Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_01287
- Subject:
- XM_017008433.2
- Aligned Length:
- 1291
- Identities:
- 939
- Gaps:
- 95
Alignment
Query 1 ATGAGCAGAAGCAAGCGTGACAACAATTTTTATAGTGTAGAGATTGGAGATTCTACATTCACAGTCCTGAAACG 74
|||||||.||||||...|||||||.|.||.||.|||||.||..|.|||||.||.||.||||||||.||.||.||
Sbjct 1 ATGAGCAAAAGCAAAGTTGACAACCAGTTCTACAGTGTGGAAGTGGGAGACTCAACCTTCACAGTTCTCAAGCG 74
Query 75 ATATCAGAATTTAAAACCTATAGGCTCAGGAGCTCAAGGAATAGTATGCGCAGCTTATGATGCCATTCTTGAAA 148
.||.||||||.||||.|||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||.||.||.||||||||..|.|||||.|
Sbjct 75 CTACCAGAATCTAAAGCCTATTGGCTCTGGGGCTCAGGGCATAGTTTGTGCCGCGTATGATGCTGTCCTTGACA 148
Query 149 GAAATGTTGCAATCAAGAAGCTAAGCCGACCATTTCAGAATCAGACTCATGCCAAGCGGGCCTACAGAGAGCTA 222
|||||||.||.||.||||||||.|||.||||.||||||||.||.||.|||||||||.|.||.|||.|.|||||.
Sbjct 149 GAAATGTGGCCATTAAGAAGCTCAGCAGACCCTTTCAGAACCAAACACATGCCAAGAGAGCGTACCGGGAGCTG 222
Query 223 GTTCTTATGAAATGTGTTAATCACAAAAATATAATTGGCCTTTTGAATGTTTTCACACCACAGAAATCCCTAGA 296
||.||.|||||.|||||.||.||.|||||.||.|||.|..|.||.|||||.||||||||.||||||.|.||.||
Sbjct 223 GTCCTCATGAAGTGTGTGAACCATAAAAACATTATTAGTTTATTAAATGTCTTCACACCCCAGAAAACGCTGGA 296
Query 297 AGAATTTCAAGATGTTTACATAGTCATGGAGCTCATGGATGCAAATCTT-TGCCAAGTGATTCAGATGGAGCTA 369
.||.||.||||||||||||.||||.|||||.||.||||||||.|| ||| ||.|||||||||||||||||..||
Sbjct 297 GGAGTTCCAAGATGTTTACTTAGTAATGGAACTGATGGATGCCAA-CTTATGTCAAGTGATTCAGATGGAATTA 369
Query 370 GATCATGAAAGAATGTCCTACCTTCTCTATCAGATGCTGTGTGGAATCAAGCACCTTCATTCTGCTGGAATTAT 443
||.|||||..|||||||.|||||.||.||.||.|||.|||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 370 GACCATGAGCGAATGTCTTACCTGCTGTACCAAATGTTGTGTGGCATTAAGCACCTCCATTCTGCTGGAATTAT 443
Query 444 TCATCGGGACTTAAAGCCCAGTAATATAGTAGTAAAATCTGATTGCACTTTGAAGATTCTTGACTTCGGTCTGG 517
|||..||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||.||.||||
Sbjct 444 TCACAGGGATTTAAAACCAAGTAACATTGTAGTCAAGTCTGATTGCACATTGAAAATCCTGGACTTTGGACTGG 517
Query 518 CCAGGACTGCAGGAACGAGTTTTATGATGACGCCTTATGTAGTGACTCGCTACTACAGAGCACCCGAGGTCATC 591
|||||||.|||||.||.||.||.||||||||.||.|||||.|||||.||.||.||||||||.||.|||||||||
Sbjct 518 CCAGGACAGCAGGCACAAGCTTCATGATGACTCCATATGTGGTGACACGTTATTACAGAGCCCCTGAGGTCATC 591
Query 592 CTTGGCATGGGCTACAAGGAAAACGTTGACATTTGGTCAGTTGGGTGCATCATGGGAGAAATGATCAAAGGTGG 665
||.||.||||||||||||||.||||
Sbjct 592 CTGGGGATGGGCTACAAGGAGAACG------------------------------------------------- 616
Query 666 TGTTTTGTTCCCAGGTACAGATCATATTGATCAGTGGAATAAAGTTATTGAACAGCTTGGAACACCATGTCCTG 739
|||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||.|
Sbjct 617 -----------------------ATATTGACCAGTGGAATAAGGTAATTGAACAACTAGGAACACCATGTCCAG 667
Query 740 AATTCATGAAGAAACTGCAACCAACAGTAAGGACTTACGTTGAAAACAGACCTAAATATGCTGGATATAGCTTT 813
||||||||||||||.|||||||.||||||||.|..||.||.||.||..|.||.||.|||||.|||...|.|||.
Sbjct 668 AATTCATGAAGAAATTGCAACCCACAGTAAGAAACTATGTGGAGAATCGGCCCAAGTATGCGGGACTCACCTTC 741
Query 814 GAGAAACTCTTCCCTGATGTCCTTTTCCCAGCTGACTCAGAACACAACAAACTTAAAGCCAGTCAGGCAAGGGA 887
...|||||||||||.|||..|||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||.||.||.|||||
Sbjct 742 CCCAAACTCTTCCCAGATTCCCTCTTCCCAGCGGACTCCGAGCACAATAAACTCAAAGCCAGCCAAGCCAGGGA 815
Query 888 TTTGTTATCCAAAATGCTGGTAATAGATGCATCTAAAAGGATCTCTGTAGATGAAGCTCTCCAACACCCGTACA 961
.|||||.||.||.|||||.||.||.||..||.|.|||||.||.||.||.||.||.||..|.||.||.||.||||
Sbjct 816 CTTGTTGTCAAAGATGCTAGTGATTGACCCAGCAAAAAGAATATCAGTGGACGACGCCTTACAGCATCCCTACA 889
Query 962 TCAATGTCTGGTATGATCCTTCTGAAGCAGAAGCTCCACCACCAAAGATCCCTGACAAGCAGTTAGATGAAAGG 1035
||||.|||||||||||.||..|.||||..||.||.||.|||||..||||...||||||||||||.||||||||.
Sbjct 890 TCAACGTCTGGTATGACCCAGCCGAAGTGGAGGCGCCTCCACCTCAGATATATGACAAGCAGTTGGATGAAAGA 963
Query 1036 GAACACACAATAGAAGAGTGGAAAGAATTGATATATAAGGAAGTTATGGACTTGGAGGAGAGAACCAAGAATGG 1109
|||||||||||.|||||.|||||||||.|.||.||.||||||||.|||.|.|..||.||.|..||.||.|||||
Sbjct 964 GAACACACAATTGAAGAATGGAAAGAACTTATCTACAAGGAAGTAATGAATTCAGAAGAAAAGACTAAAAATGG 1037
Query 1110 AGTTATACGGGGGCAGCCCTCTCCTTTAGGTGCAGCAGTGATCAATGGCTCTCAGCA---------TCCATCAT 1174
.||..||...||.|||||.|||||||.|||||||||||||| .||||| |||.||
Sbjct 1038 TGTAGTAAAAGGACAGCCTTCTCCTTCAGGTGCAGCAGTGA----------ACAGCAGTGAGAGTCTCCCTC-- 1099
Query 1175 CATCGTCGTCTGTCAATGATGTGTCTTCAATGTCAACAGATCCGACTTTGGCCTCTGATACAGACAGCAGTCTA 1248
||||.||||||||||||||..|.||.||.|||||.||.||.|.|||..||||.|||||.||.||||||||.||.
Sbjct 1100 CATCCTCGTCTGTCAATGACATCTCCTCCATGTCCACCGACCAGACCCTGGCATCTGACACTGACAGCAGCCTG 1173
Query 1249 GAAGCAGCAGCTGGGCCTCTGGGCTGCTGTAGA 1281
|||||..|.||.||.||.|||||.||.||.||.
Sbjct 1174 GAAGCCTCGGCAGGACCCCTGGGTTGTTGCAGG 1206