Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_01284
- Subject:
- XM_017001789.1
- Aligned Length:
- 1872
- Identities:
- 1687
- Gaps:
- 159
Alignment
Query 1 ATGCCCAGCAGGACCGGCCCCAAGATGGAAGGGAGCGGCGGCCGCGTCCGCCTCAAGGCGCATTACGGGGGGGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCCCAGCAGGACCGGCCCCAAGATGGAAGGGAGCGGCGGCCGCGTCCGCCTCAAGGCGCATTACGGGGGGGA 74
Query 75 CATCTTCATCACCAGCGTGGACGCCGCCACGACCTTCGAGGAGCTCTGTGAGGAAGTGAGAGACATGTGTCGTC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CATCTTCATCACCAGCGTGGACGCCGCCACGACCTTCGAGGAGCTCTGTGAGGAAGTGAGAGACATGTGTCGTC 148
Query 149 TGCACCAGCAGCACCCGCTCACCCTCAAGTGGGTGGACAGCGAAGGTGACCCTTGCACGGTGTCCTCCCAGATG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGCACCAGCAGCACCCGCTCACCCTCAAGTGGGTGGACAGCGAAGGTGACCCTTGCACGGTGTCCTCCCAGATG 222
Query 223 GAGCTGGAAGAGGCTTTCCGCCTGGCCCGTCAGTGCAGGGATGAAGGCCTCATCATTCATGTTTTCCCGAGCAC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAGCTGGAAGAGGCTTTCCGCCTGGCCCGTCAGTGCAGGGATGAAGGCCTCATCATTCATGTTTTCCCGAGCAC 296
Query 297 CCCTGAGCAGCCTGGCCTGCCATGTCCGGGAGAAGACAAATCTATCTACCGCCGGGGAGCCAGAAGATGGAGGA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCCTGAGCAGCCTGGCCTGCCATGTCCGGGAGAAGACAAATCTATCTACCGCCGGGGAGCCAGAAGATGGAGGA 370
Query 371 AGCTGTACCGTGCCAACGGCCACCTCTTCCAAGCCAAGCGCTTTAACAGGAGAGCGTACTGCGGTCAGTGCAGC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGCTGTACCGTGCCAACGGCCACCTCTTCCAAGCCAAGCGCTTTAACAGGAGAGCGTACTGCGGTCAGTGCAGC 444
Query 445 GAGAGGATATGGGGCCTCGCGAGGCAAGGCTACAGGTGCATCAACTGCAAACTGCTGGTCCATAAGCGCTGCCA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAGAGGATATGGGGCCTCGCGAGGCAAGGCTACAGGTGCATCAACTGCAAACTGCTGGTCCATAAGCGCTGCCA 518
Query 519 CGGCCTCGTCCCGCTGACCTGCAGGAAGCATATGGATTCTGTCATGCCTTCCCAAGAGCCTCCAGTAGACGACA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CGGCCTCGTCCCGCTGACCTGCAGGAAGCATATGGATTCTGTCATGCCTTCCCAAGAGCCTCCAGTAGACGACA 592
Query 593 AGAACGAGGACGCCGACCTTCCTTCCGAGGAGACAGATGGAATTGCTTACATTTCCTCATCCCGGAAGCATGAC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGAACGAGGACGCCGACCTTCCTTCCGAGGAGACAGATGGAATTGCTTACATTTCCTCATCCCGGAAGCATGAC 666
Query 667 AGCATTAAAGACGACTCGGAGGACCTTAAGCCAGTTATCGATGGGATGGATGGAATCAAAATCTCTCAGGGGCT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AGCATTAAAGACGACTCGGAGGACCTTAAGCCAGTTATCGATGGGATGGATGGAATCAAAATCTCTCAGGGGCT 740
Query 741 TGGGCTGCAGGACTTTGACCTAATCAGAGTCATCGGGCGCGGGAGCTACGCCAAGGTTCTCCTGGTGCGGTTGA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGGGCTGCAGGACTTTGACCTAATCAGAGTCATCGGGCGCGGGAGCTACGCCAAGGTTCTCCTGGTGCGGTTGA 814
Query 815 AGAAGAATGACCAAATTTACGCCATGAAAGTGGTGAAGAAAGAGCTGGTGCATGATGACGAGGATATTGACTGG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AGAAGAATGACCAAATTTACGCCATGAAAGTGGTGAAGAAAGAGCTGGTGCATGATGACGAGGATATTGACTGG 888
Query 889 GTACAGACAGAGAAGCACGTGTTTGAGCAGGCATCCAGCAACCCCTTCCTGGTCGGATTACACTCCTGCTTCCA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GTACAGACAGAGAAGCACGTGTTTGAGCAGGCATCCAGCAACCCCTTCCTGGTCGGATTACACTCCTGCTTCCA 962
Query 963 GACGACAAGTC------------------------GGTTGTTCCTGGTCATTGAGTACGTCAACGGCGGGGACC 1012
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GACGACAAGTCGCCTCCGGCGCCTCTCTCCCTGCAGGTTGTTCCTGGTCATTGAGTACGTCAACGGCGGGGACC 1036
Query 1013 TGATGTTCCACATGCAGAGGCAGAGGAAGCTCCCTGAGGAGCACGCCAGGTTCTACGCGGCCGAGATCTGCATC 1086
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGATGTTCCACATGCAGAGGCAGAGGAAGCTCCCTGAGGAGCACGCCAGGTTCTACGCGGCCGAGATCTGCATC 1110
Query 1087 GCCCTCAACTTCCTGCACGAGAGGGGGATCATCTACAGGGACCTGAAGCTGGACAACGTCCTCCTGGATGCGGA 1160
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GCCCTCAACTTCCTGCACGAGAGGGGGATCATCTACAGGGACCTGAAGCTGGACAACGTCCTCCTGGATGCGGA 1184
Query 1161 CGGGCACATCAAGCTCACAGACTACGGCATGTGCAAGGAAGGCCTGGGCCCTGGTGACACAACGAGCACTTTCT 1234
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CGGGCACATCAAGCTCACAGACTACGGCATGTGCAAGGAAGGCCTGGGCCCTGGTGACACAACGAGCACTTTCT 1258
Query 1235 GCGGAACCCCGAATTACATCGCCCCCGAAATCCTGCGGGGAGAGGAGTACGGGTTCAGCGTGGACTGGTGGGCG 1308
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GCGGAACCCCGAATTACATCGCCCCCGAAATCCTGCGGGGAGAGGAGTACGGGTTCAGCGTGGACTGGTGGGCG 1332
Query 1309 CTGGGAGTCCTCATGTTTGAGATGATGGCCGGGCGCTCCCCGTTCGACATCATCACCGACAACCCGGACATGAA 1382
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CTGGGAGTCCTCATGTTTGAGATGATGGCCGGGCGCTCCCCGTTCGACATCATCACCGACAACCCGGACATGAA 1406
Query 1383 CACAGAGGACTACCTTTTCCAAGTGATCCTGGAGAAGCCCATCCGGATCCCCCGGTTCCTGTCCGTCAAAGCCT 1456
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CACAGAGGACTACCTTTTCCAAGTGATCCTGGAGAAGCCCATCCGGATCCCCCGGTTCCTGTCCGTCAAAGCCT 1480
Query 1457 CCCATGTTTTAAAAGGATTTTTAAATAAGGACCCCAAAGAGAGGCTCGGCTGCCGGCCACAGACTGGATTTTCT 1530
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CCCATGTTTTAAAAGGATTTTTAAATAAGGACCCCAAAGAGAGGCTCGGCTGCCGGCCACAGACTGGATTTTCT 1554
Query 1531 GACATCAAGTCCCACGCGTTCTTCCGCAGCATAGACTGGGACTTGCTGGAGAAGAAGCAGGCGCTCCCTCCATT 1604
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1555 GACATCAAGTCCCACGCGTTCTTCCGCAGCATAGACTGGGACTTGATGCA------------------------ 1604
Query 1605 CCAGCCA---CAGAT-CACAGACGACTACGGTCTGGACAACTTTGACACACAGTTCACCAG-CGA---GCCCGT 1670
|||.|| ||||| ||||||| |.|.||||.||.|.||||| |||| ||| |..||.
Sbjct 1605 -CAGACAACTCAGATGCACAGAC-------GCCCGGACGACGTGGACAC--------CCAGACGATGTGGACGC 1662
Query 1671 GCAGCTGAC-------CCCAGACGATGAGGATGC--------CATAAAGA---GGATCGA-----CCAGTCAGA 1721
.|||..||| |.|||||||||.|||||| |.||.|.| |||| || ||| ||||
Sbjct 1663 ACAGACGACATGGACGCACAGACGATGTGGATGCACGGACGACGTAGACACACGGAT-GACTCATCCA--CAGA 1733
Query 1722 GTTCGAAGGCTTTGAGT-ATAT-CA-----ACCCATTATTGCTGTC----------CACCGAGGAGTCGG---- 1774
|||.| |.|| || ||||| |.| |||.||.||..|||
Sbjct 1734 ------------TGACTCAGATGCACGGACACCCA--------GACGACGCGGACGCACAGACGACGCGGACGC 1787
Query 1775 -----TG--------------- 1776
||
Sbjct 1788 ACAGATGACGTGGACGCACAGA 1809