Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01147
• Subject: NM_001162946.1
• Aligned Length: 1179
• Identities: 1140
• Gaps: 1

Alignment

Query    1  -MLKFRTVHGGLRLLGIRRTSTAPAASPNVRRLEYKPIKKVMVANRGEIAIRVFRACTELGIRTVAIYSEQDTG  73
             ||||.||.|||||||.||.|.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct    1  MMLKFQTVRGGLRLLGVRRSSSAPVASPNVRRLEYKPIKKVMVANRGEIAIRVFRACTELGIRTVAVYSEQDTG  74

Query   74  QMHRQKADEAYLIGRGLAPVQAYLHIPDIIKVAKENNVDAVHPGYGFLSERADFAQACQDAGVRFIGPSPEVVR  147
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  QMHRQKADEAYLIGRGLAPVQAYLHIPDIIKVAKENGVDAVHPGYGFLSERADFAQACQDAGVRFIGPSPEVVR  148

Query  148  KMGDKVEARAIAIAAGVPVVPGTDAPITSLHEAHEFSNTYGFPIIFKAAYGGGGRGMRVVHSYEELEENYTRAY  221
            ||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  KMGDKVEARAIAIAAGVPVVPGTDSPISSLHEAHEFSNTYGFPIIFKAAYGGGGRGMRVVHSYEELEENYTRAY  222

Query  222  SEALAAFGNGALFVEKFIEKPRHIEVQILGDQYGNILHLYERDCSIQRRHQKVVEIAPAAHLDPQLRTRLTSDS  295
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||
Sbjct  223  SEALAAFGNGALFVEKFIEKPRHIEVQILGDQYGNILHLYERDCSIQRRHQKVVEIAPATHLDPQLRSRLTSDS  296

Query  296  VKLAKQVGYENAGTVEFLVDRHGKHYFIEVNSRLQVEHTVTEEITDVDLVHAQIHVAEGRSLPDLGLRQENIRI  369
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  297  VKLAKQVGYENAGTVEFLVDKHGKHYFIEVNSRLQVEHTVTEEITDVDLVHAQIHVSEGRSLPDLGLRQENIRI  370

Query  370  NGCAIQCRVTTEDPARSFQPDTGRIEVFRSGEGMGIRLDNASAFQGAVISPHYDSLLVKVIAHGKDHPTAATKM  443
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  NGCAIQCRVTTEDPARSFQPDTGRIEVFRSGEGMGIRLDNASAFQGAVISPHYDSLLVKVIAHGKDHPTAATKM  444

Query  444  SRALAEFRVRGVKTNIAFLQNVLNNQQFLAGTVDTQFIDENPELFQLRPAQNRAQKLLHYLGHVMVNGPTTPIP  517
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  SRALAEFRVRGVKTNIPFLQNVLNNQQFLAGTVDTQFIDENPELFQLRPAQNRAQKLLHYLGHVMVNGPTTPIP  518

Query  518  VKASPSPTDPVVPAVPIGPPPAGFRDILLREGPEGFARAVRNHPGLLLMDTTFRDAHQSLLATRVRTHDLKKIA  591
            |..||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  VNVSPSPVDPAVPVVPIGPPPAGFRDILLREGPEGFARAVRNHQGLLLMDTTFRDAHQSLLATRVRTHDLKKIA  592

Query  592  PYVAHNFSKLFSMENWGGATFDVAMRFLYECPWRRLQELRELIPNIPFQMLLRGANAVGYTNYPDNVVFKFCEV  665
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  PYVAHNFNKLFSMENWGGATFDVAMRFLYECPWRRLQELRELIPNIPFQMLLRGANAVGYTNYPDNVVFKFCEV  666

Query  666  AKENGMDVFRVFDSLNYLPNMLLGMEAAGSAGGVVEAAISYTGDVADPSRTKYSLQYYMGLAEELVRAGTHILC  739
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  667  AKENGMDVFRVFDSLNYLPNMLLGMEAAGSAGGVVEAAISYTGDVADPSRTKYSLEYYMGLAEELVRAGTHILC  740

Query  740  IKDMAGLLKPTACTMLVSSLRDRFPDLPLHIHTHDTSGAGVAAMLACAQAGADVVDVAADSMSGMTSQPSMGAL  813
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  741  IKDMAGLLKPAACTMLVSSLRDRFPDLPLHIHTHDTSGAGVAAMLACAQAGADVVDVAVDSMSGMTSQPSMGAL  814

Query  814  VACTRGTPLDTEVPMERVFDYSEYWEGARGLYAAFDCTATMKSGNSDVYENEIPGGQYTNLHFQAHSMGLGSKF  887
            ||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  VACTKGTPLDTEVPLERVFDYSEYWEGARGLYAAFDCTATMKSGNSDVYENEIPGGQYTNLHFQAHSMGLGSKF  888

Query  888  KEVKKAYVEANQMLGDLIKVTPSSKIVGDLAQFMVQNGLSRAEAEAQAEELSFPRSVVEFLQGYIGVPHGGFPE  961
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  889  KEVKKAYVEANQMLGDLIKVTPSSKIVGDLAQFMVQNGLSRAEAEAQAEELSFPRSVVEFLQGYIGIPHGGFPE  962

Query  962  PFRSKVLKDLPRVEGRPGASLPPLDLQALEKELVDRHGEEVTPEDVLSAAMYPDVFAHFKDFTATFGPLDSLNT  1035
            ||||||||||||.|||||||||||.|..|||.|.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  963  PFRSKVLKDLPRIEGRPGASLPPLNLKELEKDLIDRHGEEVTPEDVLSAAMYPDVFAQFKDFTATFGPLDSLNT  1036

Query 1036  RLFLQGPKIAEEFEVELERGKTLHIKALAVSDLNRAGQRQVFFELNGQLRSILVKDTQAMKEMHFHPKALKDVK  1109
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  RLFLQGPKIAEEFEVELERGKTLHIKALAVSDLNRAGQRQVFFELNGQLRSILVKDTQAMKEMHFHPKALKDVK  1110

Query 1110  GQIGAPMPGKVIDIKVVAGAKVAKGQPLCVLSAMKMETVVTSPMEGTVRKVHVTKDMTLEGDDLILEIE  1178
            ||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GQIGAPMPGKVIDIKVAAGDKVAKGQPLCVLSAMKMETVVTSPMEGTIRKVHVTKDMTLEGDDLILEIE  1179