Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_01257
- Subject:
- XM_006496707.3
- Aligned Length:
- 1441
- Identities:
- 1228
- Gaps:
- 20
Alignment
Query 1 ATGGGCCGGACCGTGGTCGTGCTGGGCGGAGGCATCAGCGGCTTGGCCGCCAGTTACCACCTGAGCCGGGCCCC 74
|||||||||||.|||.|.||.||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.||.||||.|||.|.|||
Sbjct 1 ATGGGCCGGACTGTGATAGTACTTGGCGGAGGTATCAGTGGATTGGCCGCAAGTTATCATCTGATCCGAGGCCC 74
Query 75 CTGCCCCCCTAAGGTGGTCCTAGTGGAGAGCAGTGAGCGTCTGGGAGGCTGGATTCGCTCCGTTCGAGGCCCTA 148
|.|.||.|||||||||.||.||||||||.||||..|||||.|||||||.|||||.|||||..|.|||||..|..
Sbjct 75 CAGTCCTCCTAAGGTGATCTTAGTGGAGGGCAGCAAGCGTTTGGGAGGATGGATCCGCTCAATCCGAGGATCAG 148
Query 149 ATGGTGCTATCTTTGAGCTTGGACCTCGGGGAATTAGGCCAGCGGGAGCCCTAGGGGCCCGGACCTTGCTCCTG 222
|||||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||.||||||||
Sbjct 149 ATGGTGCGATCTTTGAACTTGGACCTCGAGGGATTAGGCCGGCTGGAGCCCTGGGAGCCCGGACCCTGCTCCTG 222
Query 223 GTTTCTGAGCTTGGCTTGGATTCAGAAGTGCTGCCTGTCCGGGGAGACCACCCAGCTGCCCAGAACAGGTTCCT 296
||||||||.|||||||||||.||.|||||..||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GTTTCTGAACTTGGCTTGGAGTCTGAAGTCTTGCCTGTCCGAGGGGATCACCCAGCTGCCCAGAACAGGTTCCT 296
Query 297 CTACGTGGGCGGTGCCCTGCATGCCCTACCCACTGGCCTCAGGGGGCTACTCCGCCCTTCACCCCCCTTCTCCA 370
.||.||.||||||.|||||||..|.||||||.|.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 297 GTATGTAGGCGGTACCCTGCACCCTCTACCCTCCGGCCTCAGGGGGCTACTCCGTCCTTCACCCCCCTTCTCAA 370
Query 371 AACCTCTGTTTTGGGCTGGGCTGAGGGAGCTGACCAAGCCCCGGGGCAAAGAGCCTGATGAGACTGTGCACAGT 444
|||||||||||||||||||||||||||||.||...||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 371 AACCTCTGTTTTGGGCTGGGCTGAGGGAGTTGCTGAAGCCCAGGGGCAAAGAGCCTGATGAAACTGTGCACAGT 444
Query 445 TTTGCCCAGCGCCGCCTTGGACCTGAGGTGGCGTCTCTAGCCATGGACAGTCTCTGCCGTGGAGTGTTTGCAGG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||
Sbjct 445 TTTGCCCAGCGCCGCCTTGGACCTGAGGTGGCATCTTTAGCCATGGACAGTCTTTGCCGAGGAGTATTTGCTGG 518
Query 519 CAACAGCCGTGAGCTCAGCATCAGGTCCTGCTTTCCCAGTCTCTTCCAAGCTGAGCAAACCCATCGTTCCATAT 592
|||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||
Sbjct 519 CAACAGCCGGGAGCTCAGCATCCGGTCCTGCTTTCCCAGTCTCTTCCAAGCTGAACAAACCCACCGGTCCATAT 592
Query 593 TACTGGGCCTGCTGCTGGGGGCAGGGCGGACCCCACAGCCAGACTCAGCACTCATTCGCCAGGCCTTGGCTGAG 666
|.|||||.|||||||||||.|||||.|.||..||.|||||.||.||..||||.|||||.||||||..|||||||
Sbjct 593 TGCTGGGGCTGCTGCTGGGCGCAGGACAGAGTCCCCAGCCGGATTCCTCACTAATTCGTCAGGCCCGGGCTGAG 666
Query 667 CGCTGGAGCCAGTGGTCACTTCGTGGAGGTCTAGAGATGTTGCCTCAGGCCCTTGAAACCCACCTGACTAGTAG 740
||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||.|||||||.|||||.|||.|.|..|||||..|.||||.
Sbjct 667 CGATGGAGCCAGTGGTCACTCCGTGGAGGGCTGGAGGTGTTGCCCCAGGCTCTTCACAATCACCTAGCAAGTAA 740
Query 741 GGGGGTCAGTGTTCTCAGAGGCCAGCCGGTCTGTGGGCTCAGCCTCCAGGCAGAAGGGCGCTGGAAGGTATCTC 814
.|||||||.|||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||.||||
Sbjct 741 AGGGGTCACTGTCCTCAGTGGGCAGCCAGTCTGTGGGCTCAGCCTTCAGCCAGAAGGGCGCTGGAAGGTGTCTC 814
Query 815 TAAGGGACAGCAGTCTGGAGGCTGACCACGTTATTAGTGCCATTCCAGCTTCAGTGCTCAGTGAGCTGCTCCCT 888
||.||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||.||||||..|||||||||||
Sbjct 815 TAGGGGACAGCAGTCTGGAGGCTGACCACATTATAAGTGCCATTCCAGCTTCAGAGCTCAGCAAGCTGCTCCCT 888
Query 889 GCTGAGGCTGCCCCTCTGGCTCGTGCCCTGAGTGCCATCACTGCAGTGTCTGTAGCTGTGGTGAATCTGCAGTA 962
||.||||||||.|||||.|||||...|||||||.||||||..|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GCCGAGGCTGCACCTCTAGCTCGAATCCTGAGTACCATCAAGGCAGTGTCTGTTGCTGTGGTGAATCTGCAGTA 962
Query 963 CCAAGGAGCCCATCTGCCTGTCCAGGGATTTGGACATTTGGTGCCATCTTCAGAAGATCCAGGA--GTCCTGGG 1034
||.||||||...||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|| || ||||||||
Sbjct 963 CCGAGGAGCTTGTCTGCCTGTCCAGGGATTTGGACATTTGGTGCCATCGTCAGAAGACCC--GACTGTCCTGGG 1034
Query 1035 AATCGTGTATGACTCAGTTGCTTTCCCTGAGCAGGACGGGAGCCCCCCTGGCCTCAGAGTGACTGTGATGCTGG 1108
|||.|||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.||||.||||||..||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1035 AATTGTGTACGACTCGGTGGCTTTTCCTGAACAGGATGGGAACCCCCCAAGCCTCAGAGTGACTGTGATGTTGG 1108
Query 1109 GAGGTTCCTGGTTACAGACACTGGAGGCTAGTGG--------CTGTGTCTTATCTCAGGAGCTGTTTCAACAGC 1174
||||||.||||.||||||..||..|.||| |.|| ||| ||||..||||||||.||.||.|
Sbjct 1109 GAGGTTACTGGCTACAGAAGCTAAAAGCT-GCGGGCCACCAACTG-------TCTCCAGAGCTGTTCCAGCAAC 1174
Query 1175 GGGCCCAGGAAGCAGCTGCTACACAATTAGGACTGAAGGAGATGCCGAGCCACTGCTTGGTCCATCTACACAAG 1248
..||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||....|||||.||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1175 AAGCCCAGGAGGCAGCCGCCACACAGTTAGGACTGAAAGAACCACCGAGTCACTGCCTGGTCCATCTACACAAG 1248
Query 1249 AACTGCATTCCCCAGTATACACTAGGTCACTGGCAAAAACTAGAGTCAGCTAGGCAATTCCTGACTGCTCACAG 1322
|||||.||.||.|||||||||.||||.|||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||.||.||.||
Sbjct 1249 AACTGTATCCCTCAGTATACAATAGGCCACTGGCAAAAACTAGACTCAGCTATGCAATTCCTGACGGCCCAGAG 1322
Query 1323 GTTGCCCCTGACTCTGGCTGGAGCCTCCTATGAGGGAGTTGCTGTTAATGACTGTATAGAGAGTGGGCGCCAGG 1396
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1323 GTTGCCCCTGACTTTGGCTGGAGCCTCCTATGAGGGGGTTGCTGTCAATGACTGTATAGAGAGTGGGCGCCAGG 1396
Query 1397 CAGCAGTCAGTGTCCTGGGCACAGAACCTAACAGC 1431
|||||||...||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1397 CAGCAGTTGCTGTCCTGGGCACAGAATCTAACAGC 1431