Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_01150
Subject:
XM_006511370.2
Aligned Length:
1627
Identities:
1312
Gaps:
134

Alignment

Query    1  ATGGCGGCGGC-ATTA-----CGGGTGGCGGCGGTCGGGGCAAGGCTCAGCGTTCTGGCGAGCGGTCTCCGCGC  68
            ||||||||||| ||||     ||||.||.|||||..||.||.|||||||||||||||....||||.|||.||..
Sbjct    1  ATGGCGGCGGCGATTAGGATTCGGGCGGTGGCGGCTGGAGCGAGGCTCAGCGTTCTGAATTGCGGCCTCGGCAT  74

Query   69  CGCGGTCCGCAGCCTTTGCAGCCAGGCCACC----TCTGTTAACGAACGCATCGAAAACAAGCGCCGGACCGCG  138
            |.||..||||.||||||||||||||    ||    ||.|||||.||.||||||||.||||||||||...|.|||
Sbjct   75  CACGACCCGCGGCCTTTGCAGCCAG----CCGGTTTCAGTTAAAGAGCGCATCGACAACAAGCGCCATGCAGCG  144

Query  139  CTGCTGGGAGGGGGCCAACGCCGTATTGACGCGCAGCACAAGCGAGGAAAGCTAACAGCCAGGGAGAGGATCAG  212
            .||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||                             
Sbjct  145  TTGCTGGGAGGAGGCCAGCGCCGCATCGACGCGCAGCACAAGCGA-----------------------------  189

Query  213  TCTCTTGCTGGACCCTGGCAGCTTTGTTGAGAGCGACATGTTTGTGGAACACAGATGTGCAGATTTTGGAATGG  286
                                                                                      
Sbjct  190  --------------------------------------------------------------------------  189

Query  287  CTGCTGATAAGAATAAGTTTCCTGGAGACAGCGTGGTCACTGGACGAGGCCGAATCAATGGAAGATTGGTTTAT  360
                             |||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  190  -----------------TTTCCCGGAGATAGTGTGGTCACTGGACGGGGCCGAATCAATGGACGATTGGTTTAT  246

Query  361  GTCTTCAGTCAGGATTTTACAGTTTTTGGAGGCAGTCTGTCAGGAGCACATGCCCAAAAGATCTGCAAAATCAT  434
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  247  GTCTTCAGTCAGGATTTTACAGTTTTTGGAGGCAGTCTGTCAGGAGCACATGCTCAAAAGATCTGCAAAATCAT  320

Query  435  GGACCAGGCCATAACGGTGGGGGCTCCAGTGATTGGGCTGAATGACTCTGGGGGAGCACGGATCCAAGAAGGAG  508
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||..|.|||||.||.||.|
Sbjct  321  GGACCAGGCCATAACAGTGGGGGCTCCAGTGATCGGGCTCAATGACTCCGGGGGCGCCAGAATCCAGGAGGGGG  394

Query  509  TGGAGTCTTTGGCTGGCTATGCAGACATCTTTCTGAGGAATGTTACGGCATCCGGAGTCATCCCTCAGATTTCT  582
            |||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct  395  TGGAGTCCTTGGCTGGCTACGCGGACATCTTCCTGAGGAATGTCACAGCGTCTGGAGTCATCCCGCAGATTTCT  468

Query  583  CTGATCATGGGCCCATGTGCTGGTGGGGCCGTCTACTCCCCAGCCCTAACAGACTTCACGTTCATGGTAAAGGA  656
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  469  CTGATCATGGGCCCGTGTGCTGGTGGGGCCGTCTACTCCCCTGCCCTAACAGACTTCACATTCATGGTGAAGGA  542

Query  657  CACCTCCTACCTGTTCATCACTGGCCCTGATGTTGTGAAGTCTGTCACCAATGAGGATGTTACCCAGGAGGAGC  730
            |||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||.|||
Sbjct  543  CACATCTTACCTGTTTATCACTGGCCCTGAAGTTGTGAAGTCTGTTACCAATGAGGATGTCACTCAAGAGCAGC  616

Query  731  TCGGTGGTGCCAAGACCCACACCACCATGTCAGGTGTGGCCCACAGAGCTTTTGAAAATGATGTTGATGCCTTG  804
            |.|||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||..||
Sbjct  617  TGGGTGGTGCCAAGACCCACACCACTGTGTCAGGTGTGGCCCATAGAGCTTTCGACAATGATGTTGATGCTCTG  690

Query  805  TGTAATCTCCGGGATTTCTTCAACTACCTGCCCCTGAGCAGTCAGGACCCGGCTCCCGTCCGTGAGTGCCACGA  878
            |||||.||.||.||.||||||||.|.|||||||||.|||||.|||||||||||||||.||||.||||||||.||
Sbjct  691  TGTAACCTGCGTGAATTCTTCAATTTCCTGCCCCTCAGCAGCCAGGACCCGGCTCCCATCCGAGAGTGCCATGA  764

Query  879  TCCCAGTGACCGTCTGGTTCCTGAGCTTGACACAATTGTCCCTTTGGAATCAACCAAAGCCTACAACATGGTGG  952
            .||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||.||||.||||||||||||||||.|||
Sbjct  765  CCCCAGTGACCGTCTGGTTCCTGAGCTGGACACAGTTGTCCCTTTGGAGTCAAGCAAAGCCTACAACATGCTGG  838

Query  953  ACATCATACACTCTGTTGTTGATGAGCGTGAATTTTTTGAGATCATGCCCAATTATGCCAAGAACATCATTGTT  1026
            |||||||.|||.|.||..||||.|||.|.||.|||||||||||.|||||||.|||.||.||.||.||..|.|||
Sbjct  839  ACATCATCCACGCAGTGATTGACGAGAGAGAGTTTTTTGAGATAATGCCCAGTTACGCAAAAAATATTGTCGTT  912

Query 1027  GGTTTTGCAAGAATGAATGGGAGGACTGTTGGAATTGTTGGCAACCAACCTAAGGTGGCCTCAGGATGCTTGGA  1100
            ||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  913  GGCTTCGCAAGAATGAATGGGAGGACCGTTGGAATTGTCGGCAACCAGCCCAATGTGGCCTCAGGGTGCTTGGA  986

Query 1101  TATTAATTCATCTGTGAAAGGGGCTCGTTTTGTCAGATTCTGTGATGCATTCAATATTCCACTCATCACTTTTG  1174
            .|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct  987  CATTAATTCATCCGTGAAGGGGGCTCGTTTTGTCAGATTCTGTGACGCATTCAACATTCCCCTCATCACTTTCG  1060

Query 1175  TTGATGTCCCTGGCTTTCTACCTGGCACAGCACAGGAATACGGGGGCATCATCCGGCATGGTGCCAAGCTTCTC  1248
            ||||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||.||.||||||||||||.||||||||||||||||.|||
Sbjct 1061  TTGACGTCCCTGGCTTCCTGCCTGGCACGGCGCAGGAGTATGGGGGCATCATCAGGCATGGTGCCAAGCTGCTC  1134

Query 1249  TACGCATTTGCTGAGGCAACTGTACCCAAAGTCACAGTCATCACCAGGAAGGCCTATGGAGGTGCCTATGATGT  1322
            |||||.||.||.|||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1135  TACGCGTTCGCCGAGGCAACTGTGCCCAAAATCACAGTCATCACCAGGAAGGCCTATGGAGGTGCCTATGATGT  1208

Query 1323  CATGAGCTCTAAGCACCTTTGTGGTGATACCAACTATGCCTGGCCCACCGCAGAGATTGCAGTCATGGGAGCAA  1396
            |||||||||.||.||||||..||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1209  CATGAGCTCCAAACACCTTCTTGGTGACACCAACTATGCCTGGCCCACAGCTGAGATTGCGGTCATGGGAGCAA  1282

Query 1397  AGGGCGCTGTGGAGATCATCTTCAAAGGGCATGAGAATGTGGAAGCTGCTCAGGCAGAGTACATCGAGAAGTTT  1470
            ||||.|||||||||||||||||||||||.||..|..||||||||||.||.|||||||||||..|.||||||||.
Sbjct 1283  AGGGTGCTGTGGAGATCATCTTCAAAGGACACCAAGATGTGGAAGCCGCCCAGGCAGAGTATGTGGAGAAGTTC  1356

Query 1471  GCCAACCCTTTCCCTGCAGCAGTGCGAGGGTTTGTGGATGACATCATCCAACCTTCTTCCACACGTGCCCGAAT  1544
            ||||||||||||||.|||||.|||.|||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.||.||
Sbjct 1357  GCCAACCCTTTCCCAGCAGCCGTGAGAGGGTTTGTGGATGACATCATCCAGCCATCCTCTACTCGTGCTCGGAT  1430

Query 1545  CTGCTGTGACCTGGATGTCTTGGCCAGCAAGAAGGTACAACGTCCTTGGAGAAAACATGCAAATATTCCATTG  1617
            .||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||.||
Sbjct 1431  ATGCTGTGACCTGGAAGTCCTGGCCAGCAAGAAGGTCCATCGTCCCTGGAGGAAACATGCAAATATCCCACTG  1503