAGTGGTGAGGGCATGGGCATCCGCCTGGACAACGCCTCTGCATTCCAGGGCGCTGTCATAT 1258
Query 1256 CGCCCCACTACGACTCCCTGCTGGTCAAAGTCATTGCCCACGGCAAAGACCACCCCACGGCCGCCACCAAGATG 1329
||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1259 CGCCCCACTATGACTCTCTGCTCGTCAAGGTCATTGCACACGGCAAAGACCACCCCACAGCTGCCACCAAGATG 1332
Query 1330 AGCAGGGCCCTTGCGGAGTTCCGCGTCCGAGGTGTGAAGACCAACATCGCCTTCCTGCAGAATGTGCTCAACAA 1403
|||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1333 AGCAGAGCCCTGGCCGAGTTCCGTGTCCGAGGTGTAAAGACCAACATCCCCTTCCTGCAGAATGTTCTCAACAA 1406
Query 1404 CCAGCAGTTCCTGGCAGGCACTGTGGACACCCAGTTCATCGACGAGAACCCAGAGCTGTTCCAGCTGCGGCCTG 1477
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1407 CCAGCAGTTCCTGGCAGGCACAGTGGACACCCAGTTCATCGATGAGAACCCTGAGCTGTTCCAGCTTCGGCCTG 1480
Query 1478 CACAGAACCGGGCCCAAAAGCTGTTGCACTACCTCGGCCATGTCATGGTAAACGGTCCAACCACCCCGATTCCC 1551
||||||||||||||||.|||.||.|.||.||||||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.||.||.||.
Sbjct 1481 CACAGAACCGGGCCCAGAAGTTGCTACATTACCTCGGACATGTCATGGTGAATGGCCCTACCACTCCAATCCCT 1554
Query 1552 GTCAAGGCCAGCCCCAGCCCCACGGACCCCGTTGTCCCTGCAGTGCCCATAGGCCCGCCCCCGGCTGGTTTCAG 1625
|||||.|..||||||||.||...|||.||.|.|||.||||..||||||||||||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 1555 GTCAATGTGAGCCCCAGTCCTGTGGATCCTGCTGTTCCTGTGGTGCCCATAGGCCCACCTCCAGCTGGTTTCAG 1628
Query 1626 AGACATCCTGCTGCGAGAGGGGCCTGAGGGCTTTGCTCGAGCTGTGCGGAACCACCCGGGGCTGCTGCTGATGG 1699
.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||.||||||||||.||||||
Sbjct 1629 GGACATCCTTCTGCGAGAAGGGCCAGAGGGCTTTGCCCGAGCTGTGCGGAATCACCAGGGGCTGCTGTTGATGG 1702
Query 1700 ACACGACCTTCAGGGACGCCCACCAGTCACTGCTGGCCACTCGTGTGCGCACCCACGATCTCAAAAAGATCGCC 1773
||||.||||||.||||.||||||||||||||.|||||||||.|.||||||||.||.||||||||||||||.||.
Sbjct 1703 ACACAACCTTCCGGGATGCCCACCAGTCACTACTGGCCACTAGAGTGCGCACACATGATCTCAAAAAGATTGCG 1776
Query 1774 CCCTATGTTGCCCACAACTTCAGCAAGCTCTTCAGCATGGAGAACTGGGGAGGAGCCACGTTTGACGTCGCCAT 1847
||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1777 CCCTATGTTGCCCACAACTTCAACAAGCTCTTCAGCATGGAGAACTGGGGAGGCGCCACGTTCGACGTTGCCAT 1850
Query 1848 GCGCTTCCTGTATGAGTGCCCCTGGCGGCGGCTGCAGGAGCTCCGGGAGCTCATCCCCAACATCCCTTTCCAGA 1921
||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||
Sbjct 1851 GCGCTTCCTGTACGAGTGCCCCTGGCGGCGGCTCCAGGAGCTCCGGGAGCTTATCCCGAACATCCCGTTCCAGA 1924
Query 1922 TGCTGCTGCGGGGGGCCAATGCTGTGGGCTACACCAACTACCCAGACAACGTGGTCTTCAAGTTCTGTGAAGTG 1995
||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1925 TGCTACTGAGGGGGGCCAATGCTGTGGGCTACACCAACTACCCTGACAACGTGGTCTTCAAGTTCTGTGAGGTG 1998
Query 1996 GCCAAAGAGAATGGCATGGATGTCTTCCGTGTGTTTGACTCCCTCAACTACTTGCCCAACATGCTGCTGGGCAT 2069
||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1999 GCCAAAGAGAATGGTATGGACGTCTTCCGAGTCTTTGACTCCCTCAACTACTTGCCAAACATGCTGCTGGGCAT 2072
Query 2070 GGAGGCGGCAGGAAGTGCCGGAGGCGTGGTGGAGGCTGCCATCTCATACACGGGCGACGTGGCCGACCCCAGCC 2143
|||.||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|
Sbjct 2073 GGAAGCAGCAGGCAGTGCTGGGGGTGTGGTGGAGGCTGCCATCTCATACACGGGGGACGTGGCTGACCCTAGTC 2146
Query 2144 GCACCAAGTACTCACTGCAGTACTACATGGGCTTGGCCGAAGAGCTGGTGCGAGCTGGCACCCACATCCTGTGC 2217
||||.||.|||||||||.||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 2147 GCACTAAATACTCACTGGAGTACTACATGGGCTTAGCTGAAGAACTGGTGCGAGCTGGCACTCACATCCTGTGC 2220
Query 2218 ATCAAGGACATGGCCGGGCTGCTGAAGCCCACGGCCTGCACCATGCTGGTCAGCTCCCTCCGGGACCGCTTCCC 2291
||.|||||||||||.||.|||||||||||..|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 2221 ATTAAGGACATGGCGGGCCTGCTGAAGCCTGCCGCCTGCACCATGCTGGTCAGCTCCCTCCGGGACCGATTCCC 2294
Query 2292 CGACCTCCCACTGCACATCCACACCCACGACACGTCAGGGGCAGGCGTGGCAGCCATGCTGGCCTGTGCCCAGG 2365
|||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 2295 CGACCTCCCACTGCACATCCATACCCATGATACATCAGGGGCAGGTGTGGCAGCCATGCTGGCCTGTGCACAAG 2368
Query 2366 CTGGAGCTGATGTGGTGGATGTGGCAGCTGATTCCATGTCTGGGATGACTTCACAGCCCAGCATGGGGGCCCTG 2439
|.||.||||||||.|||||.|||||||..||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2369 CAGGGGCTGATGTTGTGGACGTGGCAGTAGACTCCATGTCTGGGATGACCTCACAGCCAAGCATGGGGGCCCTG 2442
Query 2440 GTGGCCTGTACCAGAGGGACTCCCCTGGACACAGAGGTGCCCATGGAGCGCGTGTTTGACTACAGTGAGTACTG 2513
|||||||||||||.|||||||||..|||||||||||||.|||.|||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 GTGGCCTGTACCAAAGGGACTCCTTTGGACACAGAGGTACCCCTGGAGCGTGTGTTTGACTACAGTGAGTACTG 2516
Query 2514 GGAGGGGGCTCGGGGACTGTACGCGGCCTTCGACTGCACGGCCACCATGAAGTCTGGCAACTCGGACGTGTATG 2587
|||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 2517 GGAAGGGGCTCGGGGACTGTACGCAGCCTTCGATTGCACGGCTACCATGAAGTCTGGCAACTCCGACGTGTATG 2590
Query 2588 AAAATGAGATCCCAGGGGGCCAGTACACCAACCTGCACTTCCAGGCCCACAGCATGGGGCTTGGCTCCAAGTTC 2661
|.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 AGAATGAGATTCCAGGGGGCCAGTACACCAACCTGCACTTCCAGGCCCATAGCATGGGGCTTGGCTCCAAGTTC 2664
Query 2662 AAGGAGGTCAAGAAGGCCTATGTGGAGGCCAACCAGATGCTGGGCGATCTCATCAAGGTGACGCCCTCCTCCAA 2735
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 2665 AAGGAGGTCAAGAAGGCCTATGTGGAGGCTAACCAGATGCTGGGGGACCTCATCAAGGTGACACCATCCTCCAA 2738
Query 2736 GATCGTGGGGGACCTGGCCCAGTTTATGGTGCAGAATGGATTGAGCCGGGCAGAGGCCGAAGCTCAGGCGGAAG 2809
|||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 2739 GATTGTGGGGGACCTGGCCCAGTTCATGGTGCAGAATGGGTTGAGCCGGGCAGAGGCAGAAGCTCAGGCAGAAG 2812
Query 2810 AGCTGTCCTTTCCCCGCTCCGTGGTGGAGTTCCTGCAGGGCTACATCGGTGTCCCCCATGGGGGGTTCCCCGAA 2883
||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||..|.|||||||||||.|||||.||.
Sbjct 2813 AGCTGTCCTTCCCCCGCTCTGTGGTGGAGTTCCTGCAGGGCTACATTGGCATTCCCCATGGGGGTTTCCCTGAG 2886
Query 2884 CCCTTTCGCTCTAAGGTACTGAAGGACCTGCCAAGGGTGGAGGGGCGGCCTGGAGCCTCCCTCCCTCCCCTGGA 2957
|||||||||||||||||.||.||||||||||||||..|.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2887 CCCTTTCGCTCTAAGGTGCTAAAGGACCTGCCAAGAATAGAGGGGCGGCCTGGAGCCTCCCTCCCTCCCCTGAA 2960
Query 2958 TCTGCAGGCACTGGAGAAGGAGCTGGTAGACCGGCATGGGGAGGAGGTGACGCCGGAAGATGTGCTCTCAGCAG 3031
.|||.|||..|||||||||||.|||.|.||..|||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.||||
Sbjct 2961 CCTGAAGGAGCTGGAGAAGGACCTGATTGATAGGCATGGGGAGGAGGTGACCCCAGAGGACGTCCTCTCTGCAG 3034
Query 3032 CTATGTACCCCGATGTGTTTGCCCACTTCAAGGACTTCACTGCCACCTTTGGCCCCCTGGATAGCCTGAATACT 3105
|.||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 3035 CCATGTACCCTGATGTCTTTGCTCAATTCAAAGACTTCACGGCTACCTTCGGCCCCCTGGATAGCCTTAATACT 3108
Query 3106 CGCCTCTTCCTGCAGGGACCCAAGATCGCAGAGGAGTTTGAGGTGGAGCTGGAGCGGGGCAAGACGCTGCACAT 3179
||.|||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 3109 CGTCTCTTTCTTCAAGGACCCAAAATTGCAGAGGAGTTTGAGGTTGAGCTGGAACGGGGCAAGACCCTGCACAT 3182
Query 3180 CAAAGCCCTGGCCGTGAGCGACCTGAACCGGGCCGGCCAGAGGCAGGTCTTCTTTGAGCTCAATGGGCAGCTGC 3253
||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 3183 CAAAGCCCTGGCTGTAAGCGACCTGAACCGTGCTGGCCAGAGGCAGGTGTTCTTTGAACTCAATGGGCAGCTTC 3256
Query 3254 GGTCCATCTTGGTCAAGGACACCCAGGCCATGAAGGAGATGCACTTCCACCCCAAGGCCCTAAAGGACGTGAAG 3327
|.|||||..||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||..|.|||||.||||||
Sbjct 3257 GATCCATTCTGGTTAAAGACACCCAGGCCATGAAGGAGATGCACTTCCATCCCAAGGCTTTGAAGGATGTGAAG 3330
Query 3328 GGCCAGATCGGGGCGCCCATGCCTGGGAAGGTGATAGACATCAAAGTGGTGGCAGGGGCCAAGGTGGCCAAGGG 3401
|||||.||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||..|||||||.|||||||||.|||||
Sbjct 3331 GGCCAAATTGGGGCCCCGATGCCTGGGAAGGTCATAGACATCAAGGTGGCAGCAGGGGACAAGGTGGCTAAGGG 3404
Query 3402 CCAGCCCCTGTGTGTGCTCAGTGCCATGAAGATGGAGACTGTGGTGACCTCACCCATGGAGGGTACTGTCCGCA 3475
|||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||.||||.|
Sbjct 3405 CCAGCCCCTCTGTGTGCTCAGCGCCATGAAGATGGAGACTGTGGTGACTTCGCCCATGGAGGGCACTATCCGAA 3478
Query 3476 AGGTTCATGTGACCAAGGACATGACACTGGAAGGTGACGACCTCATCCTGGAGATCGAG 3534
||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 3479 AGGTTCATGTTACCAAGGACATGACTCTGGAAGGCGACGACCTCATCCTAGAGATTGAG 3537