Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_01257
- Subject:
- XM_011238773.2
- Aligned Length:
- 1457
- Identities:
- 1112
- Gaps:
- 184
Alignment
Query 1 ATGGGCCGGACCGTGGTCGTGCTGGGCGGAGGCATCAGCGGCTTGGCCGCCAGTTACCACCTGAGCCGGGCCCC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CTGCCCCCCTAAGGTGGTCCTAGTGGAGAGCAGTGAGCGTCTGGGAGGCTGGATTCGCTCCGTTCGAGGCCCTA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 ATGGTGCTATCTTTGAGCTTGGACCTCGGGGAATTAGGCCAGCGGGAGCCCTAGGGGCCCGGACCTTGCTCCT- 221
|||||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||.|||||||
Sbjct 1 ATGGTGCGATCTTTGAACTTGGACCTCGAGGGATTAGGCCGGCTGGAGCCCTGGGAGCCCGGACCCTGCTCCTG 74
Query 222 ---------------GGTTTCTGAGCTTGGCTTGGATTCAGAAGTGCTGCCTGTCCGGGGAGACCACCCAGCTG 280
|||||||||.|||||||||||.||.|||||..||||||||||.||.||.||||||||||
Sbjct 75 GGCTTGTGGAGAACAGGTTTCTGAACTTGGCTTGGAGTCTGAAGTCTTGCCTGTCCGAGGGGATCACCCAGCTG 148
Query 281 CCCAGAACAGGTTCCTCTACGTGGGCGGTGCCCTGCATGCCCTACCCACTGGCCTCAGGGGGCTACTCCGCCCT 354
||||||||||||||||.||.||.||||||.|||||||..|.||||||.|.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 149 CCCAGAACAGGTTCCTGTATGTAGGCGGTACCCTGCACCCTCTACCCTCCGGCCTCAGGGGGCTACTCCGTCCT 222
Query 355 TCACCCCCCTTCTCCAAACCTCTGTTTTGGGCTGGGCTGAGGGAGCTGACCAAGCCCCGGGGCAAAGAGCCTGA 428
||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||...||||||.||||||||||||||||
Sbjct 223 TCACCCCCCTTCTCAAAACCTCTGTTTTGGGCTGGGCTGAGGGAGTTGCTGAAGCCCAGGGGCAAAGAGCCTGA 296
Query 429 TGAGACTGTGCACAGTTTTGCCCAGCGCCGCCTTGGACCTGAGGTGGCGTCTCTAGCCATGGACAGTCTCTGCC 502
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.||||
Sbjct 297 TGAAACTGTGCACAGTTTTGCCCAGCGCCGCCTTGGACCTGAGGTGGCATCTTTAGCCATGGACAGTCTTTGCC 370
Query 503 GTGGAGTGTTTGCAGGCAACAGCCGTGAGCTCAGCATCAGGTCCTGCTTTCCCAGTCTCTTCCAAGCTGAGCAA 576
|.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 371 GAGGAGTATTTGCTGGCAACAGCCGGGAGCTCAGCATCCGGTCCTGCTTTCCCAGTCTCTTCCAAGCTGAACAA 444
Query 577 ACCCATCGTTCCATATTACTGGGCCTGCTGCTGGGGGCAGGGCGGACCCCACAGCCAGACTCAGCACTCATTCG 650
|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|.||..||.|||||.||.||..||||.|||||
Sbjct 445 ACCCACCGGTCCATATTGCTGGGGCTGCTGCTGGGCGCAGGACAGAGTCCCCAGCCGGATTCCTCACTAATTCG 518
Query 651 CCAGGCCTTGGCTGAGCGCTGGAGCCAGTGGTCACTTCGTGGAGGTCTAGAGATGTTGCCTCAGGCCCTTGAAA 724
.||||||..|||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||.|||||||.|||||.|||.|.|
Sbjct 519 TCAGGCCCGGGCTGAGCGATGGAGCCAGTGGTCACTCCGTGGAGGGCTGGAGGTGTTGCCCCAGGCTCTTCACA 592
Query 725 CCCACCTGACTAGTAGGGGGGTCAGTGTTCTCAGAGGCCAGCCGGTCTGTGGGCTCAGCCTCCAGGCAGAAGGG 798
..|||||..|.||||..|||||||.|||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||.||||||||
Sbjct 593 ATCACCTAGCAAGTAAAGGGGTCACTGTCCTCAGTGGGCAGCCAGTCTGTGGGCTCAGCCTTCAGCCAGAAGGG 666
Query 799 CGCTGGAAGGTATCTCTAAGGGACAGCAGTCTGGAGGCTGACCACGTTATTAGTGCCATTCCAGCTTCAGTGCT 872
|||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||.|||
Sbjct 667 CGCTGGAAGGTGTCTCTAGGGGACAGCAGTCTGGAGGCTGACCACATTATAAGTGCCATTCCAGCTTCAGAGCT 740
Query 873 CAGTGAGCTGCTCCCTGCTGAGGCTGCCCCTCTGGCTCGTGCCCTGAGTGCCATCACTGCAGTGTCTGTAGCTG 946
|||..|||||||||||||.||||||||.|||||.|||||...|||||||.||||||..|||||||||||.||||
Sbjct 741 CAGCAAGCTGCTCCCTGCCGAGGCTGCACCTCTAGCTCGAATCCTGAGTACCATCAAGGCAGTGTCTGTTGCTG 814
Query 947 TGGTGAATCTGCAGTACCAAGGAGCCCATCTGCCTGTCCAGGGATTTGGACATTTGGTGCCATCTTCAGAAGAT 1020
||||||||||||||||||.||||||...||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 815 TGGTGAATCTGCAGTACCGAGGAGCTTGTCTGCCTGTCCAGGGATTTGGACATTTGGTGCCATCGTCAGAAGAC 888
Query 1021 CCAGGA--GTCCTGGGAATCGTGTATGACTCAGTTGCTTTCCCTGAGCAGGACGGGAGCCCCCCTGGCCTCAGA 1092
|| || |||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.||||.||||||..||||||||
Sbjct 889 CC--GACTGTCCTGGGAATTGTGTACGACTCGGTGGCTTTTCCTGAACAGGATGGGAACCCCCCAAGCCTCAGA 960
Query 1093 GTGACTGTGATGCTGGGAGGTTCCTGGTTACAGACACTGGAGGCTAGTGG--------CTGTGTCTTATCTCAG 1158
||||||||||||.|||||||||.||||.||||||..||..|.||| |.|| ||| ||||..
Sbjct 961 GTGACTGTGATGTTGGGAGGTTACTGGCTACAGAAGCTAAAAGCT-GCGGGCCACCAACTG-------TCTCCA 1026
Query 1159 GAGCTGTTTCAACAGCGGGCCCAGGAAGCAGCTGCTACACAATTAGGACTGAAGGAGATGCCGAGCCACTGCTT 1232
||||||||.||.||.|..||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||....|||||.||||||.|
Sbjct 1027 GAGCTGTTCCAGCAACAAGCCCAGGAGGCAGCCGCCACACAGTTAGGACTGAAAGAACCACCGAGTCACTGCCT 1100
Query 1233 GGTCCATCTACACAAGAACTGCATTCCCCAGTATACACTAGGTCACTGGCAAAAACTAGAGTCAGCTAGGCAAT 1306
|||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||.||||.|||||||||||||||||.|||||||.|||||
Sbjct 1101 GGTCCATCTACACAAGAACTGTATCCCTCAGTATACAATAGGCCACTGGCAAAAACTAGACTCAGCTATGCAAT 1174
Query 1307 TCCTGACTGCTCACAGGTTGCCCCTGACTCTGGCTGGAGCCTCCTATGAGGGAGTTGCTGTTAATGACTGTATA 1380
|||||||.||.||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1175 TCCTGACGGCCCAGAGGTTGCCCCTGACTTTGGCTGGAGCCTCCTATGAGGGGGTTGCTGTCAATGACTGTATA 1248
Query 1381 GAGAGTGGGCGCCAGGCAGCAGTCAGTGTCCTGGGCACAGAACCTAACAGC 1431
|||||||||||||||||||||||...||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1249 GAGAGTGGGCGCCAGGCAGCAGTTGCTGTCCTGGGCACAGAATCTAACAGC 1299