Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_01287
- Subject:
- NM_016700.4
- Aligned Length:
- 1292
- Identities:
- 1057
- Gaps:
- 151
Alignment
Query 1 ATGAGCAGAAGCAAGCGTGACAACAATTTTTATAGTGTAGAGATTGGAGATTCTACATTCACAGTCCTGAAACG 74
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1 ATGAGCAGAAGCAAACGTGACAACAATTTTTATAGTGTAGAGATTGGAGATTCTACATTCACAGTCCTAAAACG 74
Query 75 ATATCAGAATTTAAAACCTATAGGCTCAGGAGCTCAAGGAATAGTATGCGCAGCTTATGATGCCATTCTTGAAA 148
|||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 ATACCAGAATTTAAAGCCTATAGGCTCAGGAGCTCAAGGAATAGTGTGTGCAGCTTATGATGCCATTCTTGAAA 148
Query 149 GAAATGTTGCAATCAAGAAGCTAAGCCGACCATTTCAGAATCAGACTCATGCCAAGCGGGCCTACAGAGAGCTA 222
||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||.||||.|||
Sbjct 149 GAAATGTTGCAATCAAGAAGCTCAGCCGGCCATTTCAGAATCAGACCCATGCTAAGCGCGCCTACCGAGAACTA 222
Query 223 GTTCTTATGAAATGTGTTAATCACAAAAATATAATTGGCCTTTTGAATGTTTTCACACCACAGAAATCCCTAGA 296
|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GTTCTTATGAAGTGTGTTAATCACAAAAATATAATTGGCCTTTTGAATGTTTTCACACCACAGAAATCCCTAGA 296
Query 297 AGAATTTCAAGATGTTTACATAGTCATGGAGCTCATGGATGCAAATCTTTGCCAAGTGATTCAGATGGAGCTAG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 297 AGAATTTCAAGATGTTTACATAGTCATGGAGCTCATGGATGCAAATCTTTGCCAAGTGATTCAGATGGAGTTAG 370
Query 371 ATCATGAAAGAATGTCCTACCTTCTCTATCAGATGCTGTGTGGAATCAAGCACCTTCATTCTGCTGGAATTATT 444
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 371 ATCATGAAAGAATGTCCTACCTTCTCTATCAAATGCTGTGTGGAATCAAGCACCTTCACTCTGCTGGAATTATT 444
Query 445 CATCGGGACTTAAAGCCCAGTAATATAGTAGTAAAATCTGATTGCACTTTGAAGATTCTTGACTTCGGTCTGGC 518
|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||
Sbjct 445 CATCGGGACTTAAAGCCTAGTAATATAGTAGTCAAATCAGACTGCACTTTGAAGATTCTTGATTTTGGACTGGC 518
Query 519 CAGGACTGCAGGAACGAGTTTTATGATGACGCCTTATGTAGTGACTCGCTACTACAGAGCACCCGAGGTCATCC 592
.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 519 GAGGACTGCAGGAACGAGTTTTATGATGACGCCTTATGTGGTGACTCGCTACTACAGAGCACCAGAGGTCATTC 592
Query 593 TTGGCATGGGCTACAAGGAAAACGTTGACATTTGGTCAGTTGGGTGCATCATGGGAGAAATGAT------CAAA 660
|.|||||||||||||||||.|||||.|||.|.|||||.||.||||||||.||||||||||||.| ||||
Sbjct 593 TCGGCATGGGCTACAAGGAGAACGTGGACTTATGGTCTGTGGGGTGCATTATGGGAGAAATGGTTTGCCACAAA 666
Query 661 GGTGGTGTTTTGTTCCCAGGTACAGATCATATTGATCAGTGGAATAAAGTTATTGAACAGCTTGGAACACCATG 734
.|..|.||.|||||.|..||..||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 667 ------ATCCTCTTTCCAGGAAGGGACTATATTGATCAGTGGAATAAAGTTATTGAACAGCTCGGAACACCTTG 734
Query 735 TCCTGAATTCATGAAGAAACTGCAACCAACAGTAAGGACTTACGTTGAAAACAGACCTAAATATGCTGGATATA 808
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 735 TCCTGAATTCATGAAGAAACTACAACCAACAGTAAGGACTTATGTTGAAAACAGGCCTAAATACGCTGGATATA 808
Query 809 GCTTTGAGAAACTCTTCCCTGATGTCCTTTTCCCAGCTGACTCAGAACACAACAAACTTAAAGCCAGTCAGGCA 882
|||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 809 GCTTTGAGAAACTGTTCCCCGATGTGCTTTTCCCAGCTGACTCAGAGCATAACAAACTTAAAGCCAGTCAGGCA 882
Query 883 AGGGATTTGTTATCCAAAATGCTGGTAATAGATGCATCTAAAAGGATCTCTGTAGATGAAGCTCTCCAACACCC 956
||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 883 AGAGATTTGTTATCCAAAATGCTAGTAATAGATGCATCCAAAAGGATCTCCGTAGATGAAGCTCTCCAGCACCC 956
Query 957 GTACATCAATGTCTGGTATGATCCTTCTGAAGCAGAAGCTCCACCACCAAAGATCCCTGACAAGCAGTTAGATG 1030
.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 957 ATACATCAACGTCTGGTATGATCCTTCAGAAGCAGAAGCCCCACCACCAAAGATCCCGGACAAGCAGTTAGATG 1030
Query 1031 AAAGGGAACACACAATAGAAGAGTGGAAAGAATTGATATATAAGGAAGTTATGGACTTGGAGGAGAGAACCAAG 1104
|.|||||.|||||||||||.||||||||||||.|||||||.|||||.||.|||||.||||||||..||||.|||
Sbjct 1031 AGAGGGAGCACACAATAGAGGAGTGGAAAGAACTGATATACAAGGAGGTAATGGATTTGGAGGAACGAACTAAG 1104
Query 1105 AATGGAGTTATACGGGGGCAGCCCTCTCCTTT-----AGGTGCAGCAGTGATCAATGGCTCTCAGCATCCATCA 1173
||||||||.|||.|.||||||||.|||||||| ||||||||||.
Sbjct 1105 AATGGAGTCATAAGAGGGCAGCCGTCTCCTTTAGCACAGGTGCAGCAA-------------------------- 1152
Query 1174 TCATCGTCGTCTGTCAATGATGTGTCTTCAATGTCAACAGATCCGACTTTGGCCTCTGATACAGACAGCAGTCT 1247
Sbjct 1153 -------------------------------------------------------------------------- 1152
Query 1248 AGAAGCAGCAGCTGGGCCTCTGGGCTGCTGTAGA 1281
Sbjct 1153 ---------------------------------- 1152