Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01283
• Subject: XM_006523833.2
• Aligned Length: 2218
• Identities: 1648
• Gaps: 404

Alignment

Query    1  ATGGTAGTGTTCAATGGCCTTCTTAAGATCAAAATCTGCGAGGCCGTGAGCTTGAAGCCCACAGCCTGGTCGCT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GCGCCATGCGGTGGGACCCCGGCCGCAGACTTTCCTTCTCGACCCCTACATTGCCCTCAATGTGGACGACTCGC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GCATCGGCCAAACGGCCACCAAGCAGAAGACCAACAGCCCGGCCTGGCACGACGAGTTCGTCACCGATGTGTGC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  AACGGACGCAAGATCGAGCTGGCTGTCTTTCACGATGCCCCCATAGGCTACGACGACTTCGTGGCCAACTGCAC  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CATCCAGTTTGAGGAGCTGCTGCAGAACGGGAGCCGCCACTTCGAGGACTGGATTGATCTGGAGCCAGAAGGAA  370
                                                                    ||         |||||| 
Sbjct    1  --------------------------------------------------------AT---------GAAGGA-  8

Query  371  GAGTGTATGTGATCATCGATCTCTCAGGGT--CGTCGGGTGAAGCCCCTAAAGACAATGAAGAGCGTGTGTTCA  442
                                  |||||..|  |.|        ||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct    9  ----------------------CTCAGACTCCCTT--------GCCCCTAAAGACAATGAAGAACGAGTGTTCA  52

Query  443  GGGAACGCATGCGGCCGAGGAAGCGGCAGGGGGCCGTCAGGCGCAGGGTCCATCAGGTCAACGGCCACAAGTTC  516
            ||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct   53  GGGAGCGTATGCGGCCAAGGAAGCGGCAAGGGGCTGTCAGGCGCAGGGTCCACCAGGTCAATGGCCACAAGTTC  126

Query  517  ATGGCCACCTATCTT-CGGCAGCCCACCTACTGCTCCCATTGCAGAGACTTCATCTGGGGTGTCATAGGAAAGC  589
            ||||||||||| ||| |||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  127  ATGGCCACCTA-CTTGCGGCAACCCACCTACTGCTCCCACTGCAGAGATTTCATCTGGGGTGTCATAGGAAAAC  199

Query  590  AGGGATACCAGTGTCAAGTCTGCACCTGCGTGGTCCACAAGCGGTGCCACGAGCTCATAATCACAAAGTGTGCT  663
            |||||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||.|||
Sbjct  200  AGGGATATCAATGTCAAGTTTGCACTTGCGTTGTCCACAAGCGATGTCATGAGCTCATTATTACAAAGTGCGCT  273

Query  664  GGGTTAAAGAAGCAGGAGACCCCCGACCAGGTGGGCTCCCAGCGGTTCAGCGTCAACATGCCCCACAAGTTCGG  737
            |||.|.|||||.|||||.|||||.|||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  274  GGGCTGAAGAAACAGGAAACCCCTGACGAGGTGGGCTCCCAACGGTTCAGCGTCAACATGCCCCACAAGTTCGG  347

Query  738  TATCCACAACTACAAGGTCCCTACCTTCTGCGATCACTGTGGGTCCCTGCTCTGGGGACTCTTGCGGCAGGGTT  811
            .||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct  348  GATCCACAACTACAAGGTCCCCACGTTCTGTGACCACTGTGGGTCCCTGCTCTGGGGCCTCTTGCGGCAGGGCT  421

Query  812  TGCAGTGTAAAGTCTGCAAAATGAATGTTCACCGTCGATGTGAGACCAACGTGGCTCCCAACTGTGGAGTGGAT  885
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.
Sbjct  422  TGCAGTGTAAAGTCTGCAAAATGAATGTTCACCGGCGATGTGAGACCAATGTGGCTCCCAACTGTGGGGTAGAC  495

Query  886  GCCAGAGGAATCGCCAAAGTACTGGCCGACCTGGGCGTTACCCCAGACAAAATCACCAACAGCGGCCAGAGAAG  959
            |||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||
Sbjct  496  GCCAGAGGAATTGCCAAAGTGCTGGCTGACCTTGGTGTTACTCCAGACAAAATCACCAACAGTGGCCAAAGGAG  569

Query  960  GAAAAAGCTCATTGCTGGTGCCGAGTCCCCGCAGCCTGCTTCTGGAAGCTCACCATCTGAGGAAGATCGATCCA  1033
            ||||||||||..|||||||||.||||||||.|||||.||||||||||.|||.||||||||.||.||.|||||||
Sbjct  570  GAAAAAGCTCGCTGCTGGTGCTGAGTCCCCACAGCCGGCTTCTGGAAACTCCCCATCTGAAGACGACCGATCCA  643

Query 1034  AGTCAGCACCCACCTCCCCTTGTGACCAGGAAATAAAAGAACTTGAGAACAACATTCGGAAAGCCTTGTCATTT  1107
            |||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  644  AGTCAGCGCCCACCTCCCCTTGTGACCAGGAACTAAAAGAACTTGAAAACAACATTCGGAAGGCCTTGTCATTT  717

Query 1108  GACAACCGAGGAGAGGAGCACCGGGCAGCATCGT----CTCCTGATGGCCAGCTGATGAGCCCCGGTGAGAATG  1177
            |||||||||||||||||||||||   |||.||||    |.|| ||||||||||||...||||||||.|||||.|
Sbjct  718  GACAACCGAGGAGAGGAGCACCG---AGCGTCGTCGGCCACC-GATGGCCAGCTGGCAAGCCCCGGAGAGAACG  787

Query 1178  GCGAAGTCCGGCAAGGCCAGGCCAAGCGCCTGGGCCTGGATGAGTTCAACTTCATCAAGGTGTTGGGCAAAGGC  1251
            |.||||||||||.||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  788  GGGAAGTCCGGCCAGGCCAGGCCAAGCGCTTGGGGCTGGATGAGTTCAACTTCATCAAGGTGTTGGGCAAAGGC  861

Query 1252  AGCTTTGGCAAGGTCATGTTGGCAGAACTCAAGGGCAAAGATGAAGTATATGCTGTGAAGGTCTTAAAGAAGGA  1325
            |||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct  862  AGCTTTGGCAAGGTCATGTTGGCGGAACTCAAAGGCAAAGATGAAGTCTACGCTGTGAAGGTCTTGAAGAAGGA  935

Query 1326  CGTCATCCTTCAGGATGATGACGTGGACTGCACAATGACAGAGAAGAGGATTTTGGCTCTGGCACGGAAACACC  1399
            |||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  936  CGTTATCCTACAAGACGATGATGTGGACTGCACAATGACAGAGAAGAGGATTTTGGCTCTGGCTCGGAAACACC  1009

Query 1400  CGTACCTTACCCAACTCTACTGCTGCTTCCAGACCAAGGACCGCCTCTTTTTCGTCATGGAATATGTAAATGGT  1473
            |.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1010  CTTATCTAACCCAACTCTATTGCTGCTTCCAGACCAAGGACCGCCTCTTCTTCGTCATGGAATATGTAAATGGT  1083

Query 1474  GGAGACCTCATGTTTCAGATTCAGCGCTCCCGAAAATTCGACGAGCCTCGTTCACGGTTCTATGCTGCAGAGGT  1547
            ||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1084  GGAGACCTCATGTTCCAGATTCAGCGGTCCCGAAAATTTGATGAGCCTCGTTCTCGGTTCTATGCCGCAGAGGT  1157

Query 1548  CACATCGGCCCTCATGTTCCTCCACCAGCATGGAGTCATCTACAGGGATTTGAAACTGGACAACATCCTTCTGG  1621
            ||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1158  CACATCAGCCCTCATGTTTCTCCACCAGCACGGAGTGATCTACAGGGATTTGAAACTGGACAACATCCTTCTAG  1231

Query 1622  ATGCAGAAGGTCACTGCAAGCTGGCTGACTTCGGGATGTGCAAGGAAGGGATTCTGAATGGTGTGACGACCACC  1695
            ||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.|||
Sbjct 1232  ATGCAGAAGGCCACTGCAAGCTGGCTGACTTTGGGATGTGCAAGGAAGGGATTATGAATGGTGTGACAACTACC  1305

Query 1696  ACGTTCTGTGGGACTCCTGACTACATAGCTCCTGAGATCCTGCAGGAGTTGGAGTATGGCCCCTCCGTGGACTG  1769
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 1306  ACCTTCTGTGGGACTCCTGACTACATAGCTCCAGAGATCCTACAGGAGTTGGAGTACGGCCCCTCAGTGGACTG  1379

Query 1770  GTGGGCCCTGGGGGTGCTGATGTACGAGATGATGGCTGGACAGCCTCCCTTTGAGGCCGACAATGAGGACGACC  1843
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||||||.
Sbjct 1380  GTGGGCCCTGGGGGTGCTGATGTACGAGATGATGGCTGGGCAGCCCCCCTTTGAAGCTGACAACGAGGACGACT  1453

Query 1844  TATTTGAGTCCATCCTCCATGACGACGTGCTGTACCCAGTCTGGCTCAGCAAGGAGGCTGTCAGCATCTTGAAA  1917
            |.||.||.||||||||.|||||.||.||.||.||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||.|||||
Sbjct 1454  TGTTCGAATCCATCCTTCATGATGATGTTCTCTATCCTGTCTGGCTTAGCAAGGAAGCTGTCAGCATCCTGAAA  1527

Query 1918  GCTTTCATGACGAAGAATCCCCACAAGCGCCTGGGCTGTGTGGCATCGCAGAATGGCGAGGACGCCATCAAGCA  1991
            |||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||.|||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1528  GCTTTCATGACCAAGAACCCGCACAAGCGCCTGGGCTGTGTGGCAGCGCAGAACGGGGAGGACGCCATCAAGCA  1601

Query 1992  GCACCCATTCTTCAAAGAGATTGACTGGGTGCTCCTGGAGCAGAAGAAGATCAAGCCACCCTTCAAACCACGCA  2065
            .||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||..|.|
Sbjct 1602  ACATCCATTCTTCAAGGAGATTGACTGGGTACTGCTGGAGCAGAAGAAAATCAAGCCCCCCTTCAAGCCGAGAA  1675

Query 2066  TTAAAACCAAAAGAGACGTCAATAATTTTGACCAAGACTTTACCCGGGAAGAGCCGGTACTCACCCTTGTGGAC  2139
            ||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||..||||.||.||||||||.
Sbjct 1676  TTAAAACCAAAAGAGATGTCAATAACTTTGACCAAGACTTTACGCGGGAAGAGCCAATACTTACACTTGTGGAT  1749

Query 2140  GAAGCAATTGTAAAGCAGATCAACCAGGAGGAATTCAAAGGTTTCTCCTACTTTGGTGAAGACCTGATGCCC  2211
            ||||||||..|.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1750  GAAGCAATCATTAAGCAGATCAACCAGGAAGAATTCAAAGGCTTCTCCTACTTTGGTGAAGACCTGATGCCC  1821