Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01284
• Subject: XM_011541773.1
• Aligned Length: 1848
• Identities: 1687
• Gaps: 135

Alignment

Query    1  ATGCCCAGCAGGACCGGCCCCAAGATGGAAGGGAGCGGCGGCCGCGTCCGCCTCAAGGCGCATTACGGGGGGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCCAGCAGGACCGGCCCCAAGATGGAAGGGAGCGGCGGCCGCGTCCGCCTCAAGGCGCATTACGGGGGGGA  74

Query   75  CATCTTCATCACCAGCGTGGACGCCGCCACGACCTTCGAGGAGCTCTGTGAGGAAGTGAGAGACATGTGTCGTC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CATCTTCATCACCAGCGTGGACGCCGCCACGACCTTCGAGGAGCTCTGTGAGGAAGTGAGAGACATGTGTCGTC  148

Query  149  TGCACCAGCAGCACCCGCTCACCCTCAAGTGGGTGGACAGCGAAGGTGACCCTTGCACGGTGTCCTCCCAGATG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGCACCAGCAGCACCCGCTCACCCTCAAGTGGGTGGACAGCGAAGGTGACCCTTGCACGGTGTCCTCCCAGATG  222

Query  223  GAGCTGGAAGAGGCTTTCCGCCTGGCCCGTCAGTGCAGGGATGAAGGCCTCATCATTCATGTTTTCCCGAGCAC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAGCTGGAAGAGGCTTTCCGCCTGGCCCGTCAGTGCAGGGATGAAGGCCTCATCATTCATGTTTTCCCGAGCAC  296

Query  297  CCCTGAGCAGCCTGGCCTGCCATGTCCGGGAGAAGACAAATCTATCTACCGCCGGGGAGCCAGAAGATGGAGGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCCTGAGCAGCCTGGCCTGCCATGTCCGGGAGAAGACAAATCTATCTACCGCCGGGGAGCCAGAAGATGGAGGA  370

Query  371  AGCTGTACCGTGCCAACGGCCACCTCTTCCAAGCCAAGCGCTTTAACAGGAGAGCGTACTGCGGTCAGTGCAGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGCTGTACCGTGCCAACGGCCACCTCTTCCAAGCCAAGCGCTTTAACAGGAGAGCGTACTGCGGTCAGTGCAGC  444

Query  445  GAGAGGATATGGGGCCTCGCGAGGCAAGGCTACAGGTGCATCAACTGCAAACTGCTGGTCCATAAGCGCTGCCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAGAGGATATGGGGCCTCGCGAGGCAAGGCTACAGGTGCATCAACTGCAAACTGCTGGTCCATAAGCGCTGCCA  518

Query  519  CGGCCTCGTCCCGCTGACCTGCAGGAAGCATATGGATTCTGTCATGCCTTCCCAAGAGCCTCCAGTAGACGACA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CGGCCTCGTCCCGCTGACCTGCAGGAAGCATATGGATTCTGTCATGCCTTCCCAAGAGCCTCCAGTAGACGACA  592

Query  593  AGAACGAGGACGCCGACCTTCCTTCCGAGGAGACAGATGGAATTGCTTACATTTCCTCATCCCGGAAGCATGAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGAACGAGGACGCCGACCTTCCTTCCGAGGAGACAGATGGAATTGCTTACATTTCCTCATCCCGGAAGCATGAC  666

Query  667  AGCATTAAAGACGACTCGGAGGACCTTAAGCCAGTTATCGATGGGATGGATGGAATCAAAATCTCTCAGGGGCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGCATTAAAGACGACTCGGAGGACCTTAAGCCAGTTATCGATGGGATGGATGGAATCAAAATCTCTCAGGGGCT  740

Query  741  TGGGCTGCAGGACTTTGACCTAATCAGAGTCATCGGGCGCGGGAGCTACGCCAAGGTTCTCCTGGTGCGGTTGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGGGCTGCAGGACTTTGACCTAATCAGAGTCATCGGGCGCGGGAGCTACGCCAAGGTTCTCCTGGTGCGGTTGA  814

Query  815  AGAAGAATGACCAAATTTACGCCATGAAAGTGGTGAAGAAAGAGCTGGTGCATGATGACGAGGATATTGACTGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGAAGAATGACCAAATTTACGCCATGAAAGTGGTGAAGAAAGAGCTGGTGCATGATGACGAGGATATTGACTGG  888

Query  889  GTACAGACAGAGAAGCACGTGTTTGAGCAGGCATCCAGCAACCCCTTCCTGGTCGGATTACACTCCTGCTTCCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTACAGACAGAGAAGCACGTGTTTGAGCAGGCATCCAGCAACCCCTTCCTGGTCGGATTACACTCCTGCTTCCA  962

Query  963  GACGACAAGTCGGTTGTTCCTGGTCATTGAGTACGTCAACGGCGGGGACCTGATGTTCCACATGCAGAGGCAGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GACGACAAGTCGGTTGTTCCTGGTCATTGAGTACGTCAACGGCGGGGACCTGATGTTCCACATGCAGAGGCAGA  1036

Query 1037  GGAAGCTCCCTGAGGAGCACGCCAGGTTCTACGCGGCCGAGATCTGCATCGCCCTCAACTTCCTGCACGAGAGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGAAGCTCCCTGAGGAGCACGCCAGGTTCTACGCGGCCGAGATCTGCATCGCCCTCAACTTCCTGCACGAGAGG  1110

Query 1111  GGGATCATCTACAGGGACCTGAAGCTGGACAACGTCCTCCTGGATGCGGACGGGCACATCAAGCTCACAGACTA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGGATCATCTACAGGGACCTGAAGCTGGACAACGTCCTCCTGGATGCGGACGGGCACATCAAGCTCACAGACTA  1184

Query 1185  CGGCATGTGCAAGGAAGGCCTGGGCCCTGGTGACACAACGAGCACTTTCTGCGGAACCCCGAATTACATCGCCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CGGCATGTGCAAGGAAGGCCTGGGCCCTGGTGACACAACGAGCACTTTCTGCGGAACCCCGAATTACATCGCCC  1258

Query 1259  CCGAAATCCTGCGGGGAGAGGAGTACGGGTTCAGCGTGGACTGGTGGGCGCTGGGAGTCCTCATGTTTGAGATG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCGAAATCCTGCGGGGAGAGGAGTACGGGTTCAGCGTGGACTGGTGGGCGCTGGGAGTCCTCATGTTTGAGATG  1332

Query 1333  ATGGCCGGGCGCTCCCCGTTCGACATCATCACCGACAACCCGGACATGAACACAGAGGACTACCTTTTCCAAGT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATGGCCGGGCGCTCCCCGTTCGACATCATCACCGACAACCCGGACATGAACACAGAGGACTACCTTTTCCAAGT  1406

Query 1407  GATCCTGGAGAAGCCCATCCGGATCCCCCGGTTCCTGTCCGTCAAAGCCTCCCATGTTTTAAAAGGATTTTTAA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GATCCTGGAGAAGCCCATCCGGATCCCCCGGTTCCTGTCCGTCAAAGCCTCCCATGTTTTAAAAGGATTTTTAA  1480

Query 1481  ATAAGGACCCCAAAGAGAGGCTCGGCTGCCGGCCACAGACTGGATTTTCTGACATCAAGTCCCACGCGTTCTTC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ATAAGGACCCCAAAGAGAGGCTCGGCTGCCGGCCACAGACTGGATTTTCTGACATCAAGTCCCACGCGTTCTTC  1554

Query 1555  CGCAGCATAGACTGGGACTTGCTGGAGAAGAAGCAGGCGCTCCCTCCATTCCAGCCA---CAGAT-CACAGACG  1624
            |||||||||||||||||||||.||.|                         |||.||   ||||| ||||||| 
Sbjct 1555  CGCAGCATAGACTGGGACTTGATGCA-------------------------CAGACAACTCAGATGCACAGAC-  1602

Query 1625  ACTACGGTCTGGACAACTTTGACACACAGTTCACCAG-CGA---GCCCGTGCAGCTGAC-------CCCAGACG  1687
                  |.|.||||.||.|.|||||        |||| |||   |..||..|||..|||       |.||||||
Sbjct 1603  ------GCCCGGACGACGTGGACAC--------CCAGACGATGTGGACGCACAGACGACATGGACGCACAGACG  1662

Query 1688  ATGAGGATGC--------CATAAAGA---GGATCGA-----CCAGTCAGAGTTCGAAGGCTTTGAGT-ATAT-C  1743
            |||.||||||        |.||.|.|   |||| ||     |||  ||||            |||.| |.|| |
Sbjct 1663  ATGTGGATGCACGGACGACGTAGACACACGGAT-GACTCATCCA--CAGA------------TGACTCAGATGC  1721

Query 1744  A-----ACCCATTATTGCTGTC----------CACCGAGGAGTCGG---------TG---------------  1776
            |     |||||        |.|          |||.||.||..|||         ||               
Sbjct 1722  ACGGACACCCA--------GACGACGCGGACGCACAGACGACGCGGACGCACAGATGACGTGGACGCACAGA  1785